67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3523 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3523  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  661    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.705099  normal  0.300645 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2338  thiol:disulfide interchange protein, putative  49.63 
 
 		 724 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.624008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4648  thiol:disulfide interchange protein, putative  38.61 
 
 		 715 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.938928 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0156  thiol-disulfide interchange protein DsbD-like protein  40.48 
 
 		 748 aa  117  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0565  thiol:disulfide interchange protein, putative  38.61 
 
 		 726 aa  116  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0897  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  41.14 
 
 		 745 aa  115  8.999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588085 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4798  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.38 
 
 		 709 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.379301  normal  0.840311 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1489  putative ThiO:disulfide interchange protein  43.41 
 
 		 725 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4281  thiol:disulfide interchange protein, putative  38.24 
 
 		 692 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0597  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  40.3 
 
 		 704 aa  108  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681901 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0587  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  39.07 
 
 		 798 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3854  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  39.16 
 
 		 738 aa  103  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0376  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.27 
 
 		 715 aa  103  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.64367  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4456  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.72 
 
 		 755 aa  102  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0867204 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3127  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.46 
 
 		 738 aa  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0730  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  40.48 
 
 		 717 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4691  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  40.44 
 
 		 738 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.937324 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0748  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane protein  37.5 
 
 		 724 aa  95.9  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00532426  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7374  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.23 
 
 		 725 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6628  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.57 
 
 		 734 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.259984 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4257  thiol-disulfide interchange protein DsbD-like  37.12 
 
 		 738 aa  88.6  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2713  thiol:disulfide interchange protein  32.08 
 
 		 689 aa  87  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0542  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.66 
 
 		 686 aa  86.3  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0043  thiol:disulfide interchange protein  34.97 
 
 		 686 aa  80.1  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.391259 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2043  thiol-disulfide interchange protein-like protein  34.53 
 
 		 701 aa  79.3  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.476424  normal  0.478834 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1063  thiol:disulfide interchange protein  33.97 
 
 		 698 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.382078  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1843  thiol-disulfide interchange protein DsbD precursor-like protein  31.58 
 
 		 713 aa  77.8  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2160  hypothetical protein  38.93 
 
 		 708 aa  77  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2864  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  36.36 
 
 		 675 aa  75.5  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.259358  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2791  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.75 
 
 		 686 aa  75.9  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0884  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  31.58 
 
 		 692 aa  75.5  0.000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.25686  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4075  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.3 
 
 		 686 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0567  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.45 
 
 		 696 aa  70.5  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0442457  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3407  thiol:disulfide interchange protein DsbD  32.31 
 
 		 703 aa  63.2  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.325788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5139  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.84 
 
 		 700 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0660  hypothetical protein  32.33 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.125463 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0484  ribosomal protein S7  30.58 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0479  hypothetical protein  30.58 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3897  hypothetical protein  36.36 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.222076 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3058  putative suppressor for copper-sensitivity B precursor  29.94 
 
 		 715 aa  57.4  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0682  hypothetical protein  34 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4055  thiol:disulfide interchange protein DsbD 1 precursor  28.83 
 
 		 709 aa  56.6  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3779  thiol:disulfide interchange protein DsbD 1 precursor  28.83 
 
 		 709 aa  56.6  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0618  hypothetical protein  31.58 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.922972 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0531  hypothetical protein  32.14 
 
 		 282 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2595  hypothetical protein  30.48 
 
 		 287 aa  55.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0593  hypothetical protein  26.67 
 
 		 266 aa  53.9  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6967  hypothetical protein  29.23 
 
 		 279 aa  53.1  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.364355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1256  hypothetical protein  30.77 
 
 		 316 aa  52.8  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4349  hypothetical protein  27.78 
 
 		 277 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2660  hypothetical protein  31.09 
 
 		 265 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.857145  normal  0.753629 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1000  hypothetical protein  31.09 
 
 		 265 aa  50.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0225  hypothetical protein  28.45 
 
 		 265 aa  49.7  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.120044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4503  hypothetical protein  28.85 
 
 		 275 aa  49.7  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.217777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0787  hypothetical protein  27.88 
 
 		 277 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0437  hypothetical protein  33.33 
 
 		 260 aa  48.5  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3686  putative suppressor for copper-sensitivity B  26.75 
 
 		 702 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3551  hypothetical protein  26.92 
 
 		 280 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.957801  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2753  hypothetical protein  25.26 
 
 		 280 aa  47.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.152909  normal  0.694513 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0982  hypothetical protein  26.32 
 
 		 277 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.809906  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0752  hypothetical protein  29.29 
 
 		 267 aa  47  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.912911  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6934  hypothetical protein  32.32 
 
 		 291 aa  47  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3607  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.06 
 
 		 734 aa  45.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0343  Thiol:disulfide interchange protein-like protein  24.36 
 
 		 776 aa  44.7  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0708911  normal  0.0124228 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6267  hypothetical protein  30.3 
 
 		 301 aa  43.9  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38552  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0242  hypothetical protein  29.59 
 
 		 169 aa  43.9  0.004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3068  hypothetical protein  28.12 
 
 		 261 aa  42.7  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.893095  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>