65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1189 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1189  disulphide isomerase  100 
 
 
154 aa  320  4e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.59478  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1097  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  98.05 
 
 
154 aa  315  1e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2509  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  56.69 
 
 
165 aa  155  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114878 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3668  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  35.82 
 
 
158 aa  93.6  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4502  hypothetical protein  45.71 
 
 
218 aa  89  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4583  thiol-disulfide isomerase  36.22 
 
 
176 aa  84.3  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3260  Thioredoxin domain  32.52 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8830  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  34 
 
 
136 aa  73.9  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616779  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1737  hypothetical protein  23.89 
 
 
162 aa  52.4  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0651  hypothetical protein  31.43 
 
 
188 aa  50.8  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04029  disulphide-isomerase  33.33 
 
 
529 aa  50.8  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0590  hypothetical protein  36.25 
 
 
278 aa  50.4  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000578551 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2613  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  31.25 
 
 
421 aa  48.5  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2038  Thioredoxin domain protein  31.86 
 
 
357 aa  47.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.571694  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0806  protein of unknown function DUF255  29.06 
 
 
274 aa  47.8  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.862822  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2598  hypothetical protein  23.26 
 
 
165 aa  47.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000151867  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2205  hypothetical protein  28.57 
 
 
133 aa  47.8  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01498  thiol-disulfide isomerase  23.91 
 
 
205 aa  47.8  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0980  thiol:disulfide interchange protein DsbD (protein-disulfide reductase) (disulfide reductase)  36.67 
 
 
574 aa  47.8  0.00006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0193  hypothetical protein  30.08 
 
 
186 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0111  hypothetical protein  24.26 
 
 
179 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1415  hypothetical protein  27.45 
 
 
170 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881349  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04218  lipoprotein, putative  25.41 
 
 
190 aa  45.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432244  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1855  protein of unknown function DUF255  28.8 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4409  hypothetical protein  27.78 
 
 
217 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1456  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  28.43 
 
 
406 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0636  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.73 
 
 
466 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.619274 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0123  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.7 
 
 
591 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0310589 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0591  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region/thioredoxin-related  28.7 
 
 
471 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.945166  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5403  thioredoxin domain-containing protein  31.52 
 
 
534 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.236496  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2056  putative lipoprotein  31.52 
 
 
522 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.740123  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1452  disulphide-isomerase  31.52 
 
 
522 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4856  thioredoxin domain-containing protein  31.52 
 
 
531 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1204  hypothetical protein  32.29 
 
 
661 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.139299  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2347  putative lipoprotein  31.52 
 
 
522 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3116  thioredoxin domain-containing protein  31.52 
 
 
522 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1364  putative lipoprotein  31.52 
 
 
522 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.419734  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1082  putative lipoprotein  31.52 
 
 
522 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.27834  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1646  hypothetical protein  25.49 
 
 
449 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3231  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  31.52 
 
 
522 aa  44.3  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.804297  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0364  thioredoxin  31.82 
 
 
146 aa  43.9  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1504  thioredoxin domain-containing protein  28.7 
 
 
193 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.519816 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  35.9 
 
 
109 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1636  Thiol:disulfide interchange protein-like protein  28.85 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1653  hypothetical protein  25.25 
 
 
449 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  36.17 
 
 
285 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0787  hypothetical protein  26.92 
 
 
650 aa  43.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.86498  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0805  Thioredoxin domain protein  22.88 
 
 
270 aa  42.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3247  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.39 
 
 
616 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0836496  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2382  Protein-disulfide reductase  29.35 
 
 
581 aa  43.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  7.870920000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0125  hypothetical protein  29.79 
 
 
556 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3915  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.57 
 
 
613 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3273  thioredoxin domain-containing protein  30.43 
 
 
576 aa  42.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0349373 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0589  thioredoxin domain-containing protein  33.77 
 
 
128 aa  42.4  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0486  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  29.89 
 
 
176 aa  41.6  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0979  protein of unknown function DUF255  31.76 
 
 
536 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.571094  normal  0.95271 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1413  hypothetical protein  25 
 
 
236 aa  41.2  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2340  thioredoxin domain protein  30.28 
 
 
188 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2289  Thioredoxin domain protein  30.28 
 
 
188 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0822  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  24.73 
 
 
590 aa  41.2  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0928635  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1471  thioredoxin  29.21 
 
 
137 aa  40.8  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000657673  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2274  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.21 
 
 
600 aa  40.8  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0427  hypothetical protein  22.34 
 
 
155 aa  40.4  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00405131  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1355  Thioredoxin domain protein  36.84 
 
 
577 aa  40  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  29.41 
 
 
586 aa  40  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>