More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2293 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2293  Thioredoxin domain  100 
 
 		 108 aa  218  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.126467 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02900  thioredoxin  61.54 
 
 		 108 aa  142  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0540  thioredoxin  55.56 
 
 		 108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0477  thioredoxin domain-containing protein  55.56 
 
 		 108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2305  thioredoxin  34.34 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.0025384  normal  0.350799 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0835  thioredoxin  33.98 
 
 		 102 aa  60.1  0.000000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  36.19 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  36.19 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0187  thioredoxin  27.37 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849594 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  33.65 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  33.64 
 
 		 406 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  34.41 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  33.94 
 
 		 290 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  33.94 
 
 		 290 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  34.41 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  34.41 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1412  thioredoxin  35.16 
 
 		 104 aa  52  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  33.33 
 
 		 289 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  33.94 
 
 		 290 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  33.94 
 
 		 290 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl178  thioredoxin  25.24 
 
 		 102 aa  51.6  0.000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0145  cytochrome C biogenesis protein transmembrane region  37.5 
 
 		 570 aa  51.6  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3714  Thioredoxin domain protein  33.67 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0118  thioredoxin  38.54 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  33.33 
 
 		 107 aa  50.4  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  30.28 
 
 		 290 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  32.65 
 
 		 106 aa  50.4  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  33.33 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  32.11 
 
 		 289 aa  49.7  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  26.88 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4290  Thioredoxin domain protein  36.26 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0729308  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0239  thioredoxin  32.67 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214788  normal  0.233282 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  33.03 
 
 		 290 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  36.05 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  29.91 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3596  thioredoxin  37.35 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  30.3 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0762  thioredoxin  30.84 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000561264  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2429  thioredoxin  29.9 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  31.63 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3665  thioredoxin  40.28 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  40.28 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  33.33 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  31.94 
 
 		 107 aa  47.8  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0847  thioredoxin domain-containing protein  28.7 
 
 		 106 aa  47.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00144466  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  31.94 
 
 		 107 aa  47.8  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0830  thioredoxin domain-containing protein  28.7 
 
 		 106 aa  47.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0432193  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3155  hypothetical protein  35.71 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.170473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0189  thioredoxin 1  28.71 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.345183  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  30.85 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3729  thioredoxin  31.46 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.350169  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  29.25 
 
 		 108 aa  47  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0036  thioredoxin  29.35 
 
 		 108 aa  47  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0705575 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  28.16 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  31.25 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0483  thioredoxin, putative  25.49 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  31.19 
 
 		 290 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2056  divalent cation transporter  34.07 
 
 		 575 aa  46.6  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000288452  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  31.19 
 
 		 290 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1990  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35 
 
 		 690 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0971159  normal  0.236274 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  34.12 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  35.19 
 
 		 287 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  26.85 
 
 		 108 aa  47  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0333  thioredoxin-related  32.65 
 
 		 131 aa  47  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1003  thioredoxin  29.13 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0352077  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  32.53 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4222  thioredoxin  31 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0161465  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00610  thioredoxin  31.25 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  30.61 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  24.74 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5124  thioredoxin  27.78 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5215  thioredoxin  27.78 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1717  thioredoxin  27.62 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5243  thioredoxin  28.43 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  27.36 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  31.07 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0233  thioredoxin 1  28.74 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.362513  normal  0.185715 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  29.17 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  32.53 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  32.5 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  29.41 
 
 		 119 aa  45.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0894  thioredoxin 1  32.14 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0704884  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  29.17 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5038  thioredoxin  29.91 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  29.17 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0737  thioredoxin  28.92 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942767  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  29.17 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1151  thioredoxin  31.25 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  27.88 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  29.17 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  29.17 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  29.17 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  32.18 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3070  thioredoxin  28.42 
 
 		 105 aa  45.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.990711  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  32.18 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3036  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.73 
 
 		 731 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0875816 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  28.57 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  32.1 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>