144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1984 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1984  glutaredoxin 2  100 
 
 
92 aa  187  2.9999999999999997e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0312  Thioredoxin domain protein  37.65 
 
 
88 aa  57.8  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2342  Thioredoxin domain protein  30.12 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.81204  normal  0.184046 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1798  thioredoxin domain-containing protein  37.18 
 
 
90 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.317909  normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  39.51 
 
 
98 aa  54.7  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1563  Thioredoxin domain protein  35.71 
 
 
100 aa  53.9  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851055  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5187  Thioredoxin domain protein  31.03 
 
 
116 aa  53.9  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0372  Thioredoxin domain protein  30.95 
 
 
89 aa  53.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.652561  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  33.33 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3383  Thioredoxin domain protein  26.19 
 
 
123 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.346342  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  30.12 
 
 
109 aa  50.4  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  30.12 
 
 
98 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3540  Thioredoxin domain protein  33.33 
 
 
89 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  30.95 
 
 
127 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  30.95 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1024  Thioredoxin domain protein  32.93 
 
 
91 aa  49.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0721  thioredoxin  37.68 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0757  thioredoxin  37.68 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  28.57 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  30.95 
 
 
108 aa  47.4  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  28.57 
 
 
160 aa  47  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0822  thioredoxin, putative  36.23 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.678614  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0671  thioredoxin  36.23 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0659  thioredoxin  36.23 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  27.5 
 
 
98 aa  46.2  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0828  putative thioredoxin  36.23 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7466400000000003e-54 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0818  thioredoxin  28.92 
 
 
136 aa  47  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  30.12 
 
 
88 aa  46.6  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  26.19 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  29.89 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  26.51 
 
 
107 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  29.63 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0189  thioredoxin 1  30.77 
 
 
108 aa  45.4  0.0002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.345183  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  27.71 
 
 
107 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1978  thioredoxin  27.06 
 
 
111 aa  45.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.274716  normal  0.21653 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  27.38 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  25 
 
 
107 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  24.71 
 
 
112 aa  44.7  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  25 
 
 
107 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  28.74 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  28.74 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3175  thioredoxin-related  28.4 
 
 
90 aa  44.3  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  27.38 
 
 
120 aa  44.7  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  28.57 
 
 
110 aa  44.3  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  22.62 
 
 
110 aa  44.3  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  31.88 
 
 
107 aa  44.3  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  27.38 
 
 
109 aa  44.3  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  31.88 
 
 
107 aa  44.3  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0636  thioredoxin domain-containing protein  33.93 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.196836  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0920  putative thioredoxin  34.78 
 
 
139 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  28.57 
 
 
105 aa  43.9  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1793  thioredoxin  25 
 
 
107 aa  43.9  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99578  decreased coverage  0.00274383 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  27.5 
 
 
106 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  22.62 
 
 
107 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  29.76 
 
 
107 aa  43.5  0.0009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  22.62 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2201  thioredoxin  27.06 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0838449  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1675  thioredoxin  25.88 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  22.62 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  22.62 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10831  thioredoxin thiX  30.86 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220535 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  23.81 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  30 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  28.57 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  26.19 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  28.57 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1229  thioredoxin  21.11 
 
 
268 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.223518 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  28.57 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  30.95 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  25.88 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  26.25 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  23.81 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  28.95 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1507  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  26.74 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000161459  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  27.38 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1362  thioredoxin  24.14 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  28.57 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  28.57 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  26.19 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1658  thioredoxin domain-containing protein  27.06 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0579498  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  28.57 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  28.57 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  28.57 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1614  thioredoxin  25.58 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  26.19 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1645  glutaredoxin 2  31.76 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  26.19 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  27.16 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4107  thioredoxin  23.81 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794835 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  27.38 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0459  Thioredoxin domain protein  25.93 
 
 
114 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  26.19 
 
 
108 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  27.16 
 
 
106 aa  41.6  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  25 
 
 
107 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  25 
 
 
124 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  26.19 
 
 
108 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  25 
 
 
107 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  28.95 
 
 
108 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  30.43 
 
 
107 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  30.43 
 
 
106 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>