More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4290 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013744  Htur_4290  Thioredoxin domain protein  100 
 
 		 123 aa  245  1e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0729308  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3714  Thioredoxin domain protein  82.08 
 
 		 143 aa  179  9.000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0459  Thioredoxin domain protein  47.83 
 
 		 118 aa  107  4.0000000000000004e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0621095  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5187  Thioredoxin domain protein  46.53 
 
 		 116 aa  92  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2342  Thioredoxin domain protein  44.09 
 
 		 131 aa  87  7e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.81204  normal  0.184046 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3383  Thioredoxin domain protein  45.1 
 
 		 123 aa  86.3  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.346342  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2305  thioredoxin  38.1 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.0025384  normal  0.350799 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0359  Thioredoxin domain protein  39.58 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0762376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  35.65 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  33.94 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0811  thioredoxin  31.87 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2236  thioredoxin  35.78 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.773662  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  30.84 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3729  thioredoxin  33.64 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.350169  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  32.73 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4220  thioredoxin  34.12 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  36.47 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2062  thioredoxin domain-containing protein  30.1 
 
 		 111 aa  57  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228901  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  32.38 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  32.38 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  32.26 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2304  thioredoxin  34.17 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  35.58 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0818  thioredoxin  29.52 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  33.33 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1430  thioredoxin  42.11 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000656365 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  32.1 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  32.94 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  32.1 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1160  thioredoxin  28.87 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0193016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  35.96 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  32.38 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1129  thioredoxin  28.87 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  36.36 
 
 		 285 aa  55.1  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  34.95 
 
 		 289 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3396  putative thioredoxin  32.93 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.950013  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  34.95 
 
 		 289 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0420  thioredoxin  29.55 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  34.48 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  32.53 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1144  thioredoxin  30.59 
 
 		 421 aa  53.9  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  32.04 
 
 		 290 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  36.05 
 
 		 304 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0618  thioredoxin  33.33 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_002978  WD0879  thioredoxin  29.59 
 
 		 107 aa  52.8  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1995  thioredoxin  30.21 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  33.33 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2362  thioredoxin  30.21 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1161  thioredoxin  37.61 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  34.88 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  32.97 
 
 		 290 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2134  thioredoxin  35.23 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.408487  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  36.47 
 
 		 108 aa  52  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  31.33 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  32.97 
 
 		 290 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  35.23 
 
 		 290 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  33.33 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  34.29 
 
 		 108 aa  52  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  33 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  34.88 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3596  thioredoxin  43.48 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  32.97 
 
 		 290 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  34.88 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  31.46 
 
 		 109 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  34.94 
 
 		 107 aa  51.6  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  35.62 
 
 		 123 aa  51.6  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3727  Thioredoxin domain  37.18 
 
 		 156 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  27.08 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  30.23 
 
 		 107 aa  51.6  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2977  thioredoxin  31.76 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000101834  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  37.21 
 
 		 104 aa  51.2  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2429  thioredoxin  34.69 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4857  thioredoxin  37.93 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0651815  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  26.04 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  30.39 
 
 		 146 aa  50.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  42.03 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3665  thioredoxin  42.03 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0303  thioredoxin  31.51 
 
 		 126 aa  50.8  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4260  thioredoxin  28 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  30.85 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  33.8 
 
 		 154 aa  50.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  34.62 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  33.33 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  34.34 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  33.71 
 
 		 406 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  34.94 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  34.04 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  30.59 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  35.96 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  29.7 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3933  thioredoxin  31.76 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  31.11 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  30.1 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  30.68 
 
 		 109 aa  50.4  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  31.46 
 
 		 104 aa  50.4  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  34.09 
 
 		 290 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  32.22 
 
 		 106 aa  50.8  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  31.4 
 
 		 116 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  30.39 
 
 		 146 aa  50.8  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  30.85 
 
 		 120 aa  50.4  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>