163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2890 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2890  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  325  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4802  hypothetical protein  99.07 
 
 
108 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3366  hypothetical protein  99.07 
 
 
108 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00258482  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4150  hypothetical protein  99.07 
 
 
108 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.535705  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5143  hypothetical protein  90.74 
 
 
108 aa  203  7e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.709444  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3300  hypothetical protein  90.74 
 
 
135 aa  201  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0119958 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5224  hypothetical protein  88.89 
 
 
108 aa  198  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1588  thioredoxin  82.24 
 
 
108 aa  180  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174119  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0132  thioredoxin  82.24 
 
 
108 aa  180  6e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0106  thioredoxin  82.24 
 
 
108 aa  180  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0100  thioredoxin  82.24 
 
 
108 aa  180  7e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.380346  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4109  thioredoxin domain-containing protein  69 
 
 
107 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1336  putative thioredoxin  63.55 
 
 
106 aa  147  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00442557 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5281  Thioredoxin domain  61.68 
 
 
106 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.844315  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4067  thioredoxin  58.33 
 
 
107 aa  136  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4923  putative thiol-disulfide isomerase/thioredoxin  63.37 
 
 
108 aa  135  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.619687  normal  0.0773781 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4726  Thioredoxin domain protein  57.28 
 
 
108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2655  thioredoxin domain-containing protein  58.33 
 
 
117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal  0.0984495 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29280  putative thioredoxin  60.19 
 
 
108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1193  putative thioredoxin  61.17 
 
 
108 aa  128  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3969  putative thioredoxin  60.78 
 
 
108 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4888  thioredoxin domain-containing protein  57.14 
 
 
110 aa  127  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4190  putative thioredoxin  61.29 
 
 
109 aa  121  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1333  hypothetical protein  49.57 
 
 
131 aa  119  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0943  putative thioredoxin  56.57 
 
 
112 aa  118  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1972  Thioredoxin domain protein  59.14 
 
 
111 aa  114  5e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1746  thioredoxin domain-containing protein  59.14 
 
 
111 aa  114  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.178268 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0777  thioredoxin domain-containing protein  56.44 
 
 
111 aa  113  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.387986  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1907  thioredoxin domain-containing protein  54.26 
 
 
109 aa  112  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1222  thioredoxin-related  54.55 
 
 
112 aa  108  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0192497  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3319  thioredoxin domain-containing protein  46.81 
 
 
112 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2175  Thioredoxin domain  50.51 
 
 
107 aa  101  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0983386  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3706  thioredoxin domain-containing protein  47.31 
 
 
112 aa  100  7e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03441  thioredoxin  48.31 
 
 
90 aa  96.3  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0589  thioredoxin domain-containing protein  25.27 
 
 
128 aa  52.4  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  34.57 
 
 
222 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  36.25 
 
 
102 aa  51.2  0.000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0894  thioredoxin 1  32.56 
 
 
102 aa  49.7  0.00002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0704884  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1738  Thioredoxin domain  36.14 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.749275  normal  0.660647 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  35.38 
 
 
124 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  36.36 
 
 
124 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3801  Thioredoxin domain protein  31.17 
 
 
768 aa  48.5  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  35.38 
 
 
125 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  34.33 
 
 
123 aa  48.1  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  33.85 
 
 
125 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  33.33 
 
 
149 aa  47.8  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  32.5 
 
 
122 aa  47.4  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_9576  predicted protein  30.95 
 
 
100 aa  47.8  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  30.86 
 
 
109 aa  47.4  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  33.33 
 
 
120 aa  47.4  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1773  thioredoxin domain-containing protein  31.03 
 
 
131 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  35.38 
 
 
124 aa  47.4  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  35.38 
 
 
124 aa  47.4  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  28.57 
 
 
105 aa  47.4  0.00009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2109  Thioredoxin domain  34.88 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.63713  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  32.56 
 
 
165 aa  46.6  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  32.91 
 
 
406 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  35.29 
 
 
104 aa  46.2  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  32.1 
 
 
109 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  31.03 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  31.25 
 
 
124 aa  45.4  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4281  thioredoxin  29.76 
 
 
104 aa  45.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  30.86 
 
 
109 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0333  thioredoxin-related  33.33 
 
 
131 aa  45.4  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3714  Thioredoxin domain protein  39.39 
 
 
143 aa  45.1  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  31.25 
 
 
139 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  35.71 
 
 
105 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08571  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10300)  28.75 
 
 
108 aa  45.1  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321852  hitchhiker  0.00174715 
 
 
-
 
NC_002978  WD0879  thioredoxin  29.11 
 
 
107 aa  45.1  0.0005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  31.25 
 
 
122 aa  44.7  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5437  putative thioredoxin (H-type,TRX-H)  32.5 
 
 
134 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  hitchhiker  0.00313052 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0435  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  28.28 
 
 
105 aa  44.7  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1702  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  30.38 
 
 
104 aa  45.1  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145851  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  27.63 
 
 
104 aa  44.7  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  30.3 
 
 
117 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  32.1 
 
 
109 aa  44.7  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  31.34 
 
 
123 aa  44.3  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  29.89 
 
 
108 aa  44.7  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  25 
 
 
146 aa  44.3  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4290  Thioredoxin domain protein  39.39 
 
 
123 aa  44.3  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0729308  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  29.23 
 
 
124 aa  44.3  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  31.82 
 
 
130 aa  44.3  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  32.2 
 
 
123 aa  44.3  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  28.38 
 
 
117 aa  43.9  0.0009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  32.1 
 
 
109 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  33.8 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0762  thioredoxin  32.39 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000561264  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26095  predicted protein  27.06 
 
 
105 aa  43.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00850949 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  28.24 
 
 
106 aa  43.9  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  30.86 
 
 
109 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3723  thioredoxin  29.76 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.122043  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  33.8 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  32.31 
 
 
119 aa  43.9  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  30 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  24.04 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  26.8 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  23.71 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  31.82 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0303  thioredoxin  30.86 
 
 
126 aa  43.1  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  29.55 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>