13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0120 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0120  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  288  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2029  hypothetical protein  27.97 
 
 		 178 aa  60.5  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.213181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4103  protein of unknown function DUF255  26.67 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.57841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4487  Thioredoxin-related protein-like protein  21.95 
 
 		 196 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000975236  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04810  hypothetical protein  25.81 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.543485  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0182  conserved hypothetical protein, secreted  23.26 
 
 		 183 aa  48.1  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3550  redoxin domain-containing protein  28 
 
 		 278 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.054429 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0927  hypothetical protein  28.36 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.119484  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1737  hypothetical protein  25.77 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3583  thioredoxin  29.29 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.029416  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2252  putative thiol:disulfide interchange protein  29.25 
 
 		 271 aa  41.6  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5905  thioredoxin  31 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2397  Redoxin domain protein  24.43 
 
 		 267 aa  40.4  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.675955  normal  0.672629 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>