More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0131 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0131  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 149 aa  307  2.9999999999999997e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000222115  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2029  hypothetical protein  28.36 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.213181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0427  hypothetical protein  29.71 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00405131  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0822  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  30.19 
 
 		 590 aa  77  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0928635  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0217  protein of unknown function DUF255  30.19 
 
 		 517 aa  75.1  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2821  hypothetical protein  30.77 
 
 		 569 aa  75.1  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.642839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0517  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  33.91 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00166074  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0182  conserved hypothetical protein, secreted  27.33 
 
 		 183 aa  70.1  0.000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1855  protein of unknown function DUF255  28.12 
 
 		 172 aa  67  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4103  protein of unknown function DUF255  24.69 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.57841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4487  Thioredoxin-related protein-like protein  25.18 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000975236  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0496  hypothetical protein  31.39 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2780  thioredoxin-related protein-like protein  29.63 
 
 		 391 aa  64.3  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0175859  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1900  hypothetical protein  29.73 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0426  hypothetical protein  25.53 
 
 		 174 aa  63.5  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0272126  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7116  thioredoxin domain protein  29.8 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0806  protein of unknown function DUF255  28.21 
 
 		 274 aa  62  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.862822  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1802  Thioredoxin domain protein  29.17 
 
 		 596 aa  62  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.868278  hitchhiker  0.0000561667 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2384  hypothetical protein  28.18 
 
 		 705 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249366  normal  0.331232 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3953  Thioredoxin domain  28 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0805  Thioredoxin domain protein  24.14 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1204  hypothetical protein  30.68 
 
 		 661 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.139299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0388  Thioredoxin domain protein  31.78 
 
 		 466 aa  58.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.848154 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1456  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  33.72 
 
 		 406 aa  57.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2401  hypothetical protein  34.48 
 
 		 706 aa  57.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000573334  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3456  sulfur oxidation protein SoxY  29.66 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0927  hypothetical protein  29.35 
 
 		 154 aa  57  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.119484  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2038  Thioredoxin domain protein  29.76 
 
 		 357 aa  56.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.571694  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0084  thiol:disulfide interchange protein precursor  33 
 
 		 592 aa  56.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0377  thioredoxin-related protein  27.56 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719942  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6051  thioredoxin domain protein  28.28 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0119737  normal  0.502924 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0491  protein of unknown function DUF255  29.57 
 
 		 549 aa  55.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1315  hypothetical protein  30 
 
 		 687 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.529434  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002212  cytochrome c-type biogenesis protein DsbD protein-disulfide reductase  28.85 
 
 		 603 aa  55.1  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1191  hypothetical protein  31.11 
 
 		 675 aa  54.7  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0291  hypothetical protein  32.39 
 
 		 680 aa  54.7  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0898  protein-disulfide reductase  36.56 
 
 		 589 aa  54.7  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1471  thioredoxin  26.85 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000657673  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1424  hypothetical protein  29 
 
 		 593 aa  54.3  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0491  protein of unknown function DUF255  27.69 
 
 		 682 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2274  protein of unknown function DUF255  28.44 
 
 		 552 aa  54.3  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0293  protein of unknown function DUF255  27.42 
 
 		 839 aa  54.3  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2549  hypothetical protein  30.43 
 
 		 694 aa  53.9  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282595  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0938  protein of unknown function DUF255  29.91 
 
 		 687 aa  53.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2885  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.33 
 
 		 449 aa  53.9  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.326316 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4066  Thioredoxin domain protein  26.89 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0588  hypothetical protein  25 
 
 		 692 aa  53.1  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.155052  normal  0.0633893 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03921  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.57 
 
 		 631 aa  53.5  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.08 
 
 		 810 aa  53.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0486  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  26.17 
 
 		 176 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0787  protein of unknown function DUF255  29.89 
 
 		 686 aa  53.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0979  protein of unknown function DUF255  24.79 
 
 		 536 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.571094  normal  0.95271 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04810  hypothetical protein  20.95 
 
 		 179 aa  52.4  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.543485  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0545  hypothetical protein  26.56 
 
 		 711 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.322459 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0543  hypothetical protein  31.51 
 
 		 703 aa  52.4  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0277  protein of unknown function DUF255  26.67 
 
 		 531 aa  52  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.137816  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2043  hypothetical protein  28.42 
 
 		 610 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0897  hypothetical protein  29.49 
 
 		 644 aa  51.6  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1665  hypothetical protein  31.11 
 
 		 752 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.590351  hitchhiker  0.000463934 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0863  hypothetical protein  26.56 
 
 		 693 aa  52  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.477469  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1171  hypothetical protein  28.18 
 
 		 756 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.872428  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0787  hypothetical protein  26.21 
 
 		 650 aa  52  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.86498  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1723  protein of unknown function DUF255  31.11 
 
 		 665 aa  51.6  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0507  protein of unknown function DUF255  28.91 
 
 		 717 aa  51.6  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.056256  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2364  Thioredoxin domain protein  30.53 
 
 		 465 aa  51.2  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0296  protein-disulfide reductase  30.53 
 
 		 611 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.58017  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2279  hypothetical protein  27.66 
 
 		 700 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0959  protein of unknown function DUF255  27.78 
 
 		 686 aa  51.2  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1697  hypothetical protein  24.14 
 
 		 669 aa  51.2  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0345  hypothetical protein  25.35 
 
 		 700 aa  50.8  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.308049  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  31.78 
 
 		 586 aa  50.8  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1409  protein of unknown function DUF255  31.94 
 
 		 581 aa  50.4  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1171  hypothetical protein  32.84 
 
 		 660 aa  50.4  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11330  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  29.58 
 
 		 691 aa  50.4  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.234255  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1041  hypothetical protein  26 
 
 		 681 aa  50.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0356  protein-disulfide reductase  29.47 
 
 		 615 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2856  hypothetical protein  28.42 
 
 		 144 aa  50.1  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0871  hypothetical protein  28.81 
 
 		 699 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3335  protein of unknown function DUF255  30 
 
 		 699 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000801567  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1630  hypothetical protein  33.8 
 
 		 751 aa  50.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0305  protein-disulfide reductase  29.47 
 
 		 611 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.069977 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3476  protein-disulfide reductase  29.47 
 
 		 617 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.842688 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1111  protein of unknown function DUF255  31.51 
 
 		 699 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.992934  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0929  hypothetical protein  25.76 
 
 		 699 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.991859  normal  0.115087 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0166  hypothetical protein  27.71 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3622  hypothetical protein  27.59 
 
 		 680 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.250871  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2205  hypothetical protein  21.82 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0215  protein of unknown function DUF255  29.58 
 
 		 673 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0364  thioredoxin  27.78 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3507  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  30.53 
 
 		 627 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.456139  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2142  thioredoxin-related protein  26 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3747  thiol:disulfide interchange protein DsbD  30.53 
 
 		 627 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.14193  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1953  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  30.53 
 
 		 627 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.684775  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0081  protein-disulfide reductase  30.48 
 
 		 558 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2848  hypothetical protein  24.24 
 
 		 381 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3717  thiol:disulfide interchange protein, putative  30.53 
 
 		 627 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2773  Protein-disulfide reductase  35.29 
 
 		 632 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2324  hypothetical protein  28.95 
 
 		 721 aa  49.3  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3140  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  30.53 
 
 		 627 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2363  hypothetical protein  22.88 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  normal  0.435541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>