More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0776 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0776  thioredoxin  100 
 
 
138 aa  281  2.0000000000000002e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.116689 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  68.18 
 
 
135 aa  196  6e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0044  thioredoxin  52.21 
 
 
139 aa  152  2e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1343  thioredoxin  39.69 
 
 
133 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.160568  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  44.07 
 
 
133 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2493  thioredoxin  41.22 
 
 
154 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  49.5 
 
 
105 aa  107  5e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  47.42 
 
 
112 aa  106  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  47.06 
 
 
105 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  49.5 
 
 
104 aa  104  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  45.1 
 
 
105 aa  103  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  49.5 
 
 
104 aa  103  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  42.45 
 
 
109 aa  102  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  48.51 
 
 
104 aa  102  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  49.5 
 
 
104 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  49.5 
 
 
104 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  45 
 
 
106 aa  102  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  45.83 
 
 
110 aa  101  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  46.73 
 
 
109 aa  101  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  46.08 
 
 
106 aa  101  4e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1670  thioredoxin  42.57 
 
 
131 aa  100  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  39.66 
 
 
125 aa  100  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  46.15 
 
 
109 aa  100  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  44.44 
 
 
109 aa  100  8e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  49.44 
 
 
109 aa  100  9e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  48.54 
 
 
110 aa  100  9e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  50.54 
 
 
106 aa  100  9e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0097  thioredoxin  38.4 
 
 
149 aa  99.4  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0227  thioredoxin  44.79 
 
 
138 aa  99.8  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.589442  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  46.94 
 
 
108 aa  99  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  42.71 
 
 
114 aa  99  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  48.04 
 
 
115 aa  99.4  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  48.81 
 
 
108 aa  99  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  42.99 
 
 
109 aa  99  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4710  thioredoxin  43.43 
 
 
105 aa  98.6  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.015363  normal  0.0508397 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  43.27 
 
 
107 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1614  thioredoxin  35.38 
 
 
132 aa  98.6  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  44.9 
 
 
114 aa  98.2  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  48.96 
 
 
108 aa  98.2  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  46.46 
 
 
109 aa  98.6  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  47.52 
 
 
104 aa  98.6  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  47.31 
 
 
107 aa  97.8  4e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  47.31 
 
 
107 aa  97.8  4e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  45.74 
 
 
109 aa  97.8  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1412  thioredoxin  47 
 
 
104 aa  97.4  5e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  46.24 
 
 
110 aa  97.1  7e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  42.86 
 
 
107 aa  97.1  7e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  48.45 
 
 
109 aa  96.7  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  40.4 
 
 
110 aa  96.7  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  46.94 
 
 
107 aa  96.7  9e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  46.24 
 
 
107 aa  95.9  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  46.24 
 
 
107 aa  96.7  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  49.47 
 
 
104 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  42.72 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  42.72 
 
 
124 aa  95.5  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  47.31 
 
 
106 aa  95.5  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  47.92 
 
 
110 aa  95.5  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  45.83 
 
 
117 aa  95.5  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  42.16 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  44.21 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  38.1 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  44.21 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  47.37 
 
 
104 aa  94.7  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  47.37 
 
 
104 aa  94.7  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  43.27 
 
 
109 aa  94.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  42.86 
 
 
107 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  42.86 
 
 
107 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  45.26 
 
 
109 aa  94.4  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0711  thioredoxin  37.5 
 
 
138 aa  94.4  5e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  42.86 
 
 
107 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  40.57 
 
 
110 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  41.18 
 
 
148 aa  94  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  40.57 
 
 
107 aa  94  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  44.33 
 
 
109 aa  94  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  44.33 
 
 
109 aa  94  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  43.14 
 
 
106 aa  94  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  36.03 
 
 
150 aa  94  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  39.25 
 
 
108 aa  93.6  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  40.59 
 
 
106 aa  93.6  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  42.71 
 
 
104 aa  93.6  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  42.11 
 
 
223 aa  93.6  9e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  45.54 
 
 
105 aa  93.6  9e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  39.25 
 
 
108 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  39.25 
 
 
108 aa  92.8  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  42.72 
 
 
107 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  39.62 
 
 
110 aa  92.8  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  42.31 
 
 
107 aa  92.8  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  43.43 
 
 
107 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  39.25 
 
 
108 aa  92.8  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  39.25 
 
 
108 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  40.78 
 
 
107 aa  92.8  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  43.43 
 
 
107 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  39.25 
 
 
108 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  39.25 
 
 
108 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  39.25 
 
 
108 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  39.25 
 
 
108 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  39.25 
 
 
108 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  39.25 
 
 
108 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  39.25 
 
 
108 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1129  thioredoxin  37.31 
 
 
137 aa  92.8  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>