39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0551 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0551  thioredoxin-related protein-like protein  100 
 
 
223 aa  448  1e-125  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0853  thioredoxin-related protein-like protein  51.71 
 
 
224 aa  221  9e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000618782  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1603  thioredoxin-related protein-like protein  38.12 
 
 
219 aa  151  8e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1669  thioredoxin-related protein-like protein  38.12 
 
 
219 aa  151  8e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1112  thioredoxin-related protein-like protein  32.12 
 
 
227 aa  87  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00378585  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1855  protein of unknown function DUF255  31.82 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0377  thioredoxin-related protein  28.21 
 
 
170 aa  61.6  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719942  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0065  hypothetical protein  35.87 
 
 
194 aa  58.9  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0364  thioredoxin  27.7 
 
 
146 aa  55.1  0.0000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3718  thioredoxin-related protein-like protein  27.66 
 
 
145 aa  53.9  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695588  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1471  thioredoxin  28.06 
 
 
137 aa  50.4  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000657673  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2142  thioredoxin-related protein  25.38 
 
 
163 aa  49.3  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0517  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  29.63 
 
 
148 aa  49.3  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00166074  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0808  conserved hypothetical lipoprotein  27.5 
 
 
199 aa  48.9  0.00006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.799463  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1422  hypothetical protein  28.69 
 
 
155 aa  48.5  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.501791  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2110  glutaredoxin-like domain protein  28.83 
 
 
213 aa  47.8  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.405211  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2038  Thioredoxin domain protein  29.21 
 
 
357 aa  47.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.571694  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3919  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.11 
 
 
191 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.231123 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7011  Thioredoxin domain protein  31.43 
 
 
326 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.817681  normal  0.78664 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0486  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  28.05 
 
 
176 aa  46.6  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2856  hypothetical protein  26.67 
 
 
144 aa  46.2  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0822  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  23.68 
 
 
590 aa  46.2  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0928635  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4149  thioredoxin SoxW  23.94 
 
 
186 aa  45.4  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0147  Thioredoxin domain  24.48 
 
 
321 aa  45.8  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3456  sulfur oxidation protein SoxY  25.26 
 
 
145 aa  45.4  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0426  hypothetical protein  25.56 
 
 
174 aa  45.1  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0272126  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2029  hypothetical protein  25.93 
 
 
178 aa  44.3  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.213181  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0806  protein of unknown function DUF255  28.04 
 
 
274 aa  43.9  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.862822  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5532  thioredoxin domain-containing protein  25 
 
 
531 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2117  hypothetical protein  28.4 
 
 
168 aa  43.1  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.860814  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4740  thioredoxin domain-containing protein  25 
 
 
531 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738245  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0739  hypothetical protein  23.36 
 
 
197 aa  42.7  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0123  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.14 
 
 
591 aa  42.4  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0310589 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0027  protein of unknown function DUF255  29.47 
 
 
671 aa  42.4  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000809407  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5329  thioredoxin domain-containing protein  25 
 
 
566 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1444  hypothetical protein  28.03 
 
 
130 aa  42.4  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00624852  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1859  thioredoxin  32.43 
 
 
130 aa  42.4  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.263827  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2595  hypothetical protein  29.21 
 
 
681 aa  42  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  24.75 
 
 
287 aa  41.6  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>