232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4109 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4109  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 107 aa  224  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1336  putative thioredoxin  71.43 
 
 		 106 aa  165  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00442557 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5281  Thioredoxin domain  68.57 
 
 		 106 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.844315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4802  hypothetical protein  69 
 
 		 108 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5143  hypothetical protein  66.98 
 
 		 108 aa  154  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.709444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3366  hypothetical protein  69 
 
 		 108 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00258482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4150  hypothetical protein  69 
 
 		 108 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.535705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2890  hypothetical protein  69 
 
 		 161 aa  154  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0100  thioredoxin  67 
 
 		 108 aa  153  8e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.380346  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1588  thioredoxin  67 
 
 		 108 aa  152  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174119  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0132  thioredoxin  67 
 
 		 108 aa  152  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0106  thioredoxin  67 
 
 		 108 aa  152  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5224  hypothetical protein  66.04 
 
 		 108 aa  152  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3300  hypothetical protein  66 
 
 		 135 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0119958 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4067  thioredoxin  60 
 
 		 107 aa  148  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1193  putative thioredoxin  61.32 
 
 		 108 aa  143  6e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29280  putative thioredoxin  60.19 
 
 		 108 aa  140  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3969  putative thioredoxin  60.19 
 
 		 108 aa  140  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2655  thioredoxin domain-containing protein  56.19 
 
 		 117 aa  136  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal  0.0984495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4923  putative thiol-disulfide isomerase/thioredoxin  54.37 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.619687  normal  0.0773781 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4726  Thioredoxin domain protein  55.56 
 
 		 108 aa  129  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0943  putative thioredoxin  54.37 
 
 		 112 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1222  thioredoxin-related  58.06 
 
 		 112 aa  127  6e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0192497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4888  thioredoxin domain-containing protein  53.4 
 
 		 110 aa  126  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1972  Thioredoxin domain protein  56.86 
 
 		 111 aa  122  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4190  putative thioredoxin  50.48 
 
 		 109 aa  122  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1746  thioredoxin domain-containing protein  56.86 
 
 		 111 aa  122  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.178268 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0777  thioredoxin domain-containing protein  53.33 
 
 		 111 aa  122  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.387986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1333  hypothetical protein  55.32 
 
 		 131 aa  120  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1907  thioredoxin domain-containing protein  51.55 
 
 		 109 aa  120  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2175  Thioredoxin domain  51.52 
 
 		 107 aa  114  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0983386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3706  thioredoxin domain-containing protein  46.39 
 
 		 112 aa  110  8.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3319  thioredoxin domain-containing protein  44.12 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03441  thioredoxin  50.56 
 
 		 90 aa  107  6e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3801  Thioredoxin domain protein  36 
 
 		 768 aa  56.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0589  thioredoxin domain-containing protein  25.84 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08571  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10300)  25.29 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321852  hitchhiker  0.00174715 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  36.84 
 
 		 222 aa  53.5  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1900  thioredoxin domain-containing protein  33.33 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0850569  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  31.76 
 
 		 105 aa  52.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  34.38 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0894  thioredoxin 1  33.33 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0704884  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0459  Thioredoxin domain protein  33.66 
 
 		 118 aa  50.4  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0621095  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  31.82 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  30.49 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  30.21 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  31.34 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  30.49 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  30.49 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  33.85 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  32.2 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  35.53 
 
 		 406 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  29.63 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  29.27 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  33.33 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  32.5 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5187  Thioredoxin domain protein  37.66 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  28.21 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  28.05 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  35.53 
 
 		 102 aa  47.4  0.00006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  27.27 
 
 		 98 aa  47.8  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  30.77 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  31.25 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  29.41 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  31.88 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0118  thioredoxin  33.77 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  28.24 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  32.95 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  29.89 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  25.24 
 
 		 106 aa  46.2  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  30.3 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  28.24 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  33.77 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  27.59 
 
 		 105 aa  47  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2698  thioredoxin  28.42 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0171911  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  30 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  33.77 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  34.12 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  33.77 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  32.86 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4281  thioredoxin  26.19 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  28.21 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  31.46 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0835  thioredoxin  26.67 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  28.24 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0189  thioredoxin 1  26.97 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.345183  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  33.82 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0311  hypothetical protein  26.97 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2305  thioredoxin  32.94 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.0025384  normal  0.350799 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39568  thioredoxin  26.32 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.187057 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_9576  predicted protein  29.76 
 
 		 100 aa  45.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  27.16 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3287  thioredoxin  27.27 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  30.3 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  27.37 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  30.93 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0443  thioredoxin-like  34.85 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.478708  normal  0.838572 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  27.37 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  31.08 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  27.37 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>