More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3383 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3383  Thioredoxin domain protein  100 
 
 
123 aa  253  6e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.346342  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5187  Thioredoxin domain protein  53.85 
 
 
116 aa  132  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2342  Thioredoxin domain protein  56.76 
 
 
131 aa  115  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.81204  normal  0.184046 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0459  Thioredoxin domain protein  50.5 
 
 
118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0621095  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0359  Thioredoxin domain protein  51.49 
 
 
111 aa  106  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0762376  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4290  Thioredoxin domain protein  44.86 
 
 
123 aa  90.1  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0729308  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3714  Thioredoxin domain protein  43.81 
 
 
143 aa  88.6  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  33.33 
 
 
120 aa  72  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  37.38 
 
 
119 aa  71.2  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  33.64 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4220  thioredoxin  33.33 
 
 
119 aa  62.8  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  30.39 
 
 
108 aa  62  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  30.39 
 
 
108 aa  62  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  30.39 
 
 
108 aa  62  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  30.39 
 
 
108 aa  62  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  30.39 
 
 
108 aa  62  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  30.39 
 
 
108 aa  62  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  30.39 
 
 
108 aa  62  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  30.39 
 
 
146 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  31.68 
 
 
109 aa  60.8  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  29.41 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  29.41 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2305  thioredoxin  35 
 
 
113 aa  59.3  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.0025384  normal  0.350799 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  29.41 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  29.41 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  29.41 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  29.41 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  29.41 
 
 
146 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  31.31 
 
 
108 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4905  thioredoxin  28.43 
 
 
110 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0818  thioredoxin  28.32 
 
 
136 aa  57.8  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0189  thioredoxin 1  24.27 
 
 
108 aa  57.8  0.00000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.345183  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  34.02 
 
 
289 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  34.02 
 
 
289 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  30.95 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3003  hypothetical protein  29.29 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2864  hypothetical protein  29.29 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  27.18 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  27.18 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  30.95 
 
 
108 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  27.18 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  30.95 
 
 
108 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  27.45 
 
 
109 aa  56.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  32.38 
 
 
259 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  29.29 
 
 
109 aa  54.7  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2347  thioredoxin  28.85 
 
 
147 aa  55.1  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0135047  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  28.16 
 
 
108 aa  54.3  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  32.18 
 
 
290 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  29 
 
 
104 aa  53.9  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  29.13 
 
 
110 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  29.13 
 
 
110 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1772  thioredoxin  32 
 
 
105 aa  53.5  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000134775  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  25.24 
 
 
108 aa  53.5  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  26 
 
 
108 aa  53.5  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_9748  predicted protein  29.41 
 
 
108 aa  53.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.82657  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2639  thioredoxin  26.47 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0886828  hitchhiker  0.00590655 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  29.41 
 
 
107 aa  52.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  26.73 
 
 
106 aa  52.4  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  25.24 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  31.96 
 
 
104 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  29.41 
 
 
107 aa  52.8  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  29.41 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  25.24 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1984  glutaredoxin 2  26.19 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  28.28 
 
 
110 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  25.24 
 
 
109 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  25.24 
 
 
109 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  25.24 
 
 
109 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  25.24 
 
 
109 aa  51.6  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  25.24 
 
 
109 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  25.24 
 
 
109 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  31.87 
 
 
289 aa  51.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  30.77 
 
 
290 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  25.24 
 
 
109 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  25.24 
 
 
108 aa  51.6  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  25.24 
 
 
109 aa  52  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  25.24 
 
 
109 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  25.24 
 
 
109 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  25.24 
 
 
109 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  25.24 
 
 
109 aa  52  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  25.24 
 
 
109 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  25.24 
 
 
109 aa  52  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  33.33 
 
 
108 aa  51.6  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  25.24 
 
 
109 aa  52  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  30.77 
 
 
290 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  29.13 
 
 
108 aa  51.6  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  30.77 
 
 
290 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  33.33 
 
 
290 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  30.77 
 
 
290 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  23.53 
 
 
133 aa  51.2  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  24.27 
 
 
145 aa  51.2  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  28.42 
 
 
109 aa  50.8  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3446  thioredoxin family protein, selenocysteine-containing  34.48 
 
 
150 aa  51.2  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.238909  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  26.21 
 
 
112 aa  51.2  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  27.18 
 
 
108 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2792  thioredoxin  32 
 
 
307 aa  51.2  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.284427 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3596  thioredoxin  35.64 
 
 
150 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  25.24 
 
 
108 aa  50.4  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0044  thioredoxin  25.53 
 
 
139 aa  50.4  0.000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  25.24 
 
 
108 aa  50.8  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>