233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2029 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2029  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  373  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.213181  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4487  Thioredoxin-related protein-like protein  39.34 
 
 
196 aa  131  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000975236  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4103  protein of unknown function DUF255  33.53 
 
 
185 aa  117  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.57841  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0182  conserved hypothetical protein, secreted  39.1 
 
 
183 aa  114  6e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04810  hypothetical protein  35.8 
 
 
179 aa  108  5e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.543485  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1855  protein of unknown function DUF255  29.09 
 
 
172 aa  95.9  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0805  Thioredoxin domain protein  33.57 
 
 
270 aa  80.9  0.000000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0131  thioredoxin domain-containing protein  28.36 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000222115  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0806  protein of unknown function DUF255  40 
 
 
274 aa  79  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.862822  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3953  Thioredoxin domain  32.81 
 
 
162 aa  70.1  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2780  thioredoxin-related protein-like protein  35.85 
 
 
391 aa  70.1  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0175859  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4066  Thioredoxin domain protein  30.77 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0517  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  27.61 
 
 
148 aa  67.4  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00166074  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2364  Thioredoxin domain protein  30.71 
 
 
465 aa  63.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0787  hypothetical protein  30.39 
 
 
650 aa  63.9  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.86498  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0427  hypothetical protein  24.14 
 
 
155 aa  62  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00405131  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0023  protein of unknown function DUF255  33.68 
 
 
643 aa  61.2  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0388  Thioredoxin domain protein  33.65 
 
 
466 aa  60.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.848154 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0120  hypothetical protein  27.97 
 
 
138 aa  60.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0863  hypothetical protein  26.73 
 
 
693 aa  59.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.477469  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0959  protein of unknown function DUF255  32.32 
 
 
686 aa  59.3  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0943  hypothetical protein  25.38 
 
 
718 aa  58.9  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0426  hypothetical protein  21.56 
 
 
174 aa  58.2  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0272126  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1004  protein of unknown function DUF255  24.03 
 
 
718 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0545  hypothetical protein  31.17 
 
 
711 aa  56.6  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.322459 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0897  hypothetical protein  33.71 
 
 
644 aa  56.6  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1001  protein of unknown function DUF255  24.03 
 
 
718 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.657059  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7116  thioredoxin domain protein  28.35 
 
 
161 aa  56.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0787  protein of unknown function DUF255  35.14 
 
 
686 aa  56.2  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0588  hypothetical protein  38.81 
 
 
692 aa  55.8  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.155052  normal  0.0633893 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1388  protein of unknown function DUF255  29.29 
 
 
688 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2401  hypothetical protein  30.86 
 
 
706 aa  55.5  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000573334  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1422  protein of unknown function DUF255  29.29 
 
 
688 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6051  thioredoxin domain protein  26.85 
 
 
148 aa  55.1  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0119737  normal  0.502924 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2848  hypothetical protein  26.89 
 
 
381 aa  54.7  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1665  hypothetical protein  30.53 
 
 
752 aa  54.7  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.590351  hitchhiker  0.000463934 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0293  protein of unknown function DUF255  27.97 
 
 
839 aa  54.3  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2279  hypothetical protein  26.12 
 
 
700 aa  54.3  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0491  protein of unknown function DUF255  29.87 
 
 
682 aa  54.3  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591903  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1395  protein of unknown function DUF255  26.35 
 
 
720 aa  53.5  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0132403  normal  0.87283 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2205  hypothetical protein  27.78 
 
 
133 aa  53.9  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0822  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  23.39 
 
 
590 aa  53.9  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0928635  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1204  hypothetical protein  30.88 
 
 
661 aa  53.9  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.139299  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0377  thioredoxin-related protein  20.45 
 
 
170 aa  53.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719942  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2384  hypothetical protein  30.56 
 
 
705 aa  53.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249366  normal  0.331232 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0938  protein of unknown function DUF255  26.26 
 
 
687 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2990  hypothetical protein  25 
 
 
696 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901065  hitchhiker  0.00330931 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01057  DUF255 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G12370)  27.12 
 
 
774 aa  52.8  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0181431 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1191  hypothetical protein  26.47 
 
 
675 aa  52.4  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1723  protein of unknown function DUF255  28.08 
 
 
665 aa  52.4  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3335  protein of unknown function DUF255  29.29 
 
 
699 aa  52.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000801567  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1072  protein of unknown function DUF255  29.2 
 
 
712 aa  52.8  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0898725 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1448  hypothetical protein  27.97 
 
 
672 aa  52  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.411428  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0291  hypothetical protein  34.33 
 
 
680 aa  51.6  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0266  hypothetical protein  31.19 
 
 
125 aa  51.6  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417575  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1460  hypothetical protein  31.67 
 
 
720 aa  51.6  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2142  thioredoxin-related protein  25.19 
 
 
163 aa  51.2  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0217  protein of unknown function DUF255  22.79 
 
 
517 aa  51.6  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2324  hypothetical protein  27.27 
 
 
721 aa  51.2  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2613  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  24.19 
 
 
421 aa  51.2  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1802  Thioredoxin domain protein  25.21 
 
 
596 aa  51.2  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.868278  hitchhiker  0.0000561667 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2549  hypothetical protein  27.19 
 
 
694 aa  50.8  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282595  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0507  protein of unknown function DUF255  29 
 
 
717 aa  50.8  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.056256  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1041  hypothetical protein  25.93 
 
 
681 aa  50.8  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1630  hypothetical protein  30.51 
 
 
751 aa  50.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1180  protein of unknown function DUF255  26.76 
 
 
707 aa  50.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2540  hypothetical protein  25.66 
 
 
685 aa  50.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.352542  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0059  protein of unknown function DUF255  27.96 
 
 
634 aa  50.4  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0512308  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2853  hypothetical protein  31.34 
 
 
690 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.329251  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1214  hypothetical protein  30.49 
 
 
723 aa  50.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.372382  normal  0.0723033 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2996  hypothetical protein  28.7 
 
 
700 aa  50.1  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1181  thiol:disulfide interchange protein DsbD  34.78 
 
 
628 aa  49.7  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.753424  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0984  hypothetical protein  27.37 
 
 
725 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.29848  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0636  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.21 
 
 
466 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.619274 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0929  hypothetical protein  29.77 
 
 
699 aa  50.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.991859  normal  0.115087 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1636  Thiol:disulfide interchange protein-like protein  25 
 
 
176 aa  48.9  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1765  hypothetical protein  25.49 
 
 
711 aa  49.3  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17317  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.82 
 
 
810 aa  48.9  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1677  protein of unknown function DUF255  28.75 
 
 
733 aa  49.3  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0225  hypothetical protein  31.25 
 
 
697 aa  49.3  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2991  protein of unknown function DUF255  31.34 
 
 
722 aa  49.3  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.784863  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0853  thioredoxin-related protein-like protein  28.24 
 
 
224 aa  48.9  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000618782  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2314  protein of unknown function DUF255  31.25 
 
 
715 aa  48.5  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0543  hypothetical protein  31.33 
 
 
703 aa  48.5  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1315  hypothetical protein  26.55 
 
 
687 aa  48.9  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.529434  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3719  hypothetical protein  22.41 
 
 
173 aa  48.5  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0526022  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31750  highly conserved protein containing a thioredoxin domain protein  26.72 
 
 
667 aa  48.9  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1372  protein of unknown function DUF255  30 
 
 
706 aa  48.5  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2727  hypothetical protein  26 
 
 
673 aa  48.1  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.461963 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2547  hypothetical protein  31.25 
 
 
684 aa  48.1  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1532  hypothetical protein  27.27 
 
 
641 aa  47.8  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.150478  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0651  hypothetical protein  29.55 
 
 
188 aa  48.1  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1171  hypothetical protein  25.22 
 
 
756 aa  48.1  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.872428  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2043  hypothetical protein  30.3 
 
 
610 aa  48.1  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104906  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1270  hypothetical protein  28.21 
 
 
676 aa  48.1  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.809248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4244  protein-disulfide reductase  33.7 
 
 
600 aa  47.8  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4477  protein of unknown function DUF255  29.85 
 
 
681 aa  47.8  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11330  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  29.7 
 
 
691 aa  47.8  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.234255  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0871  hypothetical protein  29.59 
 
 
699 aa  47.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1456  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  32.81 
 
 
406 aa  47.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>