More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4648 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_4281  thiol:disulfide interchange protein, putative  97.69 
 
 
692 aa  1122    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294342  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7374  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  62.66 
 
 
725 aa  734    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4798  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  89.39 
 
 
709 aa  1058    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.379301  normal  0.840311 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2338  thiol:disulfide interchange protein, putative  63.69 
 
 
724 aa  664    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.624008  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4648  thiol:disulfide interchange protein, putative  100 
 
 
715 aa  1378    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.938928 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6628  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  61.09 
 
 
734 aa  621  1e-176  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.259984 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0565  thiol:disulfide interchange protein, putative  46.46 
 
 
726 aa  517  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4691  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  43.04 
 
 
738 aa  438  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.937324 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0597  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  42.08 
 
 
704 aa  435  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681901 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2160  hypothetical protein  43.79 
 
 
708 aa  419  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0897  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  38.16 
 
 
745 aa  414  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.588085 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0567  glucan 1,4-alpha-glucosidase  37.12 
 
 
696 aa  405  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0442457  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4456  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  41.02 
 
 
755 aa  386  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0867204 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4075  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.29 
 
 
686 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1063  thiol:disulfide interchange protein  39.91 
 
 
698 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.382078  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1489  putative ThiO:disulfide interchange protein  41.61 
 
 
725 aa  378  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2864  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  42.41 
 
 
675 aa  372  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.259358  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0587  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  41.71 
 
 
798 aa  373  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0156  thiol-disulfide interchange protein DsbD-like protein  38.74 
 
 
748 aa  372  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0748  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane protein  38.64 
 
 
724 aa  371  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00532426  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0542  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  43.68 
 
 
686 aa  366  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3127  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  41.19 
 
 
738 aa  363  4e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3854  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  41.19 
 
 
738 aa  362  1e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4257  thiol-disulfide interchange protein DsbD-like  39.86 
 
 
738 aa  359  9.999999999999999e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2713  thiol:disulfide interchange protein  38.24 
 
 
689 aa  357  5.999999999999999e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0730  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  41.6 
 
 
717 aa  356  7.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2043  thiol-disulfide interchange protein-like protein  36.01 
 
 
701 aa  341  2e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.476424  normal  0.478834 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0376  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  39.84 
 
 
715 aa  339  9e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.64367  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1843  thiol-disulfide interchange protein DsbD precursor-like protein  34.65 
 
 
713 aa  335  2e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2791  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  41.13 
 
 
686 aa  331  2e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0884  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  32.76 
 
 
692 aa  329  1.0000000000000001e-88  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.25686  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03010  C-type cytochrome biogenesis protein  48.16 
 
 
757 aa  307  3e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0860  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  39.65 
 
 
409 aa  303  6.000000000000001e-81  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0814  C-type cytochrome biogenesis protein  44.19 
 
 
597 aa  303  7.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3058  putative suppressor for copper-sensitivity B precursor  36.67 
 
 
715 aa  303  9e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3779  thiol:disulfide interchange protein DsbD 1 precursor  32.65 
 
 
709 aa  302  2e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4055  thiol:disulfide interchange protein DsbD 1 precursor  32.65 
 
 
709 aa  302  2e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3630  C-type cytochrome biogenesis protein (copper tolerance)  48.56 
 
 
794 aa  300  5e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.302281  normal  0.687472 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1068  C-type cytochrome family protein  37.84 
 
 
406 aa  295  2e-78  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.876308  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3407  thiol:disulfide interchange protein DsbD  33.88 
 
 
703 aa  295  2e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.325788  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5139  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.36 
 
 
700 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228449  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1620  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  42.31 
 
 
758 aa  283  9e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0623466  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1689  C-type cytochrome biogenesis protein (copper tolerance)  42.31 
 
 
758 aa  283  1e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3390  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  42.71 
 
 
410 aa  271  2.9999999999999997e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3686  putative suppressor for copper-sensitivity B  33.43 
 
 
702 aa  264  4.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141878  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3550  putative suppressor for copper-sensitivity B precursor  29.36 
 
 
710 aa  261  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003038  membrane protein suppressor for copper-sensitivity ScsB  28.57 
 
 
703 aa  260  5.0000000000000005e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02847  hypothetical protein  29.69 
 
 
703 aa  257  4e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3005  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.61 
 
 
683 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.123614  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4153  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.53 
 
 
703 aa  254  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00759916  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4357  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.45 
 
 
703 aa  253  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0343  Thiol:disulfide interchange protein-like protein  30.59 
 
 
776 aa  253  1e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0708911  normal  0.0124228 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0114  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.5 
 
 
703 aa  252  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.453155  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4225  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.01 
 
 
703 aa  252  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0758  putative suppressor for copper-sensitivity B precursor  29.09 
 
 
702 aa  251  3e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0043  thiol:disulfide interchange protein  34.78 
 
 
686 aa  248  2e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.391259 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3200  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.25 
 
 
685 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1224  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  30 
 
 
628 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351874  normal  0.545924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1209  membrane protein suppressor for copper-sensitivity B  30 
 
 
628 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.776669  normal  0.266538 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1073  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  30 
 
 
628 aa  239  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1178  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  29.86 
 
 
628 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1189  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  30 
 
 
628 aa  239  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.289009  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3607  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.18 
 
 
734 aa  180  7e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3350  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.46 
 
 
678 aa  177  8e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1730  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.39 
 
 
600 aa  170  7e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3036  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.34 
 
 
731 aa  158  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0875816 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1301  Thiol:disulfide interchange protein-like  32.76 
 
 
639 aa  151  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1990  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.51 
 
 
690 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0971159  normal  0.236274 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1021  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.12 
 
 
671 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1398  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.42 
 
 
396 aa  124  8e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.422628  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3523  hypothetical protein  37.19 
 
 
342 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.705099  normal  0.300645 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3666  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.31 
 
 
628 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.162085  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.72 
 
 
611 aa  111  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.68 
 
 
609 aa  109  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.56 
 
 
602 aa  107  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2010  protein-disulfide reductase  29.91 
 
 
649 aa  106  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231364 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.85 
 
 
619 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.23 
 
 
619 aa  106  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.48 
 
 
619 aa  105  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.05 
 
 
610 aa  104  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0520  protein-disulfide reductase  28.57 
 
 
610 aa  104  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00644414  normal  0.263509 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.92 
 
 
619 aa  104  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0603  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.05 
 
 
672 aa  103  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.827983  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.01 
 
 
610 aa  103  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2885  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.03 
 
 
449 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.326316 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.11 
 
 
613 aa  100  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.67 
 
 
810 aa  98.6  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.6 
 
 
604 aa  98.2  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.16 
 
 
613 aa  98.6  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.14 
 
 
613 aa  98.2  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1646  hypothetical protein  26.94 
 
 
449 aa  97.8  6e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3936  protein-disulfide reductase  29.51 
 
 
577 aa  97.8  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.327412  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.39 
 
 
608 aa  97.1  9e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.38 
 
 
586 aa  97.1  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0403  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.53 
 
 
561 aa  97.1  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.471471  hitchhiker  0.00764608 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0538  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.28 
 
 
607 aa  97.1  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.126162  decreased coverage  0.00471183 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0416  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.07 
 
 
624 aa  96.3  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136243  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0022  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.33 
 
 
614 aa  95.9  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1778  protein-disulfide reductase  28.12 
 
 
629 aa  95.9  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.91 
 
 
789 aa  95.5  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>