26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04218 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04218  lipoprotein, putative  100 
 
 
190 aa  385  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432244  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3743  putative thioredoxin  57.75 
 
 
199 aa  206  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0831  hypothetical protein  54.55 
 
 
204 aa  203  1e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.215233  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0742  hypothetical protein  53.48 
 
 
204 aa  202  3e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.775576  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0651  hypothetical protein  38.06 
 
 
188 aa  98.6  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4409  hypothetical protein  41.03 
 
 
217 aa  93.2  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2598  hypothetical protein  32.8 
 
 
165 aa  83.6  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000151867  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0111  hypothetical protein  23.68 
 
 
179 aa  70.9  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1415  hypothetical protein  37.01 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881349  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1737  hypothetical protein  28.8 
 
 
162 aa  64.3  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4583  thiol-disulfide isomerase  30.4 
 
 
176 aa  53.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1097  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  28.36 
 
 
154 aa  52.4  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1189  disulphide isomerase  27.61 
 
 
154 aa  50.1  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.59478  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0023  protein of unknown function DUF255  32.74 
 
 
643 aa  45.4  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0486  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  27.47 
 
 
176 aa  45.1  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4502  hypothetical protein  26.15 
 
 
218 aa  45.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6051  thioredoxin domain protein  25.58 
 
 
148 aa  44.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0119737  normal  0.502924 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1832  hypothetical protein  33.72 
 
 
669 aa  43.5  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569096  normal  0.0946187 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1204  hypothetical protein  32.26 
 
 
661 aa  43.5  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.139299  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0523  hypothetical protein  28.35 
 
 
168 aa  43.9  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.419067  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31750  highly conserved protein containing a thioredoxin domain protein  37.74 
 
 
667 aa  42.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1448  hypothetical protein  31.08 
 
 
672 aa  42.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.411428  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1052  hypothetical protein  29.27 
 
 
652 aa  42.4  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1875  hypothetical protein  27.88 
 
 
147 aa  42.4  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0842968  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0739  hypothetical protein  26.67 
 
 
197 aa  41.2  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1975  hypothetical protein  24.69 
 
 
582 aa  41.2  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>