More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0333 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0333  thioredoxin-related  100 
 
 		 131 aa  261  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3285  putative thioredoxin  45.11 
 
 		 138 aa  121  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.342326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5136  Thioredoxin domain  35.24 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.328233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0946  Thioredoxin domain protein  38.18 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000235523 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5437  putative thioredoxin (H-type,TRX-H)  35.71 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  hitchhiker  0.00313052 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4595  thioredoxin-related  38.1 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.334879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2560  thioredoxin domain-containing protein  32.84 
 
 		 131 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.571192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2722  thioredoxin domain-containing protein  33.04 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0580222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2109  Thioredoxin domain  32.33 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.63713  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3525  Thioredoxin domain protein  35.54 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4601  Thioredoxin domain  35.54 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3389  putative thioredoxin (H-type,TRX-H)  30.77 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1773  thioredoxin domain-containing protein  34.35 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2976  thioredoxin domain-containing protein  34.59 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1598  hypothetical protein  31.58 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226786  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  31.68 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  34.17 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  35.35 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  33.04 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2513  thioredoxin domain-containing protein  30.7 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105118  normal  0.435938 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3155  hypothetical protein  33.03 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.170473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1437  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  31.68 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00152159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  30.77 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1738  Thioredoxin domain  32.06 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.749275  normal  0.660647 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  36.78 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1320  thioredoxin  35.87 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.113501  normal  0.148362 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  31.46 
 
 		 290 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  29.67 
 
 		 406 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  32.58 
 
 		 290 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  29.9 
 
 		 108 aa  51.6  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  33.71 
 
 		 289 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  36.17 
 
 		 119 aa  51.2  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  33.71 
 
 		 289 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_9748  predicted protein  35.53 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.82657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4142  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  41.77 
 
 		 581 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3763  thioredoxin  35.16 
 
 		 105 aa  50.8  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000512539  normal  0.0469932 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  34.78 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3325  Thioredoxin domain protein  33.71 
 
 		 176 aa  51.2  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000131659 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  28.28 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  32.98 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  27.03 
 
 		 223 aa  50.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0748  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane protein  38.98 
 
 		 724 aa  50.4  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00532426  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  30.3 
 
 		 98 aa  50.4  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  31.53 
 
 		 108 aa  50.4  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  30.43 
 
 		 88 aa  50.1  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0205  thioredoxin, putative  27.18 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.513083  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  34.48 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0261  thioredoxin, putative  27.18 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689046 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0311  hypothetical protein  32.22 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  31.07 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  32.61 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_9576  predicted protein  29.7 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  31.96 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0123  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  40.96 
 
 		 591 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0310589 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0135  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  39.78 
 
 		 596 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276724  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2158  thioredoxin  35.37 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0156  thiol-disulfide interchange protein DsbD-like protein  42.37 
 
 		 748 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  31.46 
 
 		 290 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  29.59 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  27.43 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  29.17 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  27.43 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3801  Thioredoxin domain protein  31.37 
 
 		 768 aa  48.5  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  27.27 
 
 		 109 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  31.4 
 
 		 88 aa  48.9  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0762  thioredoxin  27.43 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000561264  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  30 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  26.8 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0147  thioredoxin 1  28.43 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  27.43 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2236  thioredoxin  30.95 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.773662  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  31.82 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1878  Thioredoxin domain protein  32.03 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  33.66 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  27.55 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  28.44 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  32.95 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4150  hypothetical protein  34.44 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.535705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0508  Thioredoxin domain protein  38.67 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0481603  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4802  hypothetical protein  34.44 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  30 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  34.15 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3366  hypothetical protein  34.44 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00258482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0210  thioredoxin  29.17 
 
 		 108 aa  47.4  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0376  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  40 
 
 		 715 aa  47.8  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.64367  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1193  putative thioredoxin  33.72 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  35.96 
 
 		 113 aa  47  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00170  Thioredoxin (Trx) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P29429]  34.83 
 
 		 189 aa  46.6  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145032  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  36.36 
 
 		 102 aa  47  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  29.21 
 
 		 290 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  30 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  32.65 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  27.08 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2293  Thioredoxin domain  32.69 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.126467 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  27.68 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  29.21 
 
 		 290 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  29.21 
 
 		 290 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1252  thioredoxin domain-containing protein  32.18 
 
 		 106 aa  46.2  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000389642  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  29.21 
 
 		 290 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  28.83 
 
 		 286 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>