227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3706 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3706  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 112 aa  234  4e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1907  thioredoxin domain-containing protein  63.3 
 
 		 109 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3319  thioredoxin domain-containing protein  60.55 
 
 		 112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4190  putative thioredoxin  50.96 
 
 		 109 aa  117  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4067  thioredoxin  54.08 
 
 		 107 aa  113  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2175  Thioredoxin domain  52.94 
 
 		 107 aa  113  7.999999999999999e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0983386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1193  putative thioredoxin  60.71 
 
 		 108 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4923  putative thiol-disulfide isomerase/thioredoxin  50.51 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.619687  normal  0.0773781 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3969  putative thioredoxin  51.65 
 
 		 108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4109  thioredoxin domain-containing protein  46.39 
 
 		 107 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1336  putative thioredoxin  45.71 
 
 		 106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00442557 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4888  thioredoxin domain-containing protein  49.52 
 
 		 110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29280  putative thioredoxin  52.87 
 
 		 108 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5143  hypothetical protein  46.46 
 
 		 108 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.709444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0106  thioredoxin  43.93 
 
 		 108 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1588  thioredoxin  43.93 
 
 		 108 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174119  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0100  thioredoxin  45.83 
 
 		 108 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.380346  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0132  thioredoxin  43.93 
 
 		 108 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5281  Thioredoxin domain  44.66 
 
 		 106 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.844315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4726  Thioredoxin domain protein  46.46 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2655  thioredoxin domain-containing protein  49.46 
 
 		 117 aa  104  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal  0.0984495 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5224  hypothetical protein  46.24 
 
 		 108 aa  102  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3300  hypothetical protein  47.31 
 
 		 135 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0119958 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0943  putative thioredoxin  46.67 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0777  thioredoxin domain-containing protein  49 
 
 		 111 aa  102  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.387986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1222  thioredoxin-related  46.6 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0192497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4802  hypothetical protein  47.31 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4150  hypothetical protein  47.31 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.535705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3366  hypothetical protein  47.31 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00258482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1972  Thioredoxin domain protein  45.54 
 
 		 111 aa  101  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1746  thioredoxin domain-containing protein  45.54 
 
 		 111 aa  101  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.178268 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2890  hypothetical protein  47.31 
 
 		 161 aa  100  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03441  thioredoxin  50.56 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1333  hypothetical protein  46.39 
 
 		 131 aa  91.7  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3801  Thioredoxin domain protein  35.11 
 
 		 768 aa  51.6  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  32.89 
 
 		 145 aa  50.4  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4281  thioredoxin  26.19 
 
 		 104 aa  49.7  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0030  thioredoxin domain protein  33.75 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.170038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  33.33 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0032  Thioredoxin domain protein  33.75 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00620  disulfide-isomerase precursor, putative  29.89 
 
 		 411 aa  48.5  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3667  thioredoxin domain-containing protein  32.56 
 
 		 298 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  28.05 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  27.17 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0261  thioredoxin, putative  30.23 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689046 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0205  thioredoxin, putative  30.23 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.513083  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  32.35 
 
 		 222 aa  47.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1524  thioredoxin  30.49 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659124 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2236  thioredoxin  26.83 
 
 		 144 aa  47  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.773662  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0739  thioredoxin  28.75 
 
 		 104 aa  47  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.186683  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  27.38 
 
 		 107 aa  47  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  32.35 
 
 		 107 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  31.33 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  32.05 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0894  thioredoxin 1  30 
 
 		 102 aa  45.4  0.0002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0704884  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4628  thioredoxin  26.44 
 
 		 341 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  26.19 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  30.26 
 
 		 159 aa  45.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  28.75 
 
 		 106 aa  45.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0210  thioredoxin  29.11 
 
 		 108 aa  46.2  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0356  thioredoxin  24.21 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0589  thioredoxin domain-containing protein  28.89 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  31.4 
 
 		 406 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4857  thioredoxin  30.26 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0651815  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  30.99 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  32.35 
 
 		 109 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  32.35 
 
 		 109 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  32.35 
 
 		 109 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08571  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10300)  23.91 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321852  hitchhiker  0.00174715 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  29 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  27.94 
 
 		 107 aa  44.7  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  22.33 
 
 		 127 aa  44.7  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0335  thioredoxin domain-containing protein  31.46 
 
 		 150 aa  44.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  30.88 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  31.94 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  26.83 
 
 		 107 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  33.82 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  29.41 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  25.26 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1123  thioredoxin  31.33 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  30.43 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  28.95 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  31.94 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  24.39 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1161  thioredoxin  29.63 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3212  hypothetical protein  37.5 
 
 		 178 aa  43.9  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  30.49 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  30.49 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  31.71 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  30.49 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  30.49 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  30.49 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0435  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  26 
 
 		 105 aa  43.9  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  30.49 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  28.95 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  30.49 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2304  thioredoxin  28.4 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  30.26 
 
 		 146 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  27.5 
 
 		 326 aa  43.5  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  27.52 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>