More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3389 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3389  putative thioredoxin (H-type,TRX-H)  100 
 
 		 130 aa  262  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2976  thioredoxin domain-containing protein  54.14 
 
 		 133 aa  152  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1773  thioredoxin domain-containing protein  51.49 
 
 		 131 aa  143  8.000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2109  Thioredoxin domain  51.49 
 
 		 131 aa  143  9e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.63713  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2560  thioredoxin domain-containing protein  55.3 
 
 		 131 aa  142  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.571192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0946  Thioredoxin domain protein  59.26 
 
 		 135 aa  140  6e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000235523 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2722  thioredoxin domain-containing protein  57.14 
 
 		 133 aa  133  6.0000000000000005e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0580222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3183  thioredoxin domain protein  51.09 
 
 		 138 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.556959 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5437  putative thioredoxin (H-type,TRX-H)  51.4 
 
 		 134 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  hitchhiker  0.00313052 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1738  Thioredoxin domain  57.78 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.749275  normal  0.660647 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3525  Thioredoxin domain protein  47.97 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4601  Thioredoxin domain  47.97 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4595  thioredoxin-related  55.17 
 
 		 137 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.334879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5136  Thioredoxin domain  40.59 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.328233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2513  thioredoxin domain-containing protein  37.25 
 
 		 126 aa  88.2  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105118  normal  0.435938 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3155  hypothetical protein  36.63 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.170473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1598  hypothetical protein  38.84 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226786  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3285  putative thioredoxin  34.62 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.342326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  36.36 
 
 		 406 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0333  thioredoxin-related  33.68 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3325  Thioredoxin domain protein  32.53 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000131659 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  33.33 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  35.42 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0311  hypothetical protein  36.47 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0261  thioredoxin, putative  36.67 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689046 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0205  thioredoxin, putative  36.67 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.513083  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  31 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  33.68 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  34.48 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  32.99 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  30.61 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1144  thioredoxin  36.99 
 
 		 421 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  32.63 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  36.78 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  34.41 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2699  hypothetical protein  27.16 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.752248  normal  0.95021 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  29.89 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  35.29 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1129  thioredoxin  34.48 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  28.74 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  28.97 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  38.89 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  28.74 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3151  thioredoxin  31.48 
 
 		 113 aa  53.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  37.5 
 
 		 109 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0835  thioredoxin  31.91 
 
 		 102 aa  53.5  0.0000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  33.33 
 
 		 102 aa  53.5  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  36.36 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  28.74 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  28.74 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0368  thioredoxin  28.28 
 
 		 123 aa  53.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  30 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  37.5 
 
 		 110 aa  52  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  31.03 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  35.63 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  28.74 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  28.74 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  28.74 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  31.63 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  28.74 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  35.63 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  30.26 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0238  thioredoxin, selenocysteine-containing  34.38 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3250  hypothetical protein  36.27 
 
 		 165 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131239  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  35.11 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2099  thioredoxin  32.18 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  31.82 
 
 		 109 aa  51.6  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3665  thioredoxin  33.33 
 
 		 150 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  33.33 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  31.78 
 
 		 222 aa  51.6  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  35.11 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4107  thioredoxin  29.55 
 
 		 141 aa  51.6  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794835 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  32.04 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  30.59 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28263  thioredoxin  29.17 
 
 		 338 aa  51.6  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.135642  normal  0.918036 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  36.78 
 
 		 108 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  29.63 
 
 		 290 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  36.78 
 
 		 108 aa  51.2  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  30.77 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  34.69 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  30.77 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  36.78 
 
 		 108 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  28.72 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  33.33 
 
 		 109 aa  51.2  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  36.78 
 
 		 108 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  36.78 
 
 		 108 aa  51.2  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  36.78 
 
 		 108 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  36.78 
 
 		 108 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  36.11 
 
 		 109 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  28.72 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  32.94 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1746  thioredoxin  31.96 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  34.69 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1798  thioredoxin domain-containing protein  35.29 
 
 		 90 aa  50.8  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.317909  normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  32.65 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  32.56 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  36.49 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0389  thiol:disulfide interchange protein DsbE  44.64 
 
 		 188 aa  50.4  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.484851 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  33.33 
 
 		 238 aa  50.4  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  28.72 
 
 		 98 aa  50.4  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>