More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1660 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1660  Thioredoxin domain protein  100 
 
 
106 aa  224  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0794  Thioredoxin domain protein  79.81 
 
 
106 aa  186  9e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2293  thioredoxin  50.49 
 
 
104 aa  135  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3031  thioredoxin  50.49 
 
 
104 aa  135  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2344  thioredoxin family protein  49.51 
 
 
104 aa  134  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.397592  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2090  thioredoxin  49.51 
 
 
104 aa  134  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2128  thioredoxin domain-containing protein  49.51 
 
 
104 aa  134  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.831253  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1701  thioredoxin domain-containing protein  50.49 
 
 
104 aa  134  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2419  thioredoxin family protein  49.51 
 
 
104 aa  134  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2094  thioredoxin  48.54 
 
 
104 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000532276  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2336  thioredoxin family protein  48.54 
 
 
104 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0483  thioredoxin, putative  52.48 
 
 
107 aa  127  3e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2156  thioredoxin family protein  47.57 
 
 
104 aa  128  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2311  thioredoxin family protein  47.57 
 
 
104 aa  128  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0847  thioredoxin domain-containing protein  50.5 
 
 
106 aa  120  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00144466  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0830  thioredoxin domain-containing protein  50.5 
 
 
106 aa  120  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0432193  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0885  Thioredoxin domain protein  40.2 
 
 
106 aa  92.8  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2743  Thioredoxin domain protein  41.35 
 
 
104 aa  89.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127191  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1437  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  39.39 
 
 
109 aa  80.5  0.000000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00152159  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3355  thioredoxin domain-containing protein  34.62 
 
 
104 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4827  thioredoxin family protein  33.65 
 
 
104 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0619703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0430  thioredoxin family protein  32.69 
 
 
104 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4836  thioredoxin family protein  33.65 
 
 
104 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4589  thioredoxin family protein  32.69 
 
 
104 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000336383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4426  thioredoxin  32.69 
 
 
104 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4444  thioredoxin  32.69 
 
 
104 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201921  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4945  thioredoxin family protein  32.69 
 
 
104 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4811  thioredoxin family protein  32.69 
 
 
104 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4806  thioredoxin family protein  32.69 
 
 
104 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.707229  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4525  thioredoxin domain-containing protein  32.69 
 
 
104 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142753  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1252  thioredoxin domain-containing protein  37.11 
 
 
106 aa  75.1  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000389642  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1834  thioredoxin domain-containing protein  31.68 
 
 
103 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.339161  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1799  thioredoxin domain-containing protein  31.68 
 
 
103 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0177  thioredoxin family protein  30 
 
 
107 aa  68.9  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.366705  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0811  thioredoxin  33.66 
 
 
105 aa  63.9  0.0000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26095  predicted protein  27.78 
 
 
105 aa  64.3  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00850949 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1825  thioredoxin  28.87 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000186182  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1304  thioredoxin, putative  29.7 
 
 
103 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000360749  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0205  thioredoxin, putative  29.81 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.513083  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0694  thioredoxin  40.91 
 
 
106 aa  62.4  0.000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0261  thioredoxin, putative  29.81 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689046 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  32.53 
 
 
102 aa  62.4  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0435  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  31.31 
 
 
105 aa  62.8  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  28.05 
 
 
109 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3746  thioredoxin 2  28.89 
 
 
139 aa  60.5  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426418  normal  0.35545 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  32.1 
 
 
102 aa  60.5  0.000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_9748  predicted protein  28.57 
 
 
108 aa  60.5  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.82657  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01200  thioredoxin (trx), putative  32.89 
 
 
138 aa  60.5  0.000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0954839  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  27.06 
 
 
102 aa  60.5  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  35.23 
 
 
104 aa  59.3  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  33.73 
 
 
111 aa  58.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  32.61 
 
 
109 aa  59.3  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  32.58 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1625  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  28 
 
 
110 aa  59.3  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000722607  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  30.85 
 
 
110 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  31 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1807  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  29.29 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.132216  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  34.18 
 
 
104 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl178  thioredoxin  35.37 
 
 
102 aa  58.2  0.00000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  31.73 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  31.73 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  31.73 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  38.67 
 
 
105 aa  58.2  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  31.73 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  31.11 
 
 
141 aa  57.8  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  31.73 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  31.73 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  31.73 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  32.91 
 
 
104 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0690  thioredoxin 2  32.61 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.555698  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  32.91 
 
 
104 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  28.95 
 
 
109 aa  57.8  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1016  thioredoxin domain-containing protein  35.23 
 
 
105 aa  57.8  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  25.74 
 
 
135 aa  57.4  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  32.1 
 
 
150 aa  57.4  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0776  thioredoxin  28.57 
 
 
138 aa  57.4  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.116689 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  30.77 
 
 
108 aa  57  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  30.77 
 
 
108 aa  57  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  33.75 
 
 
112 aa  57.4  0.00000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  30.77 
 
 
108 aa  57  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  30.77 
 
 
108 aa  57  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2429  thioredoxin  28.89 
 
 
107 aa  57.4  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  33.75 
 
 
112 aa  57.4  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  31.4 
 
 
108 aa  57.4  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  30.77 
 
 
108 aa  57  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  30.34 
 
 
108 aa  57  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  30.77 
 
 
108 aa  57  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0265  thioredoxin  34.41 
 
 
110 aa  57  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.28448  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  30.77 
 
 
146 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  31.03 
 
 
107 aa  57  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  27.78 
 
 
141 aa  57  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  30 
 
 
107 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  30.43 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  30.77 
 
 
146 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39568  thioredoxin  22.22 
 
 
103 aa  56.2  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.187057 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0308  thioredoxin  31.73 
 
 
108 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717076  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  28.24 
 
 
238 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  31.48 
 
 
286 aa  55.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05698  thioredoxin 2  26.97 
 
 
162 aa  55.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  29.76 
 
 
107 aa  55.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>