163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2848 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2848  hypothetical protein  100 
 
 
381 aa  789    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2759  protein of unknown function DUF255  60.81 
 
 
756 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0261  hypothetical protein  53.7 
 
 
711 aa  435  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0787  protein of unknown function DUF255  51.31 
 
 
686 aa  437  1e-121  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1111  protein of unknown function DUF255  55.32 
 
 
699 aa  430  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.992934  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2324  hypothetical protein  54.79 
 
 
721 aa  427  1e-118  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2853  hypothetical protein  52.63 
 
 
690 aa  425  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.329251  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11330  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  50.66 
 
 
691 aa  409  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.234255  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2244  hypothetical protein  56.23 
 
 
715 aa  408  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1665  hypothetical protein  52.38 
 
 
752 aa  404  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.590351  hitchhiker  0.000463934 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0543  hypothetical protein  49.6 
 
 
703 aa  404  1e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3335  protein of unknown function DUF255  51.7 
 
 
699 aa  401  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000801567  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2172  protein of unknown function DUF255  54.09 
 
 
714 aa  394  1e-108  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0500393  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0291  hypothetical protein  48.68 
 
 
680 aa  389  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0215  protein of unknown function DUF255  48.67 
 
 
673 aa  387  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1697  hypothetical protein  53.2 
 
 
669 aa  384  1e-105  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0959  protein of unknown function DUF255  48.53 
 
 
686 aa  384  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2547  hypothetical protein  50.79 
 
 
684 aa  379  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1315  hypothetical protein  46.13 
 
 
687 aa  377  1e-103  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.529434  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1214  hypothetical protein  50.4 
 
 
723 aa  378  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.372382  normal  0.0723033 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2540  hypothetical protein  50.67 
 
 
685 aa  373  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.352542  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2283  hypothetical protein  48.8 
 
 
700 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2401  hypothetical protein  48.8 
 
 
706 aa  369  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000573334  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1041  hypothetical protein  49.34 
 
 
681 aa  369  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1765  hypothetical protein  47.38 
 
 
711 aa  365  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17317  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1263  hypothetical protein  50 
 
 
678 aa  367  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.890044  normal  0.167783 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2990  hypothetical protein  48.68 
 
 
696 aa  366  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901065  hitchhiker  0.00330931 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1680  protein of unknown function DUF255  46.01 
 
 
686 aa  364  1e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2279  hypothetical protein  47.88 
 
 
700 aa  359  5e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0059  protein of unknown function DUF255  45.5 
 
 
634 aa  357  9.999999999999999e-98  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0512308  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2996  hypothetical protein  47.07 
 
 
700 aa  350  3e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1723  protein of unknown function DUF255  47.73 
 
 
665 aa  347  1e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1191  hypothetical protein  44.8 
 
 
675 aa  347  2e-94  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1071  protein of unknown function DUF255  47.48 
 
 
662 aa  346  4e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1171  hypothetical protein  48.18 
 
 
660 aa  344  1e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0998  hypothetical protein  47.07 
 
 
705 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2330  protein of unknown function DUF255  48.18 
 
 
693 aa  342  5.999999999999999e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00802642 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1072  protein of unknown function DUF255  45.19 
 
 
712 aa  335  1e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0898725 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1310  protein of unknown function DUF255  46.19 
 
 
615 aa  333  3e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.92977  normal  0.0463256 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3900  hypothetical protein  46.34 
 
 
673 aa  333  4e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0451  hypothetical protein  45.91 
 
 
665 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4477  protein of unknown function DUF255  45.14 
 
 
681 aa  331  1e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2727  hypothetical protein  45.12 
 
 
673 aa  329  4e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.461963 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1630  hypothetical protein  46.12 
 
 
751 aa  329  4e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0943  hypothetical protein  45.77 
 
 
718 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0945  protein of unknown function DUF255  46.28 
 
 
665 aa  327  3e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2926  protein of unknown function DUF255  47.63 
 
 
746 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3431  protein of unknown function DUF255  45.48 
 
 
682 aa  325  6e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00455743 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1677  protein of unknown function DUF255  44.79 
 
 
733 aa  325  7e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1532  hypothetical protein  45.71 
 
 
641 aa  325  9e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.150478  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1395  protein of unknown function DUF255  44.76 
 
 
720 aa  325  9e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0132403  normal  0.87283 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0704  protein of unknown function DUF255  47.88 
 
 
710 aa  325  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2991  protein of unknown function DUF255  43.67 
 
 
722 aa  324  1e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.784863  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1579  protein of unknown function DUF255  45.21 
 
 
610 aa  325  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0098  protein of unknown function DUF255  44.7 
 
 
677 aa  324  2e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0507  protein of unknown function DUF255  43.9 
 
 
717 aa  323  3e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.056256  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1180  protein of unknown function DUF255  45.34 
 
 
707 aa  323  4e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1448  hypothetical protein  44.62 
 
 
672 aa  322  5e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.411428  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0984  hypothetical protein  46.2 
 
 
725 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.29848  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1902  protein of unknown function DUF255  45.21 
 
 
677 aa  321  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1372  protein of unknown function DUF255  43.67 
 
 
706 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0830  hypothetical protein  44.76 
 
 
669 aa  320  3e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56502  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1001  protein of unknown function DUF255  46.56 
 
 
718 aa  319  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.657059  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4232  protein of unknown function DUF255  45.56 
 
 
666 aa  319  3.9999999999999996e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0871403  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31750  highly conserved protein containing a thioredoxin domain protein  42.93 
 
 
667 aa  319  5e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1004  protein of unknown function DUF255  46.56 
 
 
718 aa  318  9e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2549  hypothetical protein  45.88 
 
 
694 aa  318  1e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282595  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0225  hypothetical protein  46.89 
 
 
697 aa  318  1e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1299  protein of unknown function DUF255  46.83 
 
 
750 aa  317  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000120536 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1883  hypothetical protein  46.67 
 
 
658 aa  317  2e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.788472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0485  protein of unknown function DUF255  43.3 
 
 
680 aa  317  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471944  normal  0.48167 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0871  hypothetical protein  45.33 
 
 
699 aa  315  6e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0345  hypothetical protein  43.3 
 
 
700 aa  314  9.999999999999999e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.308049  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1270  hypothetical protein  44 
 
 
676 aa  315  9.999999999999999e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.809248 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1140  protein of unknown function DUF255  43.52 
 
 
737 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1067  hypothetical protein  46.56 
 
 
687 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2314  protein of unknown function DUF255  44.06 
 
 
715 aa  312  6.999999999999999e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2477  hypothetical protein  45.28 
 
 
679 aa  311  1e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8541  hypothetical protein  42.71 
 
 
682 aa  311  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3142  protein of unknown function DUF255  44.53 
 
 
656 aa  311  1e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2595  hypothetical protein  42.86 
 
 
681 aa  311  2e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1460  hypothetical protein  42.86 
 
 
720 aa  310  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0929  hypothetical protein  43.73 
 
 
699 aa  311  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.991859  normal  0.115087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0712  protein of unknown function DUF255  43.88 
 
 
657 aa  306  4.0000000000000004e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1296  protein of unknown function DUF255  42.68 
 
 
744 aa  306  5.0000000000000004e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.212217  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2744  hypothetical protein  43.6 
 
 
676 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.426615  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1832  hypothetical protein  41.6 
 
 
669 aa  303  4.0000000000000003e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569096  normal  0.0946187 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01090  hypothetical protein  40.05 
 
 
681 aa  301  2e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.796364  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1052  hypothetical protein  43.2 
 
 
652 aa  300  3e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2247  protein of unknown function DUF255  41.45 
 
 
700 aa  297  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4665  Fis family transcriptional regulator  43.62 
 
 
667 aa  296  5e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.518578 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1103  protein of unknown function DUF255  43.35 
 
 
687 aa  296  6e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.491204  normal  0.173322 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3622  hypothetical protein  43.16 
 
 
680 aa  294  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.250871  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6036  hypothetical protein  41.39 
 
 
596 aa  292  6e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01057  DUF255 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G12370)  40.15 
 
 
774 aa  292  7e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0181431 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1443  protein of unknown function DUF255  39.79 
 
 
670 aa  291  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3473  hypothetical protein  40.67 
 
 
676 aa  291  2e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11102  hypothetical protein  42.18 
 
 
673 aa  290  3e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000180128  normal  0.240263 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4140  hypothetical protein  42.13 
 
 
664 aa  290  4e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4215  hypothetical protein  42.13 
 
 
664 aa  290  4e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312803  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>