186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0427 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0427  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  321  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00405131  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0426  hypothetical protein  36.73 
 
 		 174 aa  111  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0272126  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0131  thioredoxin domain-containing protein  29.71 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000222115  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0822  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  36.47 
 
 		 590 aa  68.2  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0928635  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1581  protein of unknown function DUF255  31.3 
 
 		 544 aa  67.8  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.397722  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1636  Thiol:disulfide interchange protein-like protein  31.58 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2029  hypothetical protein  24.14 
 
 		 178 aa  62  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.213181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0217  protein of unknown function DUF255  32.23 
 
 		 517 aa  61.6  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1855  protein of unknown function DUF255  21.8 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0491  protein of unknown function DUF255  32.86 
 
 		 549 aa  58.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2205  hypothetical protein  28.42 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1448  hypothetical protein  28.44 
 
 		 672 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.411428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2038  Thioredoxin domain protein  26.85 
 
 		 357 aa  56.6  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.571694  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0023  protein of unknown function DUF255  26.83 
 
 		 643 aa  55.5  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1471  thioredoxin  30.34 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000657673  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2274  protein of unknown function DUF255  29.21 
 
 		 552 aa  56.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0376  Thioredoxin-related protein-like protein  26.35 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341694  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0486  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  26.36 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1723  protein of unknown function DUF255  27.78 
 
 		 665 aa  54.7  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1204  hypothetical protein  27.37 
 
 		 661 aa  53.9  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.139299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0523  hypothetical protein  28.35 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.419067  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2382  Protein-disulfide reductase  33.33 
 
 		 581 aa  53.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  7.870920000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2314  protein of unknown function DUF255  34.29 
 
 		 715 aa  53.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0979  protein of unknown function DUF255  23.81 
 
 		 536 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.571094  normal  0.95271 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2279  hypothetical protein  28.35 
 
 		 700 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0517  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  24.83 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00166074  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1456  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  29.2 
 
 		 406 aa  52.4  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0739  hypothetical protein  31.3 
 
 		 197 aa  52  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1263  hypothetical protein  26.43 
 
 		 678 aa  51.6  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.890044  normal  0.167783 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2547  hypothetical protein  35.71 
 
 		 684 aa  51.6  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1310  protein of unknown function DUF255  26.72 
 
 		 615 aa  51.2  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.92977  normal  0.0463256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0388  Thioredoxin domain protein  30.83 
 
 		 466 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.848154 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0998  hypothetical protein  32.86 
 
 		 705 aa  51.2  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4103  protein of unknown function DUF255  25.21 
 
 		 185 aa  51.2  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.57841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0588  hypothetical protein  36.51 
 
 		 692 aa  51.2  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.155052  normal  0.0633893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0712  protein of unknown function DUF255  27.93 
 
 		 657 aa  50.8  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2384  hypothetical protein  33.33 
 
 		 705 aa  50.8  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249366  normal  0.331232 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2540  hypothetical protein  25.45 
 
 		 685 aa  50.8  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.352542  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1883  hypothetical protein  27.93 
 
 		 658 aa  50.8  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.788472 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1140  protein of unknown function DUF255  32.39 
 
 		 737 aa  50.8  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1704  thiol:disulfide interchange protein dsbD, putative  31.52 
 
 		 682 aa  50.4  0.000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.286832 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2821  hypothetical protein  26.92 
 
 		 569 aa  50.4  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.642839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0316  Thioredoxin-related protein-like protein  23.95 
 
 		 184 aa  50.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0364  thioredoxin  29.7 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0787  hypothetical protein  24.24 
 
 		 650 aa  50.1  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.86498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2780  thioredoxin-related protein-like protein  24.77 
 
 		 391 aa  49.7  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0175859  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3529  hypothetical protein  34.72 
 
 		 186 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1680  protein of unknown function DUF255  23.57 
 
 		 686 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3595  hypothetical protein  34.72 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3335  protein of unknown function DUF255  28.57 
 
 		 699 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000801567  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0823  protein of unknown function DUF255  29 
 
 		 635 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.0427489 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2363  hypothetical protein  23.89 
 
 		 174 aa  48.9  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3719  hypothetical protein  26.32 
 
 		 173 aa  48.9  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0526022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1041  hypothetical protein  26.26 
 
 		 681 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0857  hypothetical protein  26.53 
 
 		 676 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0770505  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0485  protein of unknown function DUF255  28.18 
 
 		 680 aa  48.1  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471944  normal  0.48167 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3622  hypothetical protein  26.8 
 
 		 680 aa  48.1  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.250871  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31750  highly conserved protein containing a thioredoxin domain protein  27.93 
 
 		 667 aa  48.1  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0805  Thioredoxin domain protein  21.62 
 
 		 270 aa  47.8  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0863  hypothetical protein  27.55 
 
 		 693 aa  47.8  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.477469  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2990  hypothetical protein  24.65 
 
 		 696 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901065  hitchhiker  0.00330931 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6036  hypothetical protein  26.83 
 
 		 596 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1546  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.08 
 
 		 673 aa  47.4  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.632916  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1460  hypothetical protein  28.87 
 
 		 720 aa  47.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4973  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.91 
 
 		 699 aa  47.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000476148 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1398  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.59 
 
 		 396 aa  47.4  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.422628  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0182  conserved hypothetical protein, secreted  19.75 
 
 		 183 aa  47  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2247  protein of unknown function DUF255  26.26 
 
 		 700 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0377  thioredoxin-related protein  21.54 
 
 		 170 aa  47.4  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719942  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1983  hypothetical protein  27.55 
 
 		 666 aa  47.4  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2063  hypothetical protein  27.55 
 
 		 666 aa  47  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.130883  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2613  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  25.22 
 
 		 421 aa  47  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0830  hypothetical protein  26.61 
 
 		 669 aa  47  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56502  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0161  hypothetical protein  26.42 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00228251  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0293  protein of unknown function DUF255  25.25 
 
 		 839 aa  47  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2885  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.77 
 
 		 449 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.326316 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0507  protein of unknown function DUF255  22.45 
 
 		 717 aa  46.6  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.056256  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7116  thioredoxin domain protein  25.3 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2330  protein of unknown function DUF255  24.24 
 
 		 693 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00802642 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1424  hypothetical protein  24.24 
 
 		 593 aa  47  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1653  hypothetical protein  28.43 
 
 		 449 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  28.7 
 
 		 586 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1646  hypothetical protein  28.43 
 
 		 449 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1765  hypothetical protein  26.8 
 
 		 711 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17317  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3474  thiol:disulfide interchange protein  33.9 
 
 		 558 aa  45.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149531  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0225  hypothetical protein  23.64 
 
 		 697 aa  46.2  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1171  hypothetical protein  24.22 
 
 		 756 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.872428  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1677  protein of unknown function DUF255  32.86 
 
 		 733 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0491  protein of unknown function DUF255  30 
 
 		 682 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1072  protein of unknown function DUF255  24.44 
 
 		 712 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0898725 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1270  hypothetical protein  32.86 
 
 		 676 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809248 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  31.25 
 
 		 586 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25 
 
 		 789 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09878  putative exported cytochrome C biogenesis-related protein  28.4 
 
 		 663 aa  45.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0715161  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1524  hypothetical protein  28.7 
 
 		 194 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1191  hypothetical protein  25.77 
 
 		 675 aa  45.4  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1283  hypothetical protein  31.43 
 
 		 687 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.960991 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0059  protein of unknown function DUF255  27.84 
 
 		 634 aa  45.1  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0512308  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7115  Protein-disulfide reductase  24.53 
 
 		 658 aa  45.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2991  protein of unknown function DUF255  31.43 
 
 		 722 aa  44.7  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.784863  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>