144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4502 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4502  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  430  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1189  disulphide isomerase  46.23 
 
 		 154 aa  90.9  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.59478  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1097  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  46.23 
 
 		 154 aa  90.1  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2509  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  34.68 
 
 		 165 aa  64.3  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114878 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8830  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  39.02 
 
 		 136 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5565  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.38 
 
 		 591 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0591  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region/thioredoxin-related  38.82 
 
 		 471 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.945166  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64080  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.43 
 
 		 591 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3668  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  29.81 
 
 		 158 aa  57  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4583  thiol-disulfide isomerase  29.79 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1730  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.65 
 
 		 600 aa  56.2  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0636  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.33 
 
 		 466 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.619274 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0898  protein-disulfide reductase  26.88 
 
 		 589 aa  55.1  0.0000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0538  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.52 
 
 		 607 aa  55.1  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.126162  decreased coverage  0.00471183 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1778  protein-disulfide reductase  30.14 
 
 		 629 aa  55.1  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0193  hypothetical protein  32.41 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2980  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.7 
 
 		 611 aa  53.9  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.702235  normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.33 
 
 		 602 aa  53.1  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.65 
 
 		 611 aa  52.8  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03921  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.09 
 
 		 631 aa  52.4  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.11 
 
 		 619 aa  52.4  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3260  Thioredoxin domain  26.76 
 
 		 178 aa  52.4  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0626  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  39.47 
 
 		 471 aa  52.4  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.690861  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.11 
 
 		 619 aa  51.6  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.04 
 
 		 610 aa  52  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.11 
 
 		 613 aa  51.6  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.11 
 
 		 613 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3666  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.46 
 
 		 628 aa  51.2  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.162085  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0617  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.16 
 
 		 471 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2274  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.87 
 
 		 600 aa  51.6  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2329  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.76 
 
 		 606 aa  51.2  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0733929  normal  0.104839 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4858  thiol:disulfide interchange protein DsbD  28.57 
 
 		 604 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2811  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.71 
 
 		 624 aa  50.8  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1646  hypothetical protein  31.25 
 
 		 449 aa  50.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0651  hypothetical protein  28.69 
 
 		 188 aa  50.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2885  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.07 
 
 		 449 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.326316 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.04 
 
 		 613 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0631  thiol:disulfide interchange protein DsbD  24.26 
 
 		 567 aa  50.4  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1855  protein of unknown function DUF255  34.38 
 
 		 172 aa  50.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0706  thiol:disulfide interchange protein DsbD  25.56 
 
 		 567 aa  49.3  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.760098  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0621  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.55 
 
 		 585 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.46991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.98 
 
 		 604 aa  49.3  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4398  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.48 
 
 		 606 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.898445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32590  thiol:disulfide interchange protein  28.7 
 
 		 589 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426474  normal  0.0965179 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0135  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.96 
 
 		 596 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0486  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  32.94 
 
 		 176 aa  48.5  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1087  thiol:disulfide interchange protein DsbD  21.09 
 
 		 582 aa  48.5  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000524195  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.11 
 
 		 619 aa  48.5  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  27.27 
 
 		 586 aa  48.5  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.11 
 
 		 610 aa  48.1  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2559  thiol:disulfide interchange protein DsbD  32.04 
 
 		 752 aa  48.1  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.745294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4593  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.34 
 
 		 567 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.610696 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4719  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.34 
 
 		 567 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0129572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2760  thiol:disulfide interchange protein  28.07 
 
 		 589 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364714  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.48 
 
 		 619 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3743  putative thioredoxin  28.91 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2592  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.77 
 
 		 654 aa  47.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002212  cytochrome c-type biogenesis protein DsbD protein-disulfide reductase  28.43 
 
 		 603 aa  47.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2038  Thioredoxin domain protein  36.59 
 
 		 357 aa  47.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.571694  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1067  thiol:disulfide interchange protein DsbD  24.26 
 
 		 567 aa  47.4  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.477245  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2598  hypothetical protein  23.44 
 
 		 165 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000151867  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3559  protein-disulfide reductase  30.56 
 
 		 570 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1653  hypothetical protein  30 
 
 		 449 aa  46.2  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  27.62 
 
 		 586 aa  46.6  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2394  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.11 
 
 		 612 aa  47  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000654714  hitchhiker  0.0000354348 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1737  hypothetical protein  20.8 
 
 		 162 aa  46.6  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0084  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.26 
 
 		 592 aa  46.6  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1636  Thiol:disulfide interchange protein-like protein  30.38 
 
 		 176 aa  46.6  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0079  Protein-disulfide reductase  23.47 
 
 		 557 aa  46.6  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000987227 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4741  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.34 
 
 		 567 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0588  hypothetical protein  32.18 
 
 		 692 aa  46.6  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.155052  normal  0.0633893 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1415  hypothetical protein  26.77 
 
 		 170 aa  46.2  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881349  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4235  protein-disulfide reductase  29.91 
 
 		 571 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.892987 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2384  hypothetical protein  30.68 
 
 		 705 aa  45.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249366  normal  0.331232 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_9748  predicted protein  33.33 
 
 		 108 aa  45.8  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.82657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0600  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.57 
 
 		 590 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0980  thiol:disulfide interchange protein DsbD (protein-disulfide reductase) (disulfide reductase)  27.69 
 
 		 574 aa  45.8  0.0005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3801  protein-disulfide reductase  29.91 
 
 		 571 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04218  lipoprotein, putative  25.98 
 
 		 190 aa  45.4  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432244  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2683  protein-disulfide reductase  26.36 
 
 		 654 aa  45.4  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5366  Protein-disulfide reductase  27.33 
 
 		 648 aa  45.4  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2773  Protein-disulfide reductase  26.57 
 
 		 632 aa  45.4  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1629  protein-disulfide reductase  29.91 
 
 		 571 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0906  thiol:disulfide interchange protein DsbD  23.58 
 
 		 563 aa  45.4  0.0006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.664459  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.49 
 
 		 609 aa  45.4  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3681  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.63 
 
 		 595 aa  45.4  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.576987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0728  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.63 
 
 		 595 aa  45.4  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3828  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.63 
 
 		 595 aa  45.4  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368823  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1683  thiol:disulfide interchange protein DsbD  28.09 
 
 		 624 aa  44.3  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.424941  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1357  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.77 
 
 		 612 aa  44.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.669889  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0561  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.27 
 
 		 590 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4360  thiol:disulfide interchange protein  22.86 
 
 		 603 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0322676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3506  protein-disulfide reductase  28.42 
 
 		 642 aa  44.3  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4684  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.85 
 
 		 567 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0296  protein-disulfide reductase  29.11 
 
 		 611 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.58017  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4601  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.85 
 
 		 567 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00156  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.09 
 
 		 592 aa  43.5  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0305  protein-disulfide reductase  29.11 
 
 		 611 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.069977 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3272  Protein-disulfide reductase  27.27 
 
 		 611 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0226485 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3140  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  28 
 
 		 627 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>