More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3714 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013923  Nmag_3714  Thioredoxin domain protein  100 
 
 
143 aa  286  8e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4290  Thioredoxin domain protein  77.88 
 
 
123 aa  181  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0729308  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0459  Thioredoxin domain protein  49.06 
 
 
118 aa  105  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0621095  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5187  Thioredoxin domain protein  45.63 
 
 
116 aa  91.3  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3383  Thioredoxin domain protein  43.27 
 
 
123 aa  85.1  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.346342  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2342  Thioredoxin domain protein  50 
 
 
131 aa  78.2  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.81204  normal  0.184046 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0359  Thioredoxin domain protein  46.07 
 
 
111 aa  75.1  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0762376  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0811  thioredoxin  35.96 
 
 
105 aa  68.9  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3729  thioredoxin  29.5 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.350169  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2305  thioredoxin  35.19 
 
 
113 aa  67.4  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.0025384  normal  0.350799 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  35.96 
 
 
120 aa  65.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  34.71 
 
 
259 aa  63.9  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0818  thioredoxin  27.41 
 
 
136 aa  63.5  0.0000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  33.94 
 
 
119 aa  62.8  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2236  thioredoxin  34.34 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.773662  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1995  thioredoxin  32.32 
 
 
144 aa  60.1  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2362  thioredoxin  32.32 
 
 
144 aa  60.1  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  37.21 
 
 
107 aa  60.1  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  37.21 
 
 
107 aa  60.1  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  37.21 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  31.68 
 
 
109 aa  58.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4220  thioredoxin  36.59 
 
 
119 aa  58.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  35.29 
 
 
102 aa  58.2  0.00000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  34.52 
 
 
119 aa  57.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  35.11 
 
 
289 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  35.11 
 
 
289 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  39.77 
 
 
285 aa  57  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  35.23 
 
 
290 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  33.75 
 
 
107 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  33.75 
 
 
107 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2304  thioredoxin  39.08 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258464  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  33.75 
 
 
107 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  34 
 
 
159 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  30.97 
 
 
290 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2977  thioredoxin  32.94 
 
 
146 aa  55.5  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000101834  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  33.63 
 
 
290 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0420  thioredoxin  23.97 
 
 
142 aa  54.7  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  37.18 
 
 
304 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  34.88 
 
 
116 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  33.73 
 
 
107 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2429  thioredoxin  35.11 
 
 
107 aa  54.3  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3396  putative thioredoxin  35.14 
 
 
104 aa  53.9  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.950013  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0239  thioredoxin  28.75 
 
 
159 aa  53.9  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214788  normal  0.233282 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1144  thioredoxin  30.68 
 
 
421 aa  53.9  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  31.36 
 
 
259 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  33.67 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  37.8 
 
 
110 aa  53.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  35.62 
 
 
123 aa  53.1  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1161  thioredoxin  39.08 
 
 
146 aa  53.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403386  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  33.67 
 
 
120 aa  52.8  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  35.63 
 
 
104 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  31.11 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2347  thioredoxin  34.48 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0135047  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  31.87 
 
 
290 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0618  thioredoxin  36.78 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  31.87 
 
 
290 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1129  thioredoxin  29.63 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  31.87 
 
 
290 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  39.08 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  32.26 
 
 
290 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  32 
 
 
106 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0456  thioredoxin  31.25 
 
 
165 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1160  thioredoxin  29.63 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0193016  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  37.18 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  36.46 
 
 
145 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4857  thioredoxin  34.62 
 
 
149 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0651815  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  33.75 
 
 
106 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  31.58 
 
 
108 aa  51.2  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2134  thioredoxin  35.96 
 
 
139 aa  51.2  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.408487  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  32.04 
 
 
290 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  31.86 
 
 
289 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  33.33 
 
 
110 aa  51.2  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  29.7 
 
 
145 aa  50.8  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  34.83 
 
 
406 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  31.91 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  38.1 
 
 
108 aa  50.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  37.7 
 
 
124 aa  50.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  34.52 
 
 
104 aa  50.4  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  30.1 
 
 
107 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  34.52 
 
 
104 aa  50.8  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  34.52 
 
 
104 aa  50.8  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2293  Thioredoxin domain  32.74 
 
 
108 aa  50.4  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.126467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  32.5 
 
 
119 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  36.49 
 
 
105 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  38.46 
 
 
109 aa  50.4  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  34.09 
 
 
104 aa  50.4  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  31.33 
 
 
107 aa  50.4  0.000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  35.96 
 
 
106 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  33.68 
 
 
109 aa  50.4  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  34.33 
 
 
269 aa  50.1  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  32.5 
 
 
106 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  36.76 
 
 
107 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4260  thioredoxin  29.59 
 
 
105 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  34.09 
 
 
104 aa  49.7  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1254  thioredoxin  30 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  30.67 
 
 
109 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1670  thioredoxin  22.86 
 
 
131 aa  49.7  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1129  thioredoxin  34.62 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  35.06 
 
 
109 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  35.06 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.150927 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>