More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_2344 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_2344  thioredoxin family protein  100 
 
 
104 aa  216  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.397592  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2090  thioredoxin  100 
 
 
104 aa  216  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2419  thioredoxin family protein  100 
 
 
104 aa  216  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2128  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 
104 aa  216  7.999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.831253  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2293  thioredoxin  99.04 
 
 
104 aa  215  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3031  thioredoxin  99.04 
 
 
104 aa  215  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2094  thioredoxin  97.12 
 
 
104 aa  213  9e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000532276  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2336  thioredoxin family protein  97.12 
 
 
104 aa  213  9e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1701  thioredoxin domain-containing protein  96.15 
 
 
104 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2156  thioredoxin family protein  96.15 
 
 
104 aa  209  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2311  thioredoxin family protein  96.15 
 
 
104 aa  209  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0794  Thioredoxin domain protein  59.22 
 
 
106 aa  153  9e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1660  Thioredoxin domain protein  49.51 
 
 
106 aa  134  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0830  thioredoxin domain-containing protein  54.46 
 
 
106 aa  127  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0432193  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0847  thioredoxin domain-containing protein  54.46 
 
 
106 aa  127  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00144466  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0483  thioredoxin, putative  50.5 
 
 
107 aa  120  5e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0885  Thioredoxin domain protein  40.78 
 
 
106 aa  96.7  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4525  thioredoxin domain-containing protein  38.83 
 
 
104 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142753  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4444  thioredoxin  37.86 
 
 
104 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201921  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4589  thioredoxin family protein  37.86 
 
 
104 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000336383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4426  thioredoxin  37.86 
 
 
104 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4945  thioredoxin family protein  37.86 
 
 
104 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0430  thioredoxin family protein  37.86 
 
 
104 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4806  thioredoxin family protein  37.86 
 
 
104 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.707229  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4811  thioredoxin family protein  37.86 
 
 
104 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4827  thioredoxin family protein  36.89 
 
 
104 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0619703  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4836  thioredoxin family protein  35.92 
 
 
104 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3355  thioredoxin domain-containing protein  35.92 
 
 
104 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1437  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  37.14 
 
 
109 aa  78.6  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00152159  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1799  thioredoxin domain-containing protein  36.54 
 
 
103 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1834  thioredoxin domain-containing protein  36.54 
 
 
103 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.339161  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2743  Thioredoxin domain protein  30.1 
 
 
104 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2323  hypothetical protein  97.14 
 
 
45 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.151752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2168  hypothetical protein  97.14 
 
 
36 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78012  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0177  thioredoxin family protein  34.38 
 
 
107 aa  72.8  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.366705  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1825  thioredoxin  35.92 
 
 
104 aa  71.2  0.000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000186182  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1252  thioredoxin domain-containing protein  39.02 
 
 
106 aa  70.9  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000389642  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2429  thioredoxin  32.26 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  38.3 
 
 
102 aa  65.9  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  30.77 
 
 
102 aa  64.3  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5761  thioredoxin  29.35 
 
 
111 aa  63.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.626635  normal  0.389703 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  38.71 
 
 
108 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0811  thioredoxin  32.32 
 
 
105 aa  63.2  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1304  thioredoxin, putative  26.92 
 
 
103 aa  62.8  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000360749  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  34.94 
 
 
102 aa  62.8  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  32.26 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  31.25 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  35.96 
 
 
107 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0189  thioredoxin 1  33.66 
 
 
108 aa  61.6  0.000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.345183  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  30.95 
 
 
107 aa  61.6  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26095  predicted protein  32.22 
 
 
105 aa  61.2  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00850949 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  32.26 
 
 
112 aa  60.8  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  32.14 
 
 
107 aa  60.8  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  34.88 
 
 
108 aa  60.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  30.85 
 
 
123 aa  60.5  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  27.17 
 
 
109 aa  60.1  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  29.76 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  29.76 
 
 
124 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  34.94 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  30.12 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  29.47 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  25.26 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  30.12 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  37.63 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  30.12 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  32.26 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  34.78 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  29.59 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  29.76 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0460  thioredoxin  35.48 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.810082  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  28.71 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  32.61 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0205  thioredoxin, putative  28.16 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.513083  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  28.92 
 
 
107 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  30.95 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  28.92 
 
 
107 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0261  thioredoxin, putative  28.16 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689046 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  29 
 
 
107 aa  58.9  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08571  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10300)  33.78 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321852  hitchhiker  0.00174715 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  26.67 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  26.67 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  26.67 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  26.67 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  36.56 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  26.67 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  30.11 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  26.67 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  26.67 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  30.49 
 
 
108 aa  57.8  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  32.18 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  28.28 
 
 
146 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  32.14 
 
 
109 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39568  thioredoxin  27.96 
 
 
103 aa  57.8  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.187057 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  28.92 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  34.41 
 
 
108 aa  57.8  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  32.56 
 
 
108 aa  57.8  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  27.78 
 
 
107 aa  57.8  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  34.41 
 
 
108 aa  57.4  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  27.52 
 
 
108 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  27.52 
 
 
108 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>