More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1738 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1738  Thioredoxin domain  100 
 
 		 131 aa  263  7e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.749275  normal  0.660647 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2109  Thioredoxin domain  84.73 
 
 		 131 aa  229  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.63713  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1773  thioredoxin domain-containing protein  83.97 
 
 		 131 aa  226  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2976  thioredoxin domain-containing protein  61.65 
 
 		 133 aa  169  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3183  thioredoxin domain protein  59.84 
 
 		 138 aa  147  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.556959 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3389  putative thioredoxin (H-type,TRX-H)  52.99 
 
 		 130 aa  140  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2560  thioredoxin domain-containing protein  52.63 
 
 		 131 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.571192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0946  Thioredoxin domain protein  56.36 
 
 		 135 aa  130  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000235523 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5437  putative thioredoxin (H-type,TRX-H)  49.21 
 
 		 134 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  hitchhiker  0.00313052 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2722  thioredoxin domain-containing protein  52.43 
 
 		 133 aa  119  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0580222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4595  thioredoxin-related  54.84 
 
 		 137 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.334879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4601  Thioredoxin domain  38.61 
 
 		 128 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3525  Thioredoxin domain protein  38.61 
 
 		 128 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5136  Thioredoxin domain  44.55 
 
 		 129 aa  98.6  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.328233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3155  hypothetical protein  37.76 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.170473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2513  thioredoxin domain-containing protein  29.84 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105118  normal  0.435938 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1598  hypothetical protein  34.68 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226786  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3285  putative thioredoxin  34.33 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.342326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2699  hypothetical protein  35.58 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.752248  normal  0.95021 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0333  thioredoxin-related  31.78 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  33.71 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1144  thioredoxin  31.82 
 
 		 421 aa  55.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5761  thioredoxin  31.13 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.626635  normal  0.389703 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1878  Thioredoxin domain protein  34.96 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0205  thioredoxin, putative  34.72 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.513083  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0261  thioredoxin, putative  34.72 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689046 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  32.18 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  34.09 
 
 		 406 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  36.96 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  36.11 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0500  thioredoxin  36.78 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.874633 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  33.33 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  29.59 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0274  thioredoxin-like protein TxlA  30.99 
 
 		 191 aa  51.6  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  34.25 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0988  thioredoxin domain-containing protein  29.7 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  27.1 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  27.1 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5905  thioredoxin  30.08 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  27.1 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  27.1 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  34.48 
 
 		 108 aa  50.1  0.000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2890  hypothetical protein  35.96 
 
 		 161 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3325  Thioredoxin domain protein  31.65 
 
 		 176 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000131659 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0150  thioredoxin domain-containing protein  31.97 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  33.33 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  30.68 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0600  hypothetical protein  39.51 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  32.99 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0123  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.68 
 
 		 591 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0310589 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0135  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.11 
 
 		 596 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4802  hypothetical protein  35.96 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  28.44 
 
 		 222 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4150  hypothetical protein  35.96 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.535705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0350  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  31.4 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000162152  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3366  hypothetical protein  35.96 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00258482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  32.58 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  31.91 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  31.94 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  31.94 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3070  thioredoxin  35.71 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.990711  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  37.5 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0312  Thioredoxin domain protein  33.33 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1333  hypothetical protein  34.88 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  27.1 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  28.57 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  33 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3665  thioredoxin  31.4 
 
 		 150 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1717  thioredoxin  34.15 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  32.18 
 
 		 108 aa  47.4  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  33.33 
 
 		 107 aa  47.8  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0217  protein of unknown function DUF255  32.08 
 
 		 517 aa  47.4  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  28.77 
 
 		 102 aa  47.8  0.00006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26095  predicted protein  28.4 
 
 		 105 aa  47.8  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00850949 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  31.4 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00075  protein disulfide-isomerase (Eurofung)  28.7 
 
 		 368 aa  47.4  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3540  Thioredoxin domain protein  34.88 
 
 		 89 aa  47  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  29.55 
 
 		 105 aa  47.4  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  32.18 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5421  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.28 
 
 		 194 aa  47  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  28.74 
 
 		 110 aa  47.4  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  28.92 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4142  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.18 
 
 		 581 aa  47  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  28.12 
 
 		 103 aa  47  0.00009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  28.74 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  27.37 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  28.42 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  28.74 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  31.03 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0690  thioredoxin 2  27.36 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.555698  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28263  thioredoxin  28.41 
 
 		 338 aa  46.6  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.135642  normal  0.918036 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0311  hypothetical protein  30.23 
 
 		 102 aa  47  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0762  thioredoxin  30.43 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000561264  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3354  putative thioredoxin-related transmembrane protein  28.57 
 
 		 188 aa  46.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.24257  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0486  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  30.61 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4481  thioredoxin  28.07 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  31.94 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A34  Thiol-disulfide isomerase  28.28 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0201899  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3583  thioredoxin  23.77 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.029416  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  30.59 
 
 		 104 aa  47  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>