More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2513 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2513  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 126 aa  259  6e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105118  normal  0.435938 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1598  hypothetical protein  85.71 
 
 		 126 aa  214  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226786  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3155  hypothetical protein  51.96 
 
 		 123 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.170473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4601  Thioredoxin domain  41.94 
 
 		 128 aa  104  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3525  Thioredoxin domain protein  41.94 
 
 		 128 aa  104  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0946  Thioredoxin domain protein  37.72 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000235523 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2976  thioredoxin domain-containing protein  39.45 
 
 		 133 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3389  putative thioredoxin (H-type,TRX-H)  37.25 
 
 		 130 aa  88.2  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2722  thioredoxin domain-containing protein  38.61 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0580222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5437  putative thioredoxin (H-type,TRX-H)  33.61 
 
 		 134 aa  84.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  hitchhiker  0.00313052 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5136  Thioredoxin domain  35.29 
 
 		 129 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.328233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2109  Thioredoxin domain  38.61 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.63713  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1773  thioredoxin domain-containing protein  38.61 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3183  thioredoxin domain protein  37.5 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.556959 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4595  thioredoxin-related  35.78 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.334879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2560  thioredoxin domain-containing protein  33.07 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.571192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1738  Thioredoxin domain  34.09 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.749275  normal  0.660647 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3285  putative thioredoxin  33.83 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.342326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  30.21 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  32.91 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0205  thioredoxin, putative  38.96 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.513083  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0261  thioredoxin, putative  38.96 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689046 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  29.41 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  30.61 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1320  thioredoxin  32.22 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.113501  normal  0.148362 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  29.79 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  31.46 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0372  Thioredoxin domain protein  31.71 
 
 		 89 aa  57  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.652561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  30 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0333  thioredoxin-related  31.19 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  31.13 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  30.77 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  31.82 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0312  Thioredoxin domain protein  34.57 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0694  thioredoxin  28.16 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  27.55 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  32 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  29.52 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  27.55 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  31.33 
 
 		 107 aa  53.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  33.72 
 
 		 406 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  29.52 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  28.57 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  28.74 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3540  Thioredoxin domain protein  32.1 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  27.78 
 
 		 107 aa  52  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  27.78 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9043  thioredoxin  34.52 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  28.89 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  27.27 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2099  thioredoxin  29.03 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3665  thioredoxin  37.35 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  37.35 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1563  Thioredoxin domain protein  32.5 
 
 		 100 aa  51.6  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851055  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  27.66 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  26.67 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_002950  PG0275  thioredoxin family protein  34.33 
 
 		 169 aa  51.2  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  28.89 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  29.76 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  28.75 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  32.91 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  27.5 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  27.5 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  27.5 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  27.5 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  32 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  27.5 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  27.5 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  27.78 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  27.5 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  27.78 
 
 		 110 aa  50.8  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  29.07 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  28.05 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  27.5 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  27.5 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3596  thioredoxin  36.14 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  29.52 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  29.52 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  27.85 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  27.85 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  29.52 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  29.07 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  27.85 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  30 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  27.85 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  33.33 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  29.52 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  32 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  29.52 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  29.52 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  27.85 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  28.12 
 
 		 110 aa  50.4  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  28.09 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  27.03 
 
 		 127 aa  50.4  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0589  thioredoxin domain-containing protein  32.43 
 
 		 128 aa  50.4  0.000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  27.78 
 
 		 108 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  27.78 
 
 		 108 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  27.66 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  28 
 
 		 107 aa  50.4  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>