103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3155 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3155  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  249  7e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.170473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2513  thioredoxin domain-containing protein  49.17 
 
 		 126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105118  normal  0.435938 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1598  hypothetical protein  51.33 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226786  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4601  Thioredoxin domain  37.4 
 
 		 128 aa  86.7  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3525  Thioredoxin domain protein  37.4 
 
 		 128 aa  86.7  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2976  thioredoxin domain-containing protein  38.33 
 
 		 133 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5437  putative thioredoxin (H-type,TRX-H)  35.16 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  hitchhiker  0.00313052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3389  putative thioredoxin (H-type,TRX-H)  34.78 
 
 		 130 aa  84  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2109  Thioredoxin domain  38.46 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.63713  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1773  thioredoxin domain-containing protein  38.46 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4595  thioredoxin-related  35.25 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.334879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1738  Thioredoxin domain  39.53 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.749275  normal  0.660647 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5136  Thioredoxin domain  33.33 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.328233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2560  thioredoxin domain-containing protein  41 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.571192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0946  Thioredoxin domain protein  35 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000235523 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2722  thioredoxin domain-containing protein  32.99 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0580222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3183  thioredoxin domain protein  33.66 
 
 		 138 aa  67  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.556959 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3285  putative thioredoxin  35.24 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.342326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0333  thioredoxin-related  32.46 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  30.59 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0372  Thioredoxin domain protein  34.18 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.652561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2293  Thioredoxin domain  35.71 
 
 		 108 aa  47.8  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.126467 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2099  thioredoxin  26.92 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0694  thioredoxin  30.95 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  28.18 
 
 		 289 aa  45.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1978  thioredoxin  30.61 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.274716  normal  0.21653 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A34  Thiol-disulfide isomerase  32 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0201899  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3164  Thioredoxin domain protein  29.35 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4220  thioredoxin  28.92 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  31.25 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  27.84 
 
 		 110 aa  45.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  27.84 
 
 		 110 aa  45.1  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  30.95 
 
 		 98 aa  45.1  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  28.09 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0540  thioredoxin  31.11 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0477  thioredoxin domain-containing protein  31.11 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1851  thioredoxin-related  31.33 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.378293  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32590  thiol:disulfide interchange protein  34.4 
 
 		 589 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426474  normal  0.0965179 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0777  thioredoxin domain-containing protein  34.07 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.387986  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  28.57 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  27.55 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  26.97 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  28.57 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  33.73 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2760  thiol:disulfide interchange protein  34.4 
 
 		 589 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364714  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0368  thioredoxin  28.43 
 
 		 123 aa  42.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  22.77 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  27.59 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1563  Thioredoxin domain protein  35.16 
 
 		 100 aa  42.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851055  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0205  thioredoxin, putative  32.35 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.513083  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  26.53 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  27.36 
 
 		 289 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  26.14 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  27.36 
 
 		 289 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  28.57 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  26.53 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0261  thioredoxin, putative  32.35 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689046 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  26.53 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01639  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09090)  28.92 
 
 		 330 aa  42  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  32 
 
 		 102 aa  42  0.003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0177  thioredoxin family protein  27.78 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.366705  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  25.25 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  31.33 
 
 		 109 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1702  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  28 
 
 		 104 aa  42  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145851  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2639  thioredoxin  26.8 
 
 		 110 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0886828  hitchhiker  0.00590655 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1452  thioredoxin  26.67 
 
 		 272 aa  41.6  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  27.16 
 
 		 289 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45140  thioredoxin 2, TxrC  30.43 
 
 		 144 aa  41.6  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  26.26 
 
 		 106 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  30.34 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  32.94 
 
 		 290 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2555  glutaredoxin  31.71 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.069299 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  30.34 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  25.84 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3742  thioredoxin  31.18 
 
 		 147 aa  41.2  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  27.27 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  32.31 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  28.41 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0835  thioredoxin  26.73 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  28.41 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  28.41 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  28.41 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  28.41 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  28.41 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0589  thioredoxin domain-containing protein  31.15 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  27.36 
 
 		 290 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0818  thioredoxin  28.21 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0885  Thioredoxin domain protein  29.41 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  25.93 
 
 		 290 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  29.21 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  25.3 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3729  thioredoxin  29.63 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.350169  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  30.95 
 
 		 290 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2401  thioredoxin  26.73 
 
 		 142 aa  40.4  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.85345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  25 
 
 		 280 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  30.95 
 
 		 290 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  30.95 
 
 		 290 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  26.72 
 
 		 290 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5421  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.11 
 
 		 194 aa  40.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  26.53 
 
 		 108 aa  40  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>