158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3249 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3249  Thiol:disulfide interchange protein-like protein  100 
 
 
179 aa  364  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0805805  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0722  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.08 
 
 
583 aa  76.3  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0503  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.82 
 
 
583 aa  74.7  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2394  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  39.22 
 
 
612 aa  70.1  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000654714  hitchhiker  0.0000354348 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4360  thiol:disulfide interchange protein  34.07 
 
 
603 aa  68.2  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0322676  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  34.07 
 
 
586 aa  67.4  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  28.39 
 
 
586 aa  66.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3936  protein-disulfide reductase  29.84 
 
 
577 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.327412  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0472  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.63 
 
 
605 aa  66.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.566049  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1357  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.25 
 
 
612 aa  65.9  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.669889  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2790  thiol:disulfide interchange protein DsbD  34.17 
 
 
589 aa  65.5  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4142  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.78 
 
 
581 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1312  Protein-disulfide reductase  34.23 
 
 
625 aa  64.3  0.0000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0091784  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1683  thiol:disulfide interchange protein DsbD  30.83 
 
 
624 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.424941  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0123  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.53 
 
 
591 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0310589 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0135  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.33 
 
 
596 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276724  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4244  protein-disulfide reductase  31.87 
 
 
600 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5565  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.36 
 
 
591 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06980  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.78 
 
 
635 aa  62.8  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2760  thiol:disulfide interchange protein  33.91 
 
 
589 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364714  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1074  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.64 
 
 
607 aa  62.8  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0372  Protein-disulfide reductase  39.24 
 
 
750 aa  62.4  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754802  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32590  thiol:disulfide interchange protein  33.04 
 
 
589 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426474  normal  0.0965179 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3247  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.78 
 
 
616 aa  62  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0836496  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3535  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.24 
 
 
572 aa  61.2  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4907  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.87 
 
 
602 aa  61.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4858  thiol:disulfide interchange protein DsbD  35.56 
 
 
604 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1055  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.74 
 
 
626 aa  60.8  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000114598  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4398  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.61 
 
 
606 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.898445  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64080  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.26 
 
 
591 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3915  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.51 
 
 
613 aa  59.7  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.07 
 
 
586 aa  59.3  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2773  Protein-disulfide reductase  31.91 
 
 
632 aa  59.3  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  33.65 
 
 
623 aa  58.5  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2010  protein-disulfide reductase  34.07 
 
 
649 aa  58.5  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231364 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2683  protein-disulfide reductase  32.65 
 
 
654 aa  58.2  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2592  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.03 
 
 
654 aa  57.8  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1778  protein-disulfide reductase  30 
 
 
629 aa  57.8  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0561  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.33 
 
 
590 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0416  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.42 
 
 
624 aa  57.4  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136243  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0606  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.33 
 
 
590 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0653759 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0022  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.44 
 
 
614 aa  57.4  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25 
 
 
810 aa  56.6  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  27.69 
 
 
630 aa  56.2  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1913  thiol:disulfide interchange protein DsbD  32.97 
 
 
489 aa  56.2  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00493276  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0600  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.33 
 
 
590 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2559  thiol:disulfide interchange protein DsbD  33.7 
 
 
752 aa  55.5  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.745294  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2980  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.44 
 
 
611 aa  55.5  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.702235  normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0621  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.87 
 
 
585 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.46991  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.44 
 
 
789 aa  55.1  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5652  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.97 
 
 
565 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390549  normal  0.76636 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4604  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.97 
 
 
593 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.138187 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04006  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.97 
 
 
565 aa  54.7  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3856  Protein-disulfide reductase  32.97 
 
 
565 aa  54.7  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3876  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.97 
 
 
565 aa  54.7  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3415  disulfide reductase  37.97 
 
 
623 aa  54.7  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03968  hypothetical protein  32.97 
 
 
565 aa  54.7  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4377  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.97 
 
 
565 aa  54.7  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111987  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4691  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.97 
 
 
565 aa  54.7  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4684  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.71 
 
 
567 aa  54.7  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0446  protein-disulfide reductase  32.22 
 
 
731 aa  54.7  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4605  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.97 
 
 
565 aa  54.3  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0011627  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4601  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.71 
 
 
567 aa  54.7  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1041  DsbD family thiol:disulfide interchange protein  37.68 
 
 
745 aa  53.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3410  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.63 
 
 
570 aa  53.9  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4665  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.87 
 
 
565 aa  54.3  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.836853  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4741  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.44 
 
 
567 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0323  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.18 
 
 
563 aa  54.3  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000046864 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0520  protein-disulfide reductase  31.87 
 
 
610 aa  53.5  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00644414  normal  0.263509 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0343  protein-disulfide reductase  30.51 
 
 
631 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0138358 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4593  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.44 
 
 
567 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.610696 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2598  hypothetical protein  33.07 
 
 
165 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000151867  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4719  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.44 
 
 
567 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0129572  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002212  cytochrome c-type biogenesis protein DsbD protein-disulfide reductase  25.33 
 
 
603 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2056  divalent cation transporter  28 
 
 
575 aa  52.8  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000288452  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4235  protein-disulfide reductase  28.89 
 
 
571 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.892987 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0701  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  39.39 
 
 
616 aa  52  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0529075  hitchhiker  0.000000140832 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1792  Protein-disulfide reductase  34.78 
 
 
645 aa  52  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.611458 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0716  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.71 
 
 
595 aa  52  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0545  thiol:disulfide interchange protein DsbD  39.39 
 
 
616 aa  52  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.221768  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5366  Protein-disulfide reductase  34.78 
 
 
648 aa  51.6  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1568  protein-disulfide reductase  29.46 
 
 
622 aa  51.6  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.314287  normal  0.0195641 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3615  Protein-disulfide reductase  32.97 
 
 
626 aa  51.2  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573017  hitchhiker  0.0000000193428 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.67 
 
 
611 aa  51.2  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3801  protein-disulfide reductase  25.19 
 
 
571 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1629  protein-disulfide reductase  31.31 
 
 
571 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120841  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2810  protein-disulfide reductase  33.33 
 
 
618 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126387  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3039  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  33.03 
 
 
627 aa  50.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0079  Protein-disulfide reductase  26.85 
 
 
557 aa  50.8  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000987227 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0712  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.27 
 
 
570 aa  50.4  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.642209  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2038  Thioredoxin domain protein  32.58 
 
 
357 aa  50.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.571694  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0145  cytochrome C biogenesis protein transmembrane region  31.11 
 
 
570 aa  50.8  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0403  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.18 
 
 
561 aa  50.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.471471  hitchhiker  0.00764608 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  33.98 
 
 
627 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3559  protein-disulfide reductase  32.1 
 
 
570 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3747  thiol:disulfide interchange protein DsbD  33.98 
 
 
627 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.14193  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1181  thiol:disulfide interchange protein DsbD  34.25 
 
 
628 aa  50.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.753424  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3288  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.52 
 
 
624 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1953  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  33.98 
 
 
627 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.684775  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3507  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  33.98 
 
 
627 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.456139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>