More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2655 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2655  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 
117 aa  239  7.999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal  0.0984495 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1972  Thioredoxin domain protein  67.29 
 
 
111 aa  157  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1746  thioredoxin domain-containing protein  67.29 
 
 
111 aa  157  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.178268 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0777  thioredoxin domain-containing protein  65.42 
 
 
111 aa  148  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.387986  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4067  thioredoxin  64.49 
 
 
107 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4888  thioredoxin domain-containing protein  58.18 
 
 
110 aa  136  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4109  thioredoxin domain-containing protein  56.19 
 
 
107 aa  136  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4923  putative thiol-disulfide isomerase/thioredoxin  59.43 
 
 
108 aa  135  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.619687  normal  0.0773781 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3969  putative thioredoxin  57.28 
 
 
108 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29280  putative thioredoxin  57.84 
 
 
108 aa  131  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4150  hypothetical protein  58.33 
 
 
108 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.535705  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4802  hypothetical protein  58.33 
 
 
108 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3366  hypothetical protein  58.33 
 
 
108 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00258482  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1336  putative thioredoxin  53.77 
 
 
106 aa  130  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00442557 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2890  hypothetical protein  58.33 
 
 
161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5281  Thioredoxin domain  57.58 
 
 
106 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.844315  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5224  hypothetical protein  59.22 
 
 
108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0106  thioredoxin  60.42 
 
 
108 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1588  thioredoxin  60.42 
 
 
108 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174119  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0132  thioredoxin  60.42 
 
 
108 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0100  thioredoxin  60.42 
 
 
108 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.380346  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5143  hypothetical protein  55.56 
 
 
108 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.709444  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0943  putative thioredoxin  57.58 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3300  hypothetical protein  58.25 
 
 
135 aa  124  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0119958 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4726  Thioredoxin domain protein  51.43 
 
 
108 aa  121  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4190  putative thioredoxin  55.56 
 
 
109 aa  120  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1333  hypothetical protein  55.67 
 
 
131 aa  120  6e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1193  putative thioredoxin  53.4 
 
 
108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3319  thioredoxin domain-containing protein  47.96 
 
 
112 aa  114  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1907  thioredoxin domain-containing protein  47.42 
 
 
109 aa  111  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2175  Thioredoxin domain  47.17 
 
 
107 aa  105  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0983386  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3706  thioredoxin domain-containing protein  49.46 
 
 
112 aa  104  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1222  thioredoxin-related  54.22 
 
 
112 aa  100  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0192497  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03441  thioredoxin  47.19 
 
 
90 aa  99  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  34.48 
 
 
106 aa  63.2  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0589  thioredoxin domain-containing protein  30.26 
 
 
128 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0894  thioredoxin 1  38.16 
 
 
102 aa  59.7  0.00000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0704884  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  32.18 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  32.18 
 
 
104 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  32.18 
 
 
104 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  31.25 
 
 
104 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  32.18 
 
 
104 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1412  thioredoxin  29.91 
 
 
104 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  41.18 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  35 
 
 
102 aa  55.5  0.0000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  33.33 
 
 
105 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  29.89 
 
 
104 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  36.23 
 
 
109 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  35.53 
 
 
406 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  34.78 
 
 
109 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  27.27 
 
 
107 aa  52.8  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  28.24 
 
 
104 aa  52.8  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  35.21 
 
 
109 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  24.51 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  29.79 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  31.33 
 
 
105 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4281  thioredoxin  25.35 
 
 
104 aa  51.6  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  33.33 
 
 
109 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3070  thioredoxin  35.06 
 
 
105 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.990711  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  27.91 
 
 
109 aa  51.6  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  32.89 
 
 
222 aa  51.2  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  34.29 
 
 
109 aa  51.2  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  28.17 
 
 
103 aa  51.2  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0205  thioredoxin, putative  30.86 
 
 
108 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.513083  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  32.91 
 
 
105 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  31.76 
 
 
108 aa  51.2  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0261  thioredoxin, putative  30.86 
 
 
108 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689046 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  30.95 
 
 
107 aa  51.2  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3596  thioredoxin  35.82 
 
 
150 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  26.88 
 
 
129 aa  50.8  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39568  thioredoxin  30 
 
 
103 aa  50.8  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.187057 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  24.72 
 
 
124 aa  50.4  0.000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0239  thioredoxin  35.06 
 
 
159 aa  50.4  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214788  normal  0.233282 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  35.94 
 
 
124 aa  50.4  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  24.24 
 
 
107 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  35.82 
 
 
150 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  27.06 
 
 
108 aa  50.1  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  27.06 
 
 
108 aa  50.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3665  thioredoxin  35.82 
 
 
150 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  27.06 
 
 
108 aa  50.1  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  27.06 
 
 
108 aa  50.1  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  27.06 
 
 
108 aa  50.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  28.41 
 
 
109 aa  50.1  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1697  thioredoxin domain-containing protein  29.87 
 
 
115 aa  50.1  0.000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  27.06 
 
 
108 aa  50.1  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  33.71 
 
 
109 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  30.12 
 
 
104 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  29.89 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  29.21 
 
 
104 aa  49.7  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08571  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10300)  25.58 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321852  hitchhiker  0.00174715 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  28.74 
 
 
108 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  24.18 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  28.74 
 
 
108 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  27.06 
 
 
108 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  28.74 
 
 
108 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  24.18 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  28.74 
 
 
108 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  25.53 
 
 
104 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  28.74 
 
 
108 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  28.74 
 
 
108 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>