More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1625 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1625  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  100 
 
 
110 aa  231  4.0000000000000004e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000722607  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1807  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  60.19 
 
 
108 aa  161  3e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.132216  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1252  thioredoxin domain-containing protein  35.79 
 
 
106 aa  72  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000389642  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1437  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  34.41 
 
 
109 aa  70.9  0.000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00152159  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2743  Thioredoxin domain protein  31.18 
 
 
104 aa  65.5  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127191  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0794  Thioredoxin domain protein  27.45 
 
 
106 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00170  Thioredoxin (Trx) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P29429]  36.05 
 
 
189 aa  60.8  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145032  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0435  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  30.77 
 
 
105 aa  60.8  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0483  thioredoxin, putative  33.33 
 
 
107 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1660  Thioredoxin domain protein  28 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3355  thioredoxin domain-containing protein  33.75 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0177  thioredoxin family protein  28.57 
 
 
107 aa  57.8  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.366705  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  37.1 
 
 
119 aa  58.2  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4260  thioredoxin  33.33 
 
 
109 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  32.88 
 
 
98 aa  57.4  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  34.78 
 
 
119 aa  57.4  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1825  thioredoxin  26.8 
 
 
104 aa  57.4  0.00000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000186182  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  32.93 
 
 
120 aa  55.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  34.38 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0397  thioredoxin  28.97 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0205  thioredoxin, putative  26.25 
 
 
108 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.513083  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0261  thioredoxin, putative  26.25 
 
 
108 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689046 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0087  thioredoxin  31.91 
 
 
106 aa  55.5  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  35.48 
 
 
406 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3070  thioredoxin  33.82 
 
 
105 aa  54.7  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.990711  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4589  thioredoxin family protein  28.92 
 
 
104 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000336383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4426  thioredoxin  28.92 
 
 
104 aa  54.3  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4444  thioredoxin  28.92 
 
 
104 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0430  thioredoxin family protein  28.92 
 
 
104 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4525  thioredoxin domain-containing protein  28.92 
 
 
104 aa  54.3  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142753  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4827  thioredoxin family protein  28.92 
 
 
104 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0619703  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4945  thioredoxin family protein  28.92 
 
 
104 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4806  thioredoxin family protein  28.92 
 
 
104 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.707229  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5119  thioredoxin  31.65 
 
 
144 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402757  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4811  thioredoxin family protein  28.92 
 
 
104 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  29.9 
 
 
107 aa  53.9  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  33.01 
 
 
107 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2336  thioredoxin family protein  24.51 
 
 
104 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2094  thioredoxin  24.51 
 
 
104 aa  53.9  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000532276  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2293  thioredoxin  24.51 
 
 
104 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3031  thioredoxin  24.51 
 
 
104 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  33.33 
 
 
106 aa  53.5  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1701  thioredoxin domain-containing protein  24.51 
 
 
104 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5069  thioredoxin  30.38 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  30.67 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  34.62 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  34.78 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2429  thioredoxin  32.43 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  34.62 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2698  thioredoxin  31.96 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0171911  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  28.43 
 
 
238 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  32.58 
 
 
104 aa  53.1  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0847  thioredoxin domain-containing protein  23.76 
 
 
106 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00144466  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1304  thioredoxin, putative  34.94 
 
 
103 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000360749  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  32.89 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  31.71 
 
 
107 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2344  thioredoxin family protein  23.53 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.397592  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4836  thioredoxin family protein  27.71 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3396  putative thioredoxin  26.83 
 
 
104 aa  52.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.950013  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2419  thioredoxin family protein  23.53 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0147  thioredoxin 1  32.99 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2090  thioredoxin  23.53 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2128  thioredoxin domain-containing protein  23.53 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.831253  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4942  thioredoxin  30.77 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0830  thioredoxin domain-containing protein  23.76 
 
 
106 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0432193  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  28.16 
 
 
107 aa  52  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  34.78 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00337  thioredoxin  32.99 
 
 
108 aa  52  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  23 
 
 
109 aa  52  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  29.49 
 
 
107 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0443  thioredoxin-like  27.85 
 
 
144 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.478708  normal  0.838572 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1823  thioredoxin  38.6 
 
 
105 aa  52  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4222  thioredoxin  35.06 
 
 
108 aa  51.6  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0161465  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002097  thioredoxin  32.99 
 
 
108 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00313258  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  27.27 
 
 
107 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  28.28 
 
 
109 aa  51.6  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  34.62 
 
 
109 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  34.62 
 
 
109 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  34.62 
 
 
109 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  34.62 
 
 
109 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  34.62 
 
 
109 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  34.62 
 
 
109 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  34.62 
 
 
109 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  34.62 
 
 
109 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  34.62 
 
 
109 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  34.62 
 
 
109 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  34.62 
 
 
109 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  34.62 
 
 
109 aa  51.2  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  34.62 
 
 
109 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  34.62 
 
 
109 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  33.72 
 
 
109 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  34.62 
 
 
109 aa  51.2  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  28.92 
 
 
107 aa  51.2  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1411  thioredoxin  36.67 
 
 
107 aa  51.2  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  33.33 
 
 
108 aa  51.2  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08571  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10300)  32.88 
 
 
108 aa  50.8  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321852  hitchhiker  0.00174715 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  32.1 
 
 
108 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  36.84 
 
 
108 aa  50.8  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  32.1 
 
 
108 aa  50.8  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  32.1 
 
 
108 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>