More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0459 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0459  Thioredoxin domain protein  100 
 
 		 118 aa  233  8e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0621095  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2342  Thioredoxin domain protein  61.39 
 
 		 131 aa  122  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.81204  normal  0.184046 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5187  Thioredoxin domain protein  53.33 
 
 		 116 aa  114  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4290  Thioredoxin domain protein  47.83 
 
 		 123 aa  107  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0729308  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3383  Thioredoxin domain protein  50 
 
 		 123 aa  107  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.346342  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3714  Thioredoxin domain protein  50 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0359  Thioredoxin domain protein  48.62 
 
 		 111 aa  102  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0762376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  34.91 
 
 		 119 aa  73.6  0.0000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0818  thioredoxin  33.64 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2305  thioredoxin  37.5 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.0025384  normal  0.350799 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3729  thioredoxin  35.23 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.350169  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4220  thioredoxin  34.29 
 
 		 119 aa  67  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  34.62 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  35.16 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  37.23 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  36.56 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  36.27 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  31.18 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  34.31 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  39.29 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  35.51 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  34.31 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  34.31 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  39.36 
 
 		 259 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  31.37 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  34 
 
 		 290 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3003  hypothetical protein  35 
 
 		 108 aa  60.1  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2864  hypothetical protein  35 
 
 		 108 aa  60.1  0.000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  34.88 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  34.88 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  35 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0711  thioredoxin  30.84 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0044  thioredoxin  29.63 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2134  thioredoxin  38.46 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.408487  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  33 
 
 		 290 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  37.65 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0887  thioredoxin 2  34.41 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00834128  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3151  thioredoxin  34.09 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2347  thioredoxin  30.77 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0135047  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  30.12 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  36.14 
 
 		 290 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  29.81 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1247  thioredoxin  33.33 
 
 		 113 aa  57  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000845354  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  33.33 
 
 		 290 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  32.14 
 
 		 290 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  33.68 
 
 		 257 aa  57  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  33.33 
 
 		 290 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  38.37 
 
 		 107 aa  57  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7798  thioredoxin  39.13 
 
 		 146 aa  57  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1995  thioredoxin  28.57 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  33.7 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  33.33 
 
 		 106 aa  57  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  29.41 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  30.95 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  32.04 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2362  thioredoxin  28.57 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  29 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  35.29 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  30.39 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  31.68 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  33.33 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0239  thioredoxin  38.46 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214788  normal  0.233282 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0189  thioredoxin 1  37.5 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.345183  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  33.73 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2304  thioredoxin  34.62 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0776  thioredoxin  30.69 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.116689 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2236  thioredoxin  33.64 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.773662  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1161  thioredoxin  32.04 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1670  thioredoxin  25 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  27.88 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  29.13 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  31 
 
 		 289 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  29.7 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  31.76 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  32.56 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  28.41 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  30.12 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  33.33 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  30.39 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  30.23 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  29.27 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  27.88 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  30.68 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3335  thioredoxin 2  35.8 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  32.56 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  29.27 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4107  thioredoxin  30.19 
 
 		 141 aa  53.5  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  34.72 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  30.34 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  34.78 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  26.92 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  33.33 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0420  thioredoxin  25 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  26.21 
 
 		 107 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  37.7 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3491  thioredoxin 2  33.33 
 
 		 139 aa  52.8  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1320  thioredoxin  33.33 
 
 		 105 aa  53.5  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.113501  normal  0.148362 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  28.3 
 
 		 109 aa  53.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  32.53 
 
 		 105 aa  53.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>