More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4923 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4923  putative thiol-disulfide isomerase/thioredoxin  100 
 
 		 108 aa  221  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.619687  normal  0.0773781 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4067  thioredoxin  64.15 
 
 		 107 aa  144  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4888  thioredoxin domain-containing protein  65.26 
 
 		 110 aa  137  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4150  hypothetical protein  63.37 
 
 		 108 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.535705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4802  hypothetical protein  63.37 
 
 		 108 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3366  hypothetical protein  63.37 
 
 		 108 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00258482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2655  thioredoxin domain-containing protein  59.43 
 
 		 117 aa  135  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal  0.0984495 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5143  hypothetical protein  60.4 
 
 		 108 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.709444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4726  Thioredoxin domain protein  60.58 
 
 		 108 aa  135  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2890  hypothetical protein  63.37 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29280  putative thioredoxin  60 
 
 		 108 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3300  hypothetical protein  61.62 
 
 		 135 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0119958 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0106  thioredoxin  60.61 
 
 		 108 aa  131  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1588  thioredoxin  60.61 
 
 		 108 aa  131  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174119  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0132  thioredoxin  60.61 
 
 		 108 aa  131  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0100  thioredoxin  60.61 
 
 		 108 aa  131  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.380346  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0943  putative thioredoxin  58.49 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4109  thioredoxin domain-containing protein  54.37 
 
 		 107 aa  131  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3969  putative thioredoxin  57.14 
 
 		 108 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1746  thioredoxin domain-containing protein  61.54 
 
 		 111 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.178268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1972  Thioredoxin domain protein  61.54 
 
 		 111 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1336  putative thioredoxin  55.34 
 
 		 106 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00442557 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5281  Thioredoxin domain  55 
 
 		 106 aa  128  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.844315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1193  putative thioredoxin  64.52 
 
 		 108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5224  hypothetical protein  58.42 
 
 		 108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1333  hypothetical protein  56.44 
 
 		 131 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0777  thioredoxin domain-containing protein  55.66 
 
 		 111 aa  124  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.387986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4190  putative thioredoxin  59.6 
 
 		 109 aa  122  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1907  thioredoxin domain-containing protein  52.53 
 
 		 109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3706  thioredoxin domain-containing protein  50.51 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03441  thioredoxin  55.06 
 
 		 90 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1222  thioredoxin-related  50.54 
 
 		 112 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0192497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2175  Thioredoxin domain  52.53 
 
 		 107 aa  110  9e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0983386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3319  thioredoxin domain-containing protein  50.54 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  35.96 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0589  thioredoxin domain-containing protein  28.09 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  34.65 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  31.03 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  33.66 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  33.66 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  27.91 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1412  thioredoxin  34.78 
 
 		 104 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  37.35 
 
 		 406 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0205  thioredoxin, putative  30.19 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.513083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  35.06 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0261  thioredoxin, putative  30.19 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689046 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  29.17 
 
 		 98 aa  53.5  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  34.62 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  33.7 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  34.62 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  33.7 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  31.68 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  35.71 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4857  thioredoxin  39.47 
 
 		 149 aa  51.2  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0651815  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  30.12 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  25.3 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0739  thioredoxin  33.71 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.186683  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  31.46 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  35.38 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  35.38 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3801  Thioredoxin domain protein  35.71 
 
 		 768 aa  50.8  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  38.03 
 
 		 113 aa  50.4  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  38.03 
 
 		 102 aa  50.4  0.000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  31.65 
 
 		 222 aa  50.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  37.1 
 
 		 131 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  31.76 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  33.33 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  30.95 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  36.36 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1648  thioredoxin domain-containing protein  29.57 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0259266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  27.66 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  36.36 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  25.56 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  36.36 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  30.34 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  31.4 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  33.33 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  34.09 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4281  thioredoxin  25.26 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  38.1 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  34.67 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  26.32 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_9576  predicted protein  26.88 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  32.98 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  32.1 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  33.85 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0187  thioredoxin  25.51 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849594 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  36.84 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1123  thioredoxin  36.36 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  36.67 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  34.52 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0496  thioredoxin  23.15 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00525354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  28.7 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1161  thioredoxin  35.29 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  26.44 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  29.89 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  36.51 
 
 		 117 aa  47.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  32.99 
 
 		 282 aa  47.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  31.19 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  31.19 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>