38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2598 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2598  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  346  6e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000151867  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0111  hypothetical protein  35.51 
 
 
179 aa  110  9e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4409  hypothetical protein  41.6 
 
 
217 aa  102  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0742  hypothetical protein  39.67 
 
 
204 aa  98.2  5e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.775576  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3743  putative thioredoxin  40.31 
 
 
199 aa  96.7  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0831  hypothetical protein  39.67 
 
 
204 aa  96.7  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.215233  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0651  hypothetical protein  37.4 
 
 
188 aa  91.7  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1737  hypothetical protein  33.33 
 
 
162 aa  84  9e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04218  lipoprotein, putative  32.8 
 
 
190 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432244  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1415  hypothetical protein  32.43 
 
 
170 aa  67.8  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881349  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3249  Thiol:disulfide interchange protein-like protein  33.07 
 
 
179 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0805805  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3668  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  27.07 
 
 
158 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3260  Thioredoxin domain  27.59 
 
 
178 aa  48.9  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4583  thiol-disulfide isomerase  24.78 
 
 
176 aa  47.8  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4502  hypothetical protein  24.41 
 
 
218 aa  47.8  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1189  disulphide isomerase  23.26 
 
 
154 aa  47.4  0.00008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.59478  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1097  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  22.48 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0822  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  26.26 
 
 
590 aa  45.8  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0928635  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0323  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.25 
 
 
563 aa  44.7  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000046864 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.27 
 
 
611 aa  44.3  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0588  hypothetical protein  34 
 
 
692 aa  44.3  0.0008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.155052  normal  0.0633893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8830  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  33.65 
 
 
136 aa  43.9  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616779  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.37 
 
 
609 aa  43.9  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0486  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  25 
 
 
176 aa  42.4  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1456  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  28.89 
 
 
406 aa  42.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4605  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.53 
 
 
565 aa  42.4  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0011627  normal  0.838171 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0023  protein of unknown function DUF255  29.41 
 
 
643 aa  42.4  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0787  hypothetical protein  25.44 
 
 
650 aa  42.4  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.86498  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03968  hypothetical protein  30.67 
 
 
565 aa  41.6  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4377  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.67 
 
 
565 aa  41.6  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111987  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3856  Protein-disulfide reductase  30.67 
 
 
565 aa  41.6  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5652  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.53 
 
 
565 aa  41.6  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390549  normal  0.76636 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3876  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.67 
 
 
565 aa  41.6  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04006  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.67 
 
 
565 aa  41.6  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4691  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.67 
 
 
565 aa  41.6  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1204  hypothetical protein  23.96 
 
 
661 aa  41.2  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.139299  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2821  hypothetical protein  27.38 
 
 
569 aa  40.8  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.642839  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4665  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.33 
 
 
565 aa  40.8  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.836853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>