297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4281 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_7374  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  63.39 
 
 
725 aa  743    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2338  thiol:disulfide interchange protein, putative  63.84 
 
 
724 aa  667    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.624008  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4281  thiol:disulfide interchange protein, putative  100 
 
 
692 aa  1337    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294342  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4648  thiol:disulfide interchange protein, putative  97.69 
 
 
715 aa  1127    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.938928 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4798  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  89.22 
 
 
709 aa  1046    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.379301  normal  0.840311 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6628  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  61.52 
 
 
734 aa  625  1e-178  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.259984 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0565  thiol:disulfide interchange protein, putative  46.73 
 
 
726 aa  523  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4691  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  43.04 
 
 
738 aa  440  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.937324 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0597  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  42.67 
 
 
704 aa  437  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681901 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2160  hypothetical protein  43.05 
 
 
708 aa  419  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0897  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  38.98 
 
 
745 aa  417  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.588085 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0567  glucan 1,4-alpha-glucosidase  38.95 
 
 
696 aa  406  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0442457  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1489  putative ThiO:disulfide interchange protein  42.57 
 
 
725 aa  388  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1063  thiol:disulfide interchange protein  41.34 
 
 
698 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.382078  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4075  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.83 
 
 
686 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4456  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  40.26 
 
 
755 aa  376  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0867204 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0587  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  41.77 
 
 
798 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0156  thiol-disulfide interchange protein DsbD-like protein  39.2 
 
 
748 aa  372  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2864  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  41.65 
 
 
675 aa  369  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.259358  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0748  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane protein  39.14 
 
 
724 aa  371  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00532426  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0542  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  43.54 
 
 
686 aa  369  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4257  thiol-disulfide interchange protein DsbD-like  40 
 
 
738 aa  360  6e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0730  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  41.74 
 
 
717 aa  358  2.9999999999999997e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2713  thiol:disulfide interchange protein  37.89 
 
 
689 aa  353  5e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2043  thiol-disulfide interchange protein-like protein  36.05 
 
 
701 aa  345  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.476424  normal  0.478834 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1843  thiol-disulfide interchange protein DsbD precursor-like protein  35.04 
 
 
713 aa  338  2.9999999999999997e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0376  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  40.37 
 
 
715 aa  337  3.9999999999999995e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.64367  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_002620  TC0884  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  32.76 
 
 
692 aa  333  9e-90  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.25686  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2791  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  40.64 
 
 
686 aa  329  1.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0043  thiol:disulfide interchange protein  37.37 
 
 
686 aa  310  5e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.391259 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03010  C-type cytochrome biogenesis protein  47.89 
 
 
757 aa  307  4.0000000000000004e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0860  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  39.25 
 
 
409 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3058  putative suppressor for copper-sensitivity B precursor  36.61 
 
 
715 aa  304  4.0000000000000003e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0814  C-type cytochrome biogenesis protein  45.41 
 
 
597 aa  303  8.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3630  C-type cytochrome biogenesis protein (copper tolerance)  48.56 
 
 
794 aa  300  4e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.302281  normal  0.687472 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4055  thiol:disulfide interchange protein DsbD 1 precursor  32.8 
 
 
709 aa  300  8e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3779  thiol:disulfide interchange protein DsbD 1 precursor  32.8 
 
 
709 aa  300  8e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1068  C-type cytochrome family protein  37.84 
 
 
406 aa  296  1e-78  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.876308  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3407  thiol:disulfide interchange protein DsbD  34.14 
 
 
703 aa  289  1e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.325788  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5139  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.21 
 
 
700 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228449  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1689  C-type cytochrome biogenesis protein (copper tolerance)  41.67 
 
 
758 aa  281  2e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1620  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  41.67 
 
 
758 aa  281  3e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0623466  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3390  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  42.96 
 
 
410 aa  273  7e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3854  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  45.85 
 
 
738 aa  268  4e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3127  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  46.37 
 
 
738 aa  266  5.999999999999999e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3550  putative suppressor for copper-sensitivity B precursor  29.39 
 
 
710 aa  263  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003038  membrane protein suppressor for copper-sensitivity ScsB  28.8 
 
 
703 aa  261  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3686  putative suppressor for copper-sensitivity B  33.48 
 
 
702 aa  261  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141878  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02847  hypothetical protein  30.32 
 
 
703 aa  259  8e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0758  putative suppressor for copper-sensitivity B precursor  29.47 
 
 
702 aa  255  1.0000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3005  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.88 
 
 
683 aa  254  5.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.123614  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4225  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.96 
 
 
703 aa  253  6e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4153  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.28 
 
 
703 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00759916  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4357  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.2 
 
 
703 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0114  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.16 
 
 
703 aa  251  3e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.453155  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0343  Thiol:disulfide interchange protein-like protein  30.94 
 
 
776 aa  249  1e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0708911  normal  0.0124228 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3200  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.29 
 
 
685 aa  242  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1073  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  29.9 
 
 
628 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1209  membrane protein suppressor for copper-sensitivity B  29.9 
 
 
628 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.776669  normal  0.266538 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1178  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  29.9 
 
 
628 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1224  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  29.9 
 
 
628 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351874  normal  0.545924 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1189  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  30.04 
 
 
628 aa  231  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.289009  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3607  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.44 
 
 
734 aa  183  8.000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3350  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.93 
 
 
678 aa  176  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1730  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.74 
 
 
600 aa  170  7e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3036  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.44 
 
 
731 aa  162  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0875816 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1301  Thiol:disulfide interchange protein-like  33.05 
 
 
639 aa  154  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1021  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.57 
 
 
671 aa  146  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1990  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.79 
 
 
690 aa  143  9e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0971159  normal  0.236274 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1398  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.56 
 
 
396 aa  125  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.422628  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.02 
 
 
602 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.04 
 
 
611 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3666  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.88 
 
 
628 aa  109  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.162085  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3523  hypothetical protein  38 
 
 
342 aa  108  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.705099  normal  0.300645 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.03 
 
 
609 aa  106  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.3 
 
 
619 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.43 
 
 
619 aa  104  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.51 
 
 
619 aa  103  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.42 
 
 
619 aa  104  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2010  protein-disulfide reductase  30.13 
 
 
649 aa  103  8e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231364 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0520  protein-disulfide reductase  28.57 
 
 
610 aa  102  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00644414  normal  0.263509 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.28 
 
 
610 aa  102  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.7 
 
 
610 aa  102  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0603  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.05 
 
 
672 aa  101  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.827983  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.16 
 
 
613 aa  99.8  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2885  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.9 
 
 
449 aa  100  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.326316 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.42 
 
 
613 aa  100  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.9 
 
 
613 aa  98.2  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1778  protein-disulfide reductase  29.06 
 
 
629 aa  97.4  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1646  hypothetical protein  26.42 
 
 
449 aa  97.1  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3936  protein-disulfide reductase  29.27 
 
 
577 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.327412  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.72 
 
 
604 aa  96.7  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0403  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.44 
 
 
561 aa  96.7  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.471471  hitchhiker  0.00764608 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0538  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.03 
 
 
607 aa  95.5  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.126162  decreased coverage  0.00471183 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3915  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.11 
 
 
613 aa  95.1  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0416  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.65 
 
 
624 aa  94.4  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136243  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.64 
 
 
608 aa  94.4  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0323  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.81 
 
 
563 aa  93.6  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000046864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0545  thiol:disulfide interchange protein DsbD  30.24 
 
 
616 aa  93.2  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.221768  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3876  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.37 
 
 
565 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>