21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1444 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1444  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  266  8.999999999999999e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00624852  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1900  hypothetical protein  48.03 
 
 
130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0166  hypothetical protein  28.18 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2205  hypothetical protein  23.01 
 
 
133 aa  53.9  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0131  thioredoxin domain-containing protein  28.43 
 
 
149 aa  53.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000222115  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1583  hypothetical protein  28.69 
 
 
126 aa  49.7  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0147  Thioredoxin domain  27.34 
 
 
321 aa  50.1  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0496  hypothetical protein  29.46 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0551  thioredoxin-related protein-like protein  28.03 
 
 
223 aa  46.2  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2780  thioredoxin-related protein-like protein  25.56 
 
 
391 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0175859  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3953  Thioredoxin domain  22.73 
 
 
162 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0486  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  24.1 
 
 
176 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0377  thioredoxin-related protein  23.42 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719942  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7115  Protein-disulfide reductase  40.35 
 
 
658 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1630  hypothetical protein  31.15 
 
 
751 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0822  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  26.14 
 
 
590 aa  42  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0928635  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2595  hypothetical protein  26.12 
 
 
681 aa  41.2  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0805  Thioredoxin domain protein  20.16 
 
 
270 aa  40.8  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2735  hypothetical protein  25.74 
 
 
194 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.134896  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0964  putative thioredoxin  29.21 
 
 
142 aa  40.4  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00015819  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0111  hypothetical protein  26.14 
 
 
179 aa  40  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>