More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1252 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1252  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 106 aa  218  3e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000389642  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1437  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  62.39 
 
 		 109 aa  147  6e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00152159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2743  Thioredoxin domain protein  61.05 
 
 		 104 aa  130  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127191  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4811  thioredoxin family protein  54.72 
 
 		 104 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4589  thioredoxin family protein  54.72 
 
 		 104 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000336383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4426  thioredoxin  54.72 
 
 		 104 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0430  thioredoxin family protein  54.72 
 
 		 104 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4945  thioredoxin family protein  54.72 
 
 		 104 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4806  thioredoxin family protein  54.72 
 
 		 104 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.707229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4444  thioredoxin  54.72 
 
 		 104 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201921  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4525  thioredoxin domain-containing protein  53.77 
 
 		 104 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142753  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4827  thioredoxin family protein  53.77 
 
 		 104 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0619703  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3355  thioredoxin domain-containing protein  54.72 
 
 		 104 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4836  thioredoxin family protein  52.83 
 
 		 104 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0177  thioredoxin family protein  54.9 
 
 		 107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.366705  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1825  thioredoxin  58.43 
 
 		 104 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000186182  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0435  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  56.67 
 
 		 105 aa  107  6e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1834  thioredoxin domain-containing protein  43.43 
 
 		 103 aa  100  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.339161  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1799  thioredoxin domain-containing protein  43.43 
 
 		 103 aa  100  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0885  Thioredoxin domain protein  47.83 
 
 		 106 aa  99  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1304  thioredoxin, putative  38.38 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000360749  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1807  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  40.23 
 
 		 108 aa  82.4  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.132216  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0483  thioredoxin, putative  38.83 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1660  Thioredoxin domain protein  37.11 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0830  thioredoxin domain-containing protein  36.63 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0432193  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0847  thioredoxin domain-containing protein  36.63 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00144466  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0794  Thioredoxin domain protein  35.05 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1625  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  35.79 
 
 		 110 aa  72  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000722607  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2344  thioredoxin family protein  39.02 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.397592  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2090  thioredoxin  39.02 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2293  thioredoxin  39.02 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2128  thioredoxin domain-containing protein  39.02 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.831253  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2419  thioredoxin family protein  39.02 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1701  thioredoxin domain-containing protein  39.02 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3031  thioredoxin  39.02 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2094  thioredoxin  39.02 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000532276  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2336  thioredoxin family protein  39.02 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2156  thioredoxin family protein  37.8 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176997  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31720  thioredoxin o  34.83 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.998916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2311  thioredoxin family protein  37.8 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0205  thioredoxin, putative  36.05 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.513083  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0261  thioredoxin, putative  36.05 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689046 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  37.14 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26095  predicted protein  32.61 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00850949 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0097  thioredoxin  35.29 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1129  thioredoxin  34.04 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  32.26 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00170  Thioredoxin (Trx) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P29429]  32 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  33.02 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  33.02 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  35.71 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  36.36 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  35.9 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3325  Thioredoxin domain protein  30.23 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000131659 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  32.1 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0425  thioredoxin domain-containing protein  29.63 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_56471  thioredoxin h  33.73 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3151  thioredoxin  26.26 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  31.76 
 
 		 406 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  30.86 
 
 		 104 aa  57  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3070  thioredoxin  36.25 
 
 		 105 aa  57  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.990711  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  33.78 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  37.33 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf029  thioredoxin family member  33.33 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0737  thioredoxin  36.36 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942767  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  32.95 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4281  thioredoxin  27.27 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  28.92 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04200  thioredoxin (allergen cop c 2), putative  35.71 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  31.91 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  34.15 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  31.25 
 
 		 280 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  32.95 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  31.76 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  31.4 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  28.09 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0861  Thioredoxin domain  34.94 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  32.94 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3729  thioredoxin  32.95 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.350169  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  31.25 
 
 		 281 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  31.76 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  32.94 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  32.94 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  32.94 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  31.76 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  32.94 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1793  thioredoxin  34.62 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99578  decreased coverage  0.00274383 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  32.94 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  32.5 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  27.36 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A34  Thiol-disulfide isomerase  32.88 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0201899  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  32.94 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0818  thioredoxin  36.49 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2116  thioredoxin domain-containing protein  31.25 
 
 		 102 aa  53.5  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  34.18 
 
 		 269 aa  53.5  0.0000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  35.14 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  31.58 
 
 		 108 aa  52.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  32 
 
 		 107 aa  52.8  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0835  thioredoxin  28.75 
 
 		 102 aa  53.5  0.000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  32.93 
 
 		 106 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>