55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0111 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0111  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  370  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2598  hypothetical protein  35.51 
 
 		 165 aa  110  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000151867  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4409  hypothetical protein  31.71 
 
 		 217 aa  106  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0742  hypothetical protein  30.07 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.775576  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0831  hypothetical protein  29.41 
 
 		 204 aa  98.6  4e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.215233  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0651  hypothetical protein  32.09 
 
 		 188 aa  96.3  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3743  putative thioredoxin  30.26 
 
 		 199 aa  87  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1737  hypothetical protein  25 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04218  lipoprotein, putative  23.68 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432244  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1415  hypothetical protein  29.52 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3668  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  24.81 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2821  hypothetical protein  33.71 
 
 		 569 aa  55.1  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.642839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3260  Thioredoxin domain  24.7 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1683  thiol:disulfide interchange protein DsbD  32.93 
 
 		 624 aa  53.9  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.424941  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0364  thioredoxin  25.37 
 
 		 146 aa  52.8  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2509  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  29.69 
 
 		 165 aa  50.1  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114878 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2384  hypothetical protein  35 
 
 		 705 aa  50.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249366  normal  0.331232 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0588  hypothetical protein  27.78 
 
 		 692 aa  48.1  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.155052  normal  0.0633893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8830  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  28.12 
 
 		 136 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0486  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  27.38 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4173  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.52 
 
 		 721 aa  46.6  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000359793  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1646  hypothetical protein  26.67 
 
 		 449 aa  46.6  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0023  protein of unknown function DUF255  22.09 
 
 		 643 aa  47  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1189  disulphide isomerase  24.43 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.59478  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1900  hypothetical protein  29.55 
 
 		 130 aa  45.8  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1097  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  24.43 
 
 		 154 aa  45.8  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0787  hypothetical protein  24.75 
 
 		 650 aa  45.8  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.86498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1087  thiol:disulfide interchange protein DsbD  28.76 
 
 		 582 aa  45.1  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000524195  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09878  putative exported cytochrome C biogenesis-related protein  28.83 
 
 		 663 aa  44.7  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0715161  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0806  protein of unknown function DUF255  27.91 
 
 		 274 aa  44.3  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.862822  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0857  hypothetical protein  34.29 
 
 		 676 aa  43.5  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0770505  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0603  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.19 
 
 		 672 aa  43.5  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.827983  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1653  hypothetical protein  24.44 
 
 		 449 aa  43.5  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1546  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.87 
 
 		 673 aa  43.1  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.632916  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0591  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region/thioredoxin-related  23 
 
 		 471 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.945166  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7115  Protein-disulfide reductase  32.26 
 
 		 658 aa  42.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3953  Thioredoxin domain  25.19 
 
 		 162 aa  42.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1180  protein of unknown function DUF255  31.58 
 
 		 707 aa  42.4  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1704  thiol:disulfide interchange protein dsbD, putative  30.65 
 
 		 682 aa  42  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.286832 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  27.5 
 
 		 586 aa  42  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1765  hypothetical protein  30.99 
 
 		 711 aa  42  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17317  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1204  hypothetical protein  25.27 
 
 		 661 aa  42  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.139299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4741  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.11 
 
 		 567 aa  42  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0323  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.17 
 
 		 563 aa  41.6  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046864 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1443  protein of unknown function DUF255  33.33 
 
 		 670 aa  41.6  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4719  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.11 
 
 		 567 aa  41.2  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0129572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4593  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.11 
 
 		 567 aa  41.2  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.610696 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0822  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  23.86 
 
 		 590 aa  41.6  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0928635  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3272  Protein-disulfide reductase  34.62 
 
 		 611 aa  41.2  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0226485 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1532  hypothetical protein  30.86 
 
 		 641 aa  41.2  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.150478  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3666  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.41 
 
 		 628 aa  41.2  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.162085  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4601  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.11 
 
 		 567 aa  40.8  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2926  protein of unknown function DUF255  36.67 
 
 		 746 aa  40.8  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4684  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.11 
 
 		 567 aa  40.8  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0964  putative thioredoxin  27.88 
 
 		 142 aa  40.8  0.01  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00015819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>