More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1193 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1193  putative thioredoxin  100 
 
 		 108 aa  220  4.9999999999999996e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4109  thioredoxin domain-containing protein  61.32 
 
 		 107 aa  143  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5281  Thioredoxin domain  61.32 
 
 		 106 aa  142  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.844315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1336  putative thioredoxin  61.9 
 
 		 106 aa  141  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00442557 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4888  thioredoxin domain-containing protein  66.67 
 
 		 110 aa  138  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3969  putative thioredoxin  66.32 
 
 		 108 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4067  thioredoxin  63.81 
 
 		 107 aa  134  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29280  putative thioredoxin  66.32 
 
 		 108 aa  134  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5143  hypothetical protein  65.22 
 
 		 108 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.709444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5224  hypothetical protein  62.14 
 
 		 108 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0100  thioredoxin  64.44 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.380346  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4802  hypothetical protein  61.17 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4150  hypothetical protein  61.17 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.535705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3366  hypothetical protein  61.17 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00258482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1588  thioredoxin  64.44 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174119  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2890  hypothetical protein  61.17 
 
 		 161 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3300  hypothetical protein  61.39 
 
 		 135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0119958 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0132  thioredoxin  64.44 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0106  thioredoxin  64.44 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4923  putative thiol-disulfide isomerase/thioredoxin  64.52 
 
 		 108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.619687  normal  0.0773781 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4190  putative thioredoxin  61.05 
 
 		 109 aa  125  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4726  Thioredoxin domain protein  58.33 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0943  putative thioredoxin  60.87 
 
 		 112 aa  121  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2655  thioredoxin domain-containing protein  53.4 
 
 		 117 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal  0.0984495 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1907  thioredoxin domain-containing protein  56.67 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1333  hypothetical protein  56.52 
 
 		 131 aa  113  6.9999999999999995e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3706  thioredoxin domain-containing protein  60.71 
 
 		 112 aa  113  6.9999999999999995e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1222  thioredoxin-related  55.79 
 
 		 112 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0192497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3319  thioredoxin domain-containing protein  53.19 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1746  thioredoxin domain-containing protein  58.06 
 
 		 111 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.178268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1972  Thioredoxin domain protein  58.06 
 
 		 111 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0777  thioredoxin domain-containing protein  56.38 
 
 		 111 aa  107  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.387986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03441  thioredoxin  59.26 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2175  Thioredoxin domain  58.14 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0983386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  29.76 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  32.1 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0894  thioredoxin 1  38.96 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0704884  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  41.1 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  36.05 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0435  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  32.05 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3801  Thioredoxin domain protein  34.67 
 
 		 768 aa  53.5  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0589  thioredoxin domain-containing protein  29.85 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0879  thioredoxin  27.71 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0372  Thioredoxin domain protein  36.14 
 
 		 89 aa  50.4  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.652561  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  38.03 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  33.33 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  28.89 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  30.77 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  31.87 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0496  thioredoxin  25 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00525354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  35.21 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  35.21 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  28.89 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  31.4 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3714  Thioredoxin domain protein  41.33 
 
 		 143 aa  47.4  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0312  Thioredoxin domain protein  30.95 
 
 		 88 aa  47.4  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0739  thioredoxin  30.12 
 
 		 104 aa  47.8  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.186683  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  30.95 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  30 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  26.32 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  37.66 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  33.87 
 
 		 122 aa  47  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0333  thioredoxin-related  33.72 
 
 		 131 aa  47  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  30.43 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39568  thioredoxin  25 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.187057 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4290  Thioredoxin domain protein  41.33 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0729308  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  34.78 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  30.16 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  32.84 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  25 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_9576  predicted protein  27.38 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1123  thioredoxin  35.82 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3070  thioredoxin  31.94 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.990711  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  28.74 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3540  Thioredoxin domain protein  30.59 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  30.99 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  31.71 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  32.86 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1825  thioredoxin  29.23 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000186182  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  25.89 
 
 		 108 aa  45.4  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  27.88 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1563  Thioredoxin domain protein  31.76 
 
 		 100 aa  45.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851055  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3003  hypothetical protein  27.45 
 
 		 108 aa  45.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2864  hypothetical protein  27.45 
 
 		 108 aa  45.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2606  putative thioredoxin-like protein  34.78 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.888104  normal  0.656305 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  28.44 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  28.44 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  31.03 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  30.43 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  33.82 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  28.44 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  29.76 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2305  thioredoxin  30.86 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.0025384  normal  0.350799 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  31.4 
 
 		 106 aa  45.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  29.27 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  28.28 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  31.33 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5761  thioredoxin  33.82 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.626635  normal  0.389703 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  28.12 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  32.84 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>