169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1471 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1471  thioredoxin  100 
 
 		 137 aa  282  1.0000000000000001e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000657673  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2856  hypothetical protein  32.64 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3456  sulfur oxidation protein SoxY  32.21 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  33 
 
 		 630 aa  61.2  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1913  thiol:disulfide interchange protein DsbD  33 
 
 		 489 aa  60.5  0.000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00493276  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2559  thiol:disulfide interchange protein DsbD  34.02 
 
 		 752 aa  60.1  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.745294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0364  thioredoxin  32 
 
 		 146 aa  57  0.00000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0427  hypothetical protein  30.34 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00405131  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2773  Protein-disulfide reductase  34.41 
 
 		 632 aa  55.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  35.29 
 
 		 586 aa  55.1  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0081  protein-disulfide reductase  31.13 
 
 		 558 aa  55.1  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.42 
 
 		 810 aa  55.1  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3681  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.65 
 
 		 595 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.576987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0728  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.65 
 
 		 595 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3828  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.65 
 
 		 595 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368823  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  35.24 
 
 		 586 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  31.58 
 
 		 623 aa  54.7  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0131  thioredoxin domain-containing protein  26.85 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000222115  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1312  Protein-disulfide reductase  34.02 
 
 		 625 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0091784  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2921  Protein-disulfide reductase  30.21 
 
 		 604 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351714 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0517  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  28.04 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00166074  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0061  thioredoxin-related protein-like protein  29.1 
 
 		 349 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0898  protein-disulfide reductase  36.84 
 
 		 589 aa  52.8  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3615  Protein-disulfide reductase  29.17 
 
 		 626 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573017  hitchhiker  0.0000000193428 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2990  thiol:disulfide interchange transmembrane protein  27.72 
 
 		 608 aa  51.6  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0591  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region/thioredoxin-related  27.68 
 
 		 471 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.945166  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0486  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  22.99 
 
 		 176 aa  51.6  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0145  cytochrome C biogenesis protein transmembrane region  28.97 
 
 		 570 aa  52  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2811  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.66 
 
 		 624 aa  52  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0278  protein-disulfide reductase  28.57 
 
 		 614 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.108061 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0323  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.53 
 
 		 563 aa  51.6  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046864 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.91 
 
 		 789 aa  51.2  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3915  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.78 
 
 		 613 aa  51.6  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4741  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.53 
 
 		 567 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3268  Protein-disulfide reductase  29.17 
 
 		 605 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0181869 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  28.85 
 
 		 627 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3747  thiol:disulfide interchange protein DsbD  28.85 
 
 		 627 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.14193  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3476  protein-disulfide reductase  28.57 
 
 		 617 aa  50.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.842688 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3140  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  28.85 
 
 		 627 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1953  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  28.85 
 
 		 627 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.684775  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3717  thiol:disulfide interchange protein, putative  28.85 
 
 		 627 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3507  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  28.85 
 
 		 627 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.456139  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4593  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.53 
 
 		 567 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.610696 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0551  thioredoxin-related protein-like protein  28.06 
 
 		 223 aa  50.4  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4719  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.53 
 
 		 567 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0129572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0636  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.44 
 
 		 466 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.619274 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1055  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.57 
 
 		 626 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000114598  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2730  protein-disulfide reductase  28.57 
 
 		 615 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0377  protein-disulfide reductase  28.57 
 
 		 615 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3775  thiol:disulfide interchange protein, putative  28.85 
 
 		 627 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2010  protein-disulfide reductase  31.52 
 
 		 649 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231364 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6280  protein-disulfide reductase  35.14 
 
 		 623 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.432431 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0356  protein-disulfide reductase  28.57 
 
 		 615 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0079  Protein-disulfide reductase  31.96 
 
 		 557 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000987227 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0388  Thioredoxin domain protein  30 
 
 		 466 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.848154 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1568  protein-disulfide reductase  29.7 
 
 		 622 aa  48.9  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.314287  normal  0.0195641 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3506  protein-disulfide reductase  24.49 
 
 		 642 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2885  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.33 
 
 		 449 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.326316 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0305  protein-disulfide reductase  27.55 
 
 		 611 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.069977 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0906  thiol:disulfide interchange protein DsbD  34.57 
 
 		 563 aa  49.3  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.664459  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1683  thiol:disulfide interchange protein DsbD  28.57 
 
 		 624 aa  48.9  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.424941  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2810  protein-disulfide reductase  30.53 
 
 		 618 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126387  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0296  protein-disulfide reductase  27.55 
 
 		 611 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.58017  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4601  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.21 
 
 		 567 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3415  disulfide reductase  26.32 
 
 		 623 aa  48.9  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4684  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.21 
 
 		 567 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.25 
 
 		 586 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2780  thioredoxin-related protein-like protein  26.13 
 
 		 391 aa  47.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0175859  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0853  thioredoxin-related protein-like protein  28.7 
 
 		 224 aa  47.8  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000618782  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0403  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.67 
 
 		 561 aa  47.4  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.471471  hitchhiker  0.00764608 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0805  Thioredoxin domain protein  31.25 
 
 		 270 aa  47.4  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0343  protein-disulfide reductase  28.12 
 
 		 631 aa  47  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0138358 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5366  Protein-disulfide reductase  29.17 
 
 		 648 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0545  hypothetical protein  26.72 
 
 		 711 aa  46.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.322459 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04006  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.78 
 
 		 565 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3856  Protein-disulfide reductase  33.78 
 
 		 565 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0426  hypothetical protein  22.64 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0272126  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3288  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.08 
 
 		 624 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5652  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.78 
 
 		 565 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390549  normal  0.76636 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1636  Thiol:disulfide interchange protein-like protein  25.93 
 
 		 176 aa  45.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03968  hypothetical protein  33.78 
 
 		 565 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4377  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.78 
 
 		 565 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111987  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4691  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.78 
 
 		 565 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3876  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.78 
 
 		 565 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4605  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.78 
 
 		 565 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0011627  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2683  protein-disulfide reductase  26.92 
 
 		 654 aa  45.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4360  thiol:disulfide interchange protein  26.73 
 
 		 603 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0322676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1262  Thioredoxin domain  30.19 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000573175  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4244  protein-disulfide reductase  26.73 
 
 		 600 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0491  protein of unknown function DUF255  25 
 
 		 682 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4665  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.43 
 
 		 565 aa  45.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.836853  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0787  hypothetical protein  26 
 
 		 650 aa  45.4  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.86498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2274  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.65 
 
 		 600 aa  44.7  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0979  protein of unknown function DUF255  27.66 
 
 		 536 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.571094  normal  0.95271 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2142  thioredoxin-related protein  25.89 
 
 		 163 aa  44.3  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0446  protein-disulfide reductase  31.4 
 
 		 731 aa  44.3  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1802  Thioredoxin domain protein  29.13 
 
 		 596 aa  44.3  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.868278  hitchhiker  0.0000561667 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0980  thiol:disulfide interchange protein DsbD (protein-disulfide reductase) (disulfide reductase)  30.69 
 
 		 574 aa  44.7  0.0005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2056  divalent cation transporter  27.19 
 
 		 575 aa  44.3  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000288452  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0496  hypothetical protein  25.66 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>