More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4726 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4726  Thioredoxin domain protein  100 
 
 		 108 aa  224  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4067  thioredoxin  62.75 
 
 		 107 aa  144  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4923  putative thiol-disulfide isomerase/thioredoxin  60.58 
 
 		 108 aa  135  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.619687  normal  0.0773781 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4150  hypothetical protein  57.84 
 
 		 108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.535705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2890  hypothetical protein  57.28 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4802  hypothetical protein  57.84 
 
 		 108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3366  hypothetical protein  57.84 
 
 		 108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00258482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4888  thioredoxin domain-containing protein  57.55 
 
 		 110 aa  131  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0100  thioredoxin  58.06 
 
 		 108 aa  130  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.380346  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5143  hypothetical protein  56.86 
 
 		 108 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.709444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1588  thioredoxin  58.06 
 
 		 108 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174119  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0132  thioredoxin  58.06 
 
 		 108 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0106  thioredoxin  58.06 
 
 		 108 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29280  putative thioredoxin  52.78 
 
 		 108 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4109  thioredoxin domain-containing protein  55.56 
 
 		 107 aa  129  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5224  hypothetical protein  55.88 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0943  putative thioredoxin  55.77 
 
 		 112 aa  128  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3969  putative thioredoxin  51.85 
 
 		 108 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5281  Thioredoxin domain  52.53 
 
 		 106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.844315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1193  putative thioredoxin  58.33 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3300  hypothetical protein  54.9 
 
 		 135 aa  124  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0119958 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1336  putative thioredoxin  53 
 
 		 106 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00442557 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1333  hypothetical protein  56.12 
 
 		 131 aa  122  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2655  thioredoxin domain-containing protein  51.43 
 
 		 117 aa  121  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal  0.0984495 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4190  putative thioredoxin  52.48 
 
 		 109 aa  120  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1972  Thioredoxin domain protein  54.17 
 
 		 111 aa  113  6.9999999999999995e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1746  thioredoxin domain-containing protein  54.17 
 
 		 111 aa  113  6.9999999999999995e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.178268 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0777  thioredoxin domain-containing protein  52.08 
 
 		 111 aa  107  8.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.387986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3706  thioredoxin domain-containing protein  46.46 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1222  thioredoxin-related  44.68 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0192497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2175  Thioredoxin domain  47 
 
 		 107 aa  103  7e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0983386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1907  thioredoxin domain-containing protein  45.36 
 
 		 109 aa  101  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3319  thioredoxin domain-containing protein  45.45 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03441  thioredoxin  48.81 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  34.52 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  34.88 
 
 		 104 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  36.05 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0589  thioredoxin domain-containing protein  30.77 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  34.12 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  36.05 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_9576  predicted protein  30.12 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  33.33 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08571  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10300)  28.24 
 
 		 108 aa  51.2  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321852  hitchhiker  0.00174715 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  33.72 
 
 		 104 aa  51.2  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  35.79 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  36.23 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1412  thioredoxin  36.05 
 
 		 104 aa  50.4  0.000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  32.14 
 
 		 104 aa  50.8  0.000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  32.14 
 
 		 102 aa  50.4  0.000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  28.7 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  35.94 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2698  thioredoxin  31.91 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0171911  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  32.14 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  34.57 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26095  predicted protein  30.26 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00850949 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  31.43 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  31.91 
 
 		 108 aa  48.1  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4281  thioredoxin  30.26 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  40 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  29.27 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  35.8 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  31.13 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  29.7 
 
 		 406 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  38.57 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1900  thioredoxin domain-containing protein  34.78 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0850569  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  34.29 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  30.59 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  29.27 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1658  thioredoxin domain-containing protein  32.56 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0579498  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  31.46 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  36.07 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  35.38 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  33.78 
 
 		 108 aa  47.4  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  32.98 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  32.98 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2305  thioredoxin  30 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.0025384  normal  0.350799 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  32.98 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  32.98 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  31.46 
 
 		 115 aa  47.4  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  32.98 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  32.98 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  32.98 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  32.5 
 
 		 107 aa  47  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  31.91 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  33.33 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  28.17 
 
 		 133 aa  47  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  31.91 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7608  predicted protein  34.48 
 
 		 137 aa  47.4  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  32.63 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  31.91 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4857  thioredoxin  31.52 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0651815  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  26.83 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  35 
 
 		 107 aa  47  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_9748  predicted protein  33.33 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.82657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  32.05 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  32.26 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  31.91 
 
 		 108 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  31.91 
 
 		 108 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  35 
 
 		 107 aa  47  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0087  thioredoxin  28.09 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.950509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>