More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1807 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1807  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  100 
 
 		 108 aa  229  8.000000000000001e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.132216  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1625  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  60.19 
 
 		 110 aa  161  3e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000722607  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1252  thioredoxin domain-containing protein  40.23 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000389642  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1437  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  36.56 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00152159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2743  Thioredoxin domain protein  34.41 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127191  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0177  thioredoxin family protein  37.63 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.366705  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0435  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  37.76 
 
 		 105 aa  70.9  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3355  thioredoxin domain-containing protein  40.62 
 
 		 104 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4444  thioredoxin  34.38 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201921  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4827  thioredoxin family protein  34.38 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0619703  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  36.25 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4525  thioredoxin domain-containing protein  34.57 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142753  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4836  thioredoxin family protein  34.38 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4806  thioredoxin family protein  34.57 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.707229  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4589  thioredoxin family protein  34.57 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000336383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4426  thioredoxin  34.57 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  35.14 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4811  thioredoxin family protein  34.57 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0430  thioredoxin family protein  34.57 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4945  thioredoxin family protein  34.57 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0794  Thioredoxin domain protein  30 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1825  thioredoxin  31.96 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000186182  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0483  thioredoxin, putative  34.62 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00170  Thioredoxin (Trx) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P29429]  34.88 
 
 		 189 aa  60.5  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0737  thioredoxin  31.96 
 
 		 104 aa  60.1  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942767  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3070  thioredoxin  33.73 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.990711  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0205  thioredoxin, putative  27.85 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.513083  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0261  thioredoxin, putative  27.85 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689046 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0830  thioredoxin domain-containing protein  28.71 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0432193  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2401  thioredoxin  29.89 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.85345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  28.74 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  34.15 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0847  thioredoxin domain-containing protein  28.71 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00144466  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  32.95 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  33.75 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1304  thioredoxin, putative  33.73 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000360749  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1660  Thioredoxin domain protein  29.29 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  38.71 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  36.76 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5119  thioredoxin  32.91 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  32.43 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  32.18 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1721  thioredoxin domain protein  36.36 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0189  thioredoxin 1  30.49 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.345183  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0397  thioredoxin  31.65 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0087  thioredoxin  31.07 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.950509 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  35.53 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  35.53 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5069  thioredoxin  32.91 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  35.53 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  35.53 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  32.05 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  33.75 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  36 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  35.53 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  29.81 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  35.53 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  37.7 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  35.53 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  35.53 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  35.53 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  35.53 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  35.53 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  35.53 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  37.7 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2639  thioredoxin  29.29 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0886828  hitchhiker  0.00590655 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  35.53 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  35.53 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  31.33 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  35.53 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  31 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  35.48 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  27.84 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  32.26 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  32.26 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  32.35 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  34.15 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  34.21 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  31.82 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  31.03 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  31.65 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  31.03 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4905  thioredoxin  32.5 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4942  thioredoxin  31.65 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  29.9 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  34.15 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  31.65 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3723  thioredoxin  28.4 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.122043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0218  thioredoxin  29.03 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0589  thioredoxin domain-containing protein  35.42 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  35.48 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  33.87 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  32.26 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0147  thioredoxin 1  31.87 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0885  Thioredoxin domain protein  30.56 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  32.81 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  35.48 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  32.89 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  38.6 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  30.65 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>