48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1415 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1415  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  351  2.9999999999999997e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1737  hypothetical protein  35.85 
 
 		 162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0651  hypothetical protein  36.5 
 
 		 188 aa  92.4  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4409  hypothetical protein  34.59 
 
 		 217 aa  91.7  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04218  lipoprotein, putative  37.01 
 
 		 190 aa  84.3  8e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432244  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2598  hypothetical protein  30.88 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000151867  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0831  hypothetical protein  30.47 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.215233  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0742  hypothetical protein  29.69 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.775576  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3743  putative thioredoxin  35.43 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0111  hypothetical protein  31.2 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4583  thiol-disulfide isomerase  30.63 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3668  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  26.81 
 
 		 158 aa  62  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3260  Thioredoxin domain  27.2 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4502  hypothetical protein  26.77 
 
 		 218 aa  52.4  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0147  Thioredoxin domain  34.38 
 
 		 321 aa  52  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1189  disulphide isomerase  25.81 
 
 		 154 aa  50.4  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.59478  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1097  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  25.81 
 
 		 154 aa  50.1  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2509  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  30.36 
 
 		 165 aa  50.1  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114878 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03921  thiol:disulfide interchange protein precursor  23.65 
 
 		 631 aa  48.5  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4466  hypothetical protein  28.57 
 
 		 146 aa  47.4  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0806  protein of unknown function DUF255  31.25 
 
 		 274 aa  47.4  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.862822  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0403  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.76 
 
 		 561 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.471471  hitchhiker  0.00764608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1598  hypothetical protein  31.19 
 
 		 142 aa  45.1  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.82539 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.12 
 
 		 619 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.16 
 
 		 602 aa  44.7  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0590  hypothetical protein  28.57 
 
 		 278 aa  44.7  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000578551 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0805  Thioredoxin domain protein  26.44 
 
 		 270 aa  43.5  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0372  Protein-disulfide reductase  25.21 
 
 		 750 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754802  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.37 
 
 		 619 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4684  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.59 
 
 		 567 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4601  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.59 
 
 		 567 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.57 
 
 		 609 aa  43.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1855  protein of unknown function DUF255  23.21 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3828  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.53 
 
 		 595 aa  42.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368823  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1900  hypothetical protein  26.17 
 
 		 130 aa  42.7  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4719  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.57 
 
 		 567 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0129572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4593  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.57 
 
 		 567 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.610696 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3681  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.53 
 
 		 595 aa  42.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.576987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0728  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.53 
 
 		 595 aa  42.4  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0323  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.72 
 
 		 563 aa  42  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046864 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2885  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25 
 
 		 449 aa  41.6  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.326316 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4741  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.57 
 
 		 567 aa  41.6  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.44 
 
 		 611 aa  41.2  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.27 
 
 		 610 aa  41.6  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.52 
 
 		 608 aa  41.6  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2821  hypothetical protein  28.92 
 
 		 569 aa  41.2  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.642839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0486  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  27.91 
 
 		 176 aa  40.8  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.12 
 
 		 619 aa  40.8  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>