More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_4525 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_4525  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 
104 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142753  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4444  thioredoxin  98.08 
 
 
104 aa  209  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201921  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4589  thioredoxin family protein  97.12 
 
 
104 aa  208  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000336383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4426  thioredoxin  97.12 
 
 
104 aa  208  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4945  thioredoxin family protein  97.12 
 
 
104 aa  208  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4811  thioredoxin family protein  97.12 
 
 
104 aa  208  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4806  thioredoxin family protein  97.12 
 
 
104 aa  208  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.707229  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0430  thioredoxin family protein  97.12 
 
 
104 aa  208  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4827  thioredoxin family protein  97.12 
 
 
104 aa  208  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0619703  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4836  thioredoxin family protein  96.15 
 
 
104 aa  206  9e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3355  thioredoxin domain-containing protein  89.42 
 
 
104 aa  197  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2743  Thioredoxin domain protein  53.4 
 
 
104 aa  140  8e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127191  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1252  thioredoxin domain-containing protein  53.77 
 
 
106 aa  129  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000389642  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1437  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  52.58 
 
 
109 aa  121  3e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00152159  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1304  thioredoxin, putative  49 
 
 
103 aa  110  6e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000360749  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1834  thioredoxin domain-containing protein  50 
 
 
103 aa  110  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.339161  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1799  thioredoxin domain-containing protein  50 
 
 
103 aa  110  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1825  thioredoxin  47.06 
 
 
104 aa  108  3e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000186182  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0177  thioredoxin family protein  50 
 
 
107 aa  104  5e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.366705  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0435  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  46.53 
 
 
105 aa  98.6  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0885  Thioredoxin domain protein  39.22 
 
 
106 aa  89.7  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2419  thioredoxin family protein  38.83 
 
 
104 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0483  thioredoxin, putative  35.64 
 
 
107 aa  83.2  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2344  thioredoxin family protein  38.83 
 
 
104 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.397592  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2090  thioredoxin  38.83 
 
 
104 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2128  thioredoxin domain-containing protein  38.83 
 
 
104 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.831253  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2293  thioredoxin  37.86 
 
 
104 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3031  thioredoxin  37.86 
 
 
104 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0830  thioredoxin domain-containing protein  35.64 
 
 
106 aa  82  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0432193  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0847  thioredoxin domain-containing protein  35.64 
 
 
106 aa  82  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00144466  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0794  Thioredoxin domain protein  36.54 
 
 
106 aa  82  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2336  thioredoxin family protein  37.86 
 
 
104 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2094  thioredoxin  37.86 
 
 
104 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000532276  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1701  thioredoxin domain-containing protein  36.89 
 
 
104 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2156  thioredoxin family protein  36.89 
 
 
104 aa  77  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2311  thioredoxin family protein  36.89 
 
 
104 aa  77  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1660  Thioredoxin domain protein  32.69 
 
 
106 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1807  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  34.57 
 
 
108 aa  62.8  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.132216  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31720  thioredoxin o  30 
 
 
133 aa  60.5  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.998916  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26095  predicted protein  29.67 
 
 
105 aa  57.8  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00850949 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1129  thioredoxin  34.15 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_56521  predicted protein  24.51 
 
 
169 aa  57.4  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  30.49 
 
 
106 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0205  thioredoxin, putative  34.12 
 
 
108 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.513083  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  30.77 
 
 
108 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  30.77 
 
 
108 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0261  thioredoxin, putative  34.12 
 
 
108 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689046 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  30.77 
 
 
108 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1625  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  28.92 
 
 
110 aa  54.3  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000722607  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_56471  thioredoxin h  29.91 
 
 
105 aa  53.9  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3151  thioredoxin  26.58 
 
 
113 aa  53.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04200  thioredoxin (allergen cop c 2), putative  30.86 
 
 
104 aa  53.5  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0425  thioredoxin domain-containing protein  29.41 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  32.61 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  28.57 
 
 
108 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2976  thioredoxin domain-containing protein  31.52 
 
 
133 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187129  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  31.08 
 
 
98 aa  52  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  31.58 
 
 
110 aa  51.2  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  32.22 
 
 
102 aa  51.6  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  30.49 
 
 
108 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0210  thioredoxin  38.57 
 
 
108 aa  51.2  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  33.33 
 
 
165 aa  51.2  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  28.05 
 
 
108 aa  50.8  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0460  thioredoxin  32.97 
 
 
108 aa  50.8  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.810082  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  30.49 
 
 
108 aa  50.4  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  34.85 
 
 
88 aa  50.8  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0694  thioredoxin  34.62 
 
 
106 aa  50.4  0.000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  30.49 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0813  thioredoxin  31.88 
 
 
109 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146615  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  30.49 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3325  Thioredoxin domain protein  26.14 
 
 
176 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000131659 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  29.67 
 
 
109 aa  49.7  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  30.49 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  30.49 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  29.7 
 
 
105 aa  49.7  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  30.49 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  31.87 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  30.49 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00170  Thioredoxin (Trx) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P29429]  27.27 
 
 
189 aa  49.7  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145032  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0818  thioredoxin  32.05 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  28.57 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  30.49 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  27.78 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  29.27 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4281  thioredoxin  27.27 
 
 
104 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  31.87 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  29.27 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  29.27 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37753  predicted protein  27.47 
 
 
101 aa  48.9  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0200499  hitchhiker  0.00126408 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  31.87 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  29.27 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  29.27 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  31.87 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  31.87 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  29.27 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  31.71 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  29.27 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  29.27 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  31.87 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  29.27 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>