298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0758 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02847  hypothetical protein  51.45 
 
 
703 aa  718    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4153  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  50.14 
 
 
703 aa  654    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00759916  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0114  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  49.43 
 
 
703 aa  649    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.453155  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003038  membrane protein suppressor for copper-sensitivity ScsB  50.14 
 
 
703 aa  710    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4357  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  50.14 
 
 
703 aa  656    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3200  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  51.37 
 
 
685 aa  674    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0758  putative suppressor for copper-sensitivity B precursor  100 
 
 
702 aa  1427    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3550  putative suppressor for copper-sensitivity B precursor  49.93 
 
 
710 aa  642    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4225  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  50.14 
 
 
703 aa  655    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3005  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  51.16 
 
 
683 aa  691    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.123614  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3607  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  48.88 
 
 
734 aa  622  1e-177  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1178  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  40.93 
 
 
628 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1209  membrane protein suppressor for copper-sensitivity B  40.78 
 
 
628 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.776669  normal  0.266538 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1224  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  40.78 
 
 
628 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351874  normal  0.545924 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1073  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  40.93 
 
 
628 aa  488  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1189  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  41.08 
 
 
628 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.289009  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3350  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  42.07 
 
 
678 aa  483  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4055  thiol:disulfide interchange protein DsbD 1 precursor  38.88 
 
 
709 aa  441  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3779  thiol:disulfide interchange protein DsbD 1 precursor  38.88 
 
 
709 aa  441  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3407  thiol:disulfide interchange protein DsbD  38.02 
 
 
703 aa  414  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.325788  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3058  putative suppressor for copper-sensitivity B precursor  36.1 
 
 
715 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3686  putative suppressor for copper-sensitivity B  35.58 
 
 
702 aa  362  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141878  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5139  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.1 
 
 
700 aa  347  5e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228449  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2043  thiol-disulfide interchange protein-like protein  29.88 
 
 
701 aa  291  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.476424  normal  0.478834 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1843  thiol-disulfide interchange protein DsbD precursor-like protein  31.2 
 
 
713 aa  281  2e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0567  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.63 
 
 
696 aa  251  3e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0442457  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_002620  TC0884  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  29.76 
 
 
692 aa  242  2e-62  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.25686  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7374  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.88 
 
 
725 aa  232  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0897  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  27.71 
 
 
745 aa  228  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.588085 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0597  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.74 
 
 
704 aa  225  2e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681901 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0565  thiol:disulfide interchange protein, putative  26.97 
 
 
726 aa  223  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0587  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.51 
 
 
798 aa  220  7.999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4798  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.45 
 
 
709 aa  205  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.379301  normal  0.840311 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4075  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.82 
 
 
686 aa  204  4e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2160  hypothetical protein  28.12 
 
 
708 aa  203  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4456  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.92 
 
 
755 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0867204 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2338  thiol:disulfide interchange protein, putative  29.62 
 
 
724 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.624008  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4281  thiol:disulfide interchange protein, putative  33.94 
 
 
692 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294342  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0814  C-type cytochrome biogenesis protein  32.33 
 
 
597 aa  197  4.0000000000000005e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4648  thiol:disulfide interchange protein, putative  33.94 
 
 
715 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.938928 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1489  putative ThiO:disulfide interchange protein  34.01 
 
 
725 aa  197  8.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0860  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.64 
 
 
409 aa  194  4e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1620  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.13 
 
 
758 aa  190  9e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0623466  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4691  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.79 
 
 
738 aa  189  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.937324 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1689  C-type cytochrome biogenesis protein (copper tolerance)  31.7 
 
 
758 aa  188  3e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1063  thiol:disulfide interchange protein  25.4 
 
 
698 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.382078  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1068  C-type cytochrome family protein  31.37 
 
 
406 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.876308  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03010  C-type cytochrome biogenesis protein  33.16 
 
 
757 aa  185  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0156  thiol-disulfide interchange protein DsbD-like protein  32.3 
 
 
748 aa  182  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4257  thiol-disulfide interchange protein DsbD-like  33.91 
 
 
738 aa  182  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2864  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.29 
 
 
675 aa  181  4.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.259358  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0043  thiol:disulfide interchange protein  28.77 
 
 
686 aa  177  6e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.391259 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2713  thiol:disulfide interchange protein  29.04 
 
 
689 aa  177  6e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0343  Thiol:disulfide interchange protein-like protein  25.67 
 
 
776 aa  177  8e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0708911  normal  0.0124228 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3127  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.07 
 
 
738 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3630  C-type cytochrome biogenesis protein (copper tolerance)  31.89 
 
 
794 aa  176  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.302281  normal  0.687472 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3854  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.16 
 
 
738 aa  170  8e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6628  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.22 
 
 
734 aa  169  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.259984 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0748  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane protein  30.3 
 
 
724 aa  169  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00532426  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2791  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.31 
 
 
686 aa  168  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3390  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.33 
 
 
410 aa  164  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0376  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.55 
 
 
715 aa  160  5e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.64367  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0730  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.63 
 
 
717 aa  160  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0542  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.92 
 
 
686 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1730  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.11 
 
 
600 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1990  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.72 
 
 
690 aa  139  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0971159  normal  0.236274 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1301  Thiol:disulfide interchange protein-like  28.93 
 
 
639 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3036  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.61 
 
 
731 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0875816 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2056  divalent cation transporter  30.09 
 
 
575 aa  128  4.0000000000000003e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000288452  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1398  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.63 
 
 
396 aa  121  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.422628  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0906  thiol:disulfide interchange protein DsbD  27.96 
 
 
563 aa  118  3.9999999999999997e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.664459  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  28.72 
 
 
630 aa  118  5e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0225  hypothetical protein  39.1 
 
 
265 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.120044  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3319  thiol:disulfide interchange protein, putative  39.22 
 
 
180 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0145  cytochrome C biogenesis protein transmembrane region  26.33 
 
 
570 aa  111  4.0000000000000004e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1000  hypothetical protein  41.03 
 
 
265 aa  108  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3095  thiol:disulfide interchange protein, putative  36.42 
 
 
177 aa  108  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.24 
 
 
608 aa  108  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2660  hypothetical protein  42.06 
 
 
265 aa  108  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.857145  normal  0.753629 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0631  thiol:disulfide interchange protein DsbD  26.67 
 
 
567 aa  106  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0980  thiol:disulfide interchange protein DsbD (protein-disulfide reductase) (disulfide reductase)  26.59 
 
 
574 aa  106  2e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0706  thiol:disulfide interchange protein DsbD  26.19 
 
 
567 aa  105  4e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.760098  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3080  thiol:disulfide interchange protein, putative  46.36 
 
 
179 aa  104  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.94 
 
 
611 aa  103  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3330  thiol:disulfide interchange protein, putative  36.71 
 
 
183 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1062  thiol:disulfide interchange protein, putative  36.71 
 
 
183 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03921  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.38 
 
 
631 aa  103  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.61 
 
 
789 aa  103  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1029  thiol:disulfide interchange protein, putative  36.71 
 
 
183 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.357817  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.82 
 
 
586 aa  103  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0636  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.25 
 
 
466 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.619274 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3134  thiol:disulfide interchange protein, putative  36.42 
 
 
181 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3226  thiol:disulfide interchange protein, putative  36.42 
 
 
181 aa  102  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.291039  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0960  thiol:disulfide interchange protein, putative  36.71 
 
 
183 aa  101  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1778  protein-disulfide reductase  26.54 
 
 
629 aa  101  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2592  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.33 
 
 
654 aa  101  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2382  Protein-disulfide reductase  23.33 
 
 
581 aa  101  6e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  7.870920000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0446  protein-disulfide reductase  27.93 
 
 
731 aa  100  7e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0973  thiol:disulfide interchange protein, putative  35.67 
 
 
199 aa  100  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.156553  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2811  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.98 
 
 
624 aa  100  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>