More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0359 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0359  Thioredoxin domain protein  100 
 
 		 111 aa  220  4.9999999999999996e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0762376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3383  Thioredoxin domain protein  52.08 
 
 		 123 aa  105  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.346342  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0459  Thioredoxin domain protein  48.62 
 
 		 118 aa  102  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0621095  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2342  Thioredoxin domain protein  54.32 
 
 		 131 aa  95.5  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.81204  normal  0.184046 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5187  Thioredoxin domain protein  47 
 
 		 116 aa  90.9  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3714  Thioredoxin domain protein  46.07 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4290  Thioredoxin domain protein  39.58 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0729308  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  39.25 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4220  thioredoxin  30.84 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2305  thioredoxin  39.47 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.0025384  normal  0.350799 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  35.24 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  35 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  34.41 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0189  thioredoxin 1  32.89 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.345183  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  33.33 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  33.33 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  34.41 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  34.41 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  33.33 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  33.33 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  29.79 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  31.52 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2201  thioredoxin  36.59 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0838449  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  40.79 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3003  hypothetical protein  34.07 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2864  hypothetical protein  34.07 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  31.52 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  29.79 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  35.53 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0460  thioredoxin  39.47 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.810082  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  29.67 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4854  thioredoxin  29.03 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.188061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  38.16 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  28.72 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  31.11 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  36 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  34.67 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  38.16 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  34.67 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  34.67 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  33.33 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  34.67 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3933  thioredoxin  33.78 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  34.67 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  34.67 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  34.67 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  36.99 
 
 		 259 aa  54.7  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  34.67 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  30.34 
 
 		 238 aa  54.3  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5011  thioredoxin  33.78 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  34.67 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  34.67 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  34.67 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  34.67 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  34.67 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  34.67 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  34.67 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  28.57 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  31.03 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  38.16 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  30.77 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  34.67 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0087  thioredoxin  34.21 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  36.76 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  31.11 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  32.63 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  39.47 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  37.33 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  30.77 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  34.21 
 
 		 104 aa  53.5  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  34.52 
 
 		 106 aa  53.5  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4281  thioredoxin  33.33 
 
 		 104 aa  52.8  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  36.84 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  36.84 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  36.84 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0818  thioredoxin  27.06 
 
 		 136 aa  52.8  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1411  thioredoxin  29.27 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  34.21 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  36.84 
 
 		 108 aa  52.8  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  36.84 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  39.47 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1093  thioredoxin  31.76 
 
 		 268 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0251638  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  36.84 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  32 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  35.53 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  32.93 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  29.87 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  32.53 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  29.59 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  36.84 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  36.84 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  31.33 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  36.84 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1675  thioredoxin  34.15 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  27.96 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  35.71 
 
 		 108 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  35.71 
 
 		 108 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>