51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3668 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3668  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  100 
 
 
158 aa  330  4e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2509  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  41.18 
 
 
165 aa  100  8e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114878 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1189  disulphide isomerase  36.75 
 
 
154 aa  93.2  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.59478  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1097  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  35.9 
 
 
154 aa  92.8  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3260  Thioredoxin domain  36 
 
 
178 aa  89  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4583  thiol-disulfide isomerase  33.33 
 
 
176 aa  70.5  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8830  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  31.37 
 
 
136 aa  70.1  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616779  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0193  hypothetical protein  44.83 
 
 
186 aa  60.8  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1737  hypothetical protein  25.5 
 
 
162 aa  60.1  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01498  thiol-disulfide isomerase  28.46 
 
 
205 aa  58.5  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0111  hypothetical protein  25.2 
 
 
179 aa  57.8  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4409  hypothetical protein  31.48 
 
 
217 aa  57.8  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4502  hypothetical protein  29.81 
 
 
218 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0590  hypothetical protein  28.05 
 
 
278 aa  55.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000578551 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0651  hypothetical protein  32.29 
 
 
188 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2598  hypothetical protein  27.07 
 
 
165 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000151867  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2780  thioredoxin-related protein-like protein  30.53 
 
 
391 aa  50.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0175859  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7116  thioredoxin domain protein  28.21 
 
 
161 aa  49.7  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3743  putative thioredoxin  25.62 
 
 
199 aa  48.9  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0805  Thioredoxin domain protein  22.05 
 
 
270 aa  48.9  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2384  hypothetical protein  31.18 
 
 
705 aa  48.1  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249366  normal  0.331232 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2811  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.48 
 
 
624 aa  48.1  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0822  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  27.47 
 
 
590 aa  47.8  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0928635  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002212  cytochrome c-type biogenesis protein DsbD protein-disulfide reductase  34.48 
 
 
603 aa  47.8  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2274  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.33 
 
 
600 aa  47.4  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2382  Protein-disulfide reductase  30.68 
 
 
581 aa  47  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  7.870920000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1653  hypothetical protein  29.73 
 
 
449 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1646  hypothetical protein  34.78 
 
 
449 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0147  Thioredoxin domain  29.17 
 
 
321 aa  46.2  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1415  hypothetical protein  22.86 
 
 
170 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881349  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0217  protein of unknown function DUF255  29.7 
 
 
517 aa  44.7  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1204  hypothetical protein  29.57 
 
 
661 aa  44.7  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.139299  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0588  hypothetical protein  29.17 
 
 
692 aa  44.3  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.155052  normal  0.0633893 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2274  protein of unknown function DUF255  26 
 
 
552 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.134722 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0023  protein of unknown function DUF255  32.97 
 
 
643 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1041  hypothetical protein  28.83 
 
 
681 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2790  putative electron transfer protein  28.28 
 
 
184 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1181  thiol:disulfide interchange protein DsbD  34.43 
 
 
628 aa  42  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.753424  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0591  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region/thioredoxin-related  31.25 
 
 
471 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.945166  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2683  protein-disulfide reductase  26.19 
 
 
654 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1448  hypothetical protein  37.25 
 
 
672 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.411428  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0787  hypothetical protein  30.11 
 
 
650 aa  41.2  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.86498  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1082  putative lipoprotein  26.5 
 
 
522 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.27834  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1364  putative lipoprotein  26.5 
 
 
522 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.419734  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2347  putative lipoprotein  26.5 
 
 
522 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2056  putative lipoprotein  26.5 
 
 
522 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.740123  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1452  disulphide-isomerase  26.5 
 
 
522 aa  40.8  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3231  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  26.5 
 
 
522 aa  40.8  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.804297  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0293  protein of unknown function DUF255  29.79 
 
 
839 aa  40.8  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0831  hypothetical protein  28.71 
 
 
204 aa  40.4  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.215233  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0131  thioredoxin domain-containing protein  27.08 
 
 
149 aa  40.4  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000222115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>