More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2116 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2116  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 102 aa  206  6e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06230  thioredoxin  64.36 
 
 		 104 aa  140  7e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4265  Thioredoxin domain protein  67.33 
 
 		 103 aa  139  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0770  Thioredoxin domain protein  56 
 
 		 103 aa  118  3e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_56471  thioredoxin h  38.1 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  35.44 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  30.61 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0435  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  34.62 
 
 		 105 aa  62  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  33.72 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21270  thioredoxin  33.75 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.724232  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  35.44 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_56521  predicted protein  32.53 
 
 		 169 aa  60.5  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  34.62 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04200  thioredoxin (allergen cop c 2), putative  35.05 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0207  thioredoxin  33.33 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4107  thioredoxin  31.76 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794835 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2647  thioredoxin  34.57 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  29.63 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  35.44 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26095  predicted protein  32.61 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00850949 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46280  thioredoxin f  32.95 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.767302  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1789  thioredoxin  33.73 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37753  predicted protein  37.1 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0200499  hitchhiker  0.00126408 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1214  thioredoxin  31.33 
 
 		 121 aa  57  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0537365 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  34.94 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  32.43 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  31.71 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4260  thioredoxin  34.94 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  31.25 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_9576  predicted protein  35.96 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  33.33 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  39.71 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  33.77 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  38.57 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24970  thioredoxin  32.5 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1362  thioredoxin  34.12 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7798  thioredoxin  34.62 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0265  thioredoxin  38.89 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.28448  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0044  thioredoxin  30.95 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2401  thioredoxin  31.4 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.85345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  34.25 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  34.25 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  34.67 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  32.88 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  30.99 
 
 		 106 aa  53.5  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2066  thioredoxin  30.12 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0918718  normal  0.219337 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1825  thioredoxin  28.87 
 
 		 104 aa  53.5  0.0000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000186182  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3837  thioredoxin  30.86 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1252  thioredoxin domain-containing protein  31.25 
 
 		 106 aa  53.5  0.0000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000389642  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  33.33 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  33.33 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl178  thioredoxin  34.29 
 
 		 102 aa  52.8  0.000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  30.86 
 
 		 112 aa  52.8  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  32.5 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  34.41 
 
 		 287 aa  53.1  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  33.33 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1614  thioredoxin  26.83 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  33.33 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  29.73 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  34.94 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  34.94 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  28.42 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4857  thioredoxin  36.25 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0651815  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2305  thioredoxin  31.17 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.0025384  normal  0.350799 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  34.94 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  34.94 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  35.06 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  30.38 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  34.94 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1254  thioredoxin  30.86 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  34.94 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2444  thioredoxin  33.75 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  32.93 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2481  thioredoxin  33.75 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.555436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2011  thioredoxin domain-containing protein  32.94 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  34.94 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  34.94 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  34.94 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2489  thioredoxin  33.75 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_56519  predicted protein  41.27 
 
 		 700 aa  52  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.532885  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2236  thioredoxin  32.1 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.773662  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  30.77 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  28.4 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  30.93 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1437  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  28.72 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00152159  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00075  protein disulfide-isomerase (Eurofung)  28.43 
 
 		 368 aa  51.6  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  27.18 
 
 		 140 aa  51.2  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1430  thioredoxin  37.5 
 
 		 140 aa  51.2  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000656365 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2347  thioredoxin  30.23 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0135047  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1065  thioredoxin  30.86 
 
 		 123 aa  51.2  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  35 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1950  thioredoxin domain-containing protein  29.07 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.354322  normal  0.113287 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  40 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  30.84 
 
 		 107 aa  51.2  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26335  predicted protein  38.1 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31720  thioredoxin o  27.06 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.998916  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  29.33 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  33.73 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0582  thioredoxin-related  28 
 
 		 109 aa  50.8  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.271348  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0405  thioredoxin  39.71 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.497639 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>