50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1413 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1413  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  484  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0806  protein of unknown function DUF255  25 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.862822  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0979  protein of unknown function DUF255  35.23 
 
 		 536 aa  54.7  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.571094  normal  0.95271 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1456  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  27.13 
 
 		 406 aa  53.9  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0805  Thioredoxin domain protein  22.55 
 
 		 270 aa  53.5  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3456  sulfur oxidation protein SoxY  30.36 
 
 		 145 aa  48.9  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2613  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  27.37 
 
 		 421 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2038  Thioredoxin domain protein  26.44 
 
 		 357 aa  46.6  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.571694  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0145  cytochrome C biogenesis protein transmembrane region  27.72 
 
 		 570 aa  45.4  0.0008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0636  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.41 
 
 		 466 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.619274 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0277  protein of unknown function DUF255  31.58 
 
 		 531 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.137816  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0161  hypothetical protein  27.88 
 
 		 165 aa  45.1  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00228251  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2281  Thioredoxin domain  31.52 
 
 		 504 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00640337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0486  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  30.3 
 
 		 176 aa  43.9  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3031  thioredoxin  29.7 
 
 		 104 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1074  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32 
 
 		 607 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2293  thioredoxin  29.7 
 
 		 104 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2128  thioredoxin domain-containing protein  29.7 
 
 		 104 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.831253  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  27.71 
 
 		 630 aa  43.5  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4099  glutaredoxin  34.48 
 
 		 127 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2419  thioredoxin family protein  29.7 
 
 		 104 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2344  thioredoxin family protein  29.7 
 
 		 104 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.397592  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2336  thioredoxin family protein  29.7 
 
 		 104 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 306 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2338  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.33 
 
 		 609 aa  43.5  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.369158  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2856  hypothetical protein  34.94 
 
 		 144 aa  43.5  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2513  thioredoxin domain-containing protein  39.66 
 
 		 126 aa  43.1  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105118  normal  0.435938 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2090  thioredoxin  29.7 
 
 		 104 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2094  thioredoxin  29.7 
 
 		 104 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000532276  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3036  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.29 
 
 		 731 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0875816 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0125  hypothetical protein  29.03 
 
 		 556 aa  42.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.8 
 
 		 632 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1471  thioredoxin  28.07 
 
 		 137 aa  43.1  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000657673  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 374 aa  42.7  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1701  thioredoxin domain-containing protein  29.7 
 
 		 104 aa  42.7  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1987  type II and III secretion system protein  32.65 
 
 		 615 aa  42.7  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0115184  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  27.84 
 
 		 306 aa  42.4  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1792  Protein-disulfide reductase  29.25 
 
 		 645 aa  42.4  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.611458 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4740  thioredoxin domain-containing protein  29.03 
 
 		 531 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5532  thioredoxin domain-containing protein  29.03 
 
 		 531 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1913  thiol:disulfide interchange protein DsbD  27.71 
 
 		 489 aa  42  0.008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00493276  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  34.67 
 
 		 589 aa  42  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1312  Protein-disulfide reductase  24.68 
 
 		 625 aa  42  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0091784  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5329  thioredoxin domain-containing protein  29.03 
 
 		 566 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2347  putative lipoprotein  27.96 
 
 		 522 aa  41.6  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3231  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  27.96 
 
 		 522 aa  41.6  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.804297  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1364  putative lipoprotein  27.96 
 
 		 522 aa  41.6  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.419734  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1082  putative lipoprotein  27.96 
 
 		 522 aa  41.6  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.27834  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1452  disulphide-isomerase  27.96 
 
 		 522 aa  41.6  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2056  putative lipoprotein  27.96 
 
 		 522 aa  41.6  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.740123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>