41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2509 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2509  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  100 
 
 		 165 aa  333  7.999999999999999e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114878 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1189  disulphide isomerase  56.69 
 
 		 154 aa  164  4e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.59478  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1097  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  55.91 
 
 		 154 aa  163  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3668  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  41.18 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3260  Thioredoxin domain  36.07 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4502  hypothetical protein  35.71 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4583  thiol-disulfide isomerase  30.65 
 
 		 176 aa  63.9  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8830  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  28.71 
 
 		 136 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1737  hypothetical protein  25 
 
 		 162 aa  62  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4409  hypothetical protein  31.58 
 
 		 217 aa  57.8  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0111  hypothetical protein  29.69 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01498  thiol-disulfide isomerase  26.83 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0590  hypothetical protein  31.68 
 
 		 278 aa  54.7  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000578551 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0651  hypothetical protein  30.77 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0806  protein of unknown function DUF255  29.67 
 
 		 274 aa  52  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.862822  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1204  hypothetical protein  34.02 
 
 		 661 aa  48.9  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.139299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0787  hypothetical protein  34.07 
 
 		 650 aa  48.5  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.86498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0193  hypothetical protein  34.83 
 
 		 186 aa  48.5  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0591  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region/thioredoxin-related  30.56 
 
 		 471 aa  47.8  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.945166  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  23.38 
 
 		 586 aa  46.6  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  22.95 
 
 		 586 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3622  hypothetical protein  29.69 
 
 		 680 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.250871  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2205  hypothetical protein  32.91 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0636  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.76 
 
 		 466 aa  44.3  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.619274 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2038  Thioredoxin domain protein  32.1 
 
 		 357 aa  44.3  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.571694  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1263  hypothetical protein  30.11 
 
 		 678 aa  44.3  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.890044  normal  0.167783 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  37.89 
 
 		 285 aa  43.9  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2384  hypothetical protein  36.54 
 
 		 705 aa  43.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249366  normal  0.331232 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2274  protein of unknown function DUF255  30.93 
 
 		 552 aa  43.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1415  hypothetical protein  26.37 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2791  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.72 
 
 		 686 aa  42.4  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1467  thioredoxin  37.66 
 
 		 268 aa  41.6  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2606  putative thioredoxin-like protein  31.03 
 
 		 136 aa  41.6  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.888104  normal  0.656305 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0333  thioredoxin-related  26.47 
 
 		 131 aa  41.2  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1229  thioredoxin  35.87 
 
 		 268 aa  41.2  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.223518 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1504  thioredoxin domain-containing protein  35.38 
 
 		 193 aa  40.8  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.519816 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1913  thiol:disulfide interchange protein DsbD  22.73 
 
 		 489 aa  40.8  0.008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00493276  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3247  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.55 
 
 		 616 aa  40.8  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0836496  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0626  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30 
 
 		 471 aa  40.8  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.690861  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  35.44 
 
 		 112 aa  40.4  0.01  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  35.44 
 
 		 112 aa  40.4  0.01  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>