More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1825 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1825  thioredoxin  100 
 
 
104 aa  219  9e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000186182  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0177  thioredoxin family protein  76.24 
 
 
107 aa  169  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.366705  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0435  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  61.17 
 
 
105 aa  135  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1252  thioredoxin domain-containing protein  58.43 
 
 
106 aa  116  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000389642  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1437  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  49.51 
 
 
109 aa  112  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00152159  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2743  Thioredoxin domain protein  49.02 
 
 
104 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127191  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3355  thioredoxin domain-containing protein  47.06 
 
 
104 aa  110  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4525  thioredoxin domain-containing protein  47.06 
 
 
104 aa  108  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142753  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4589  thioredoxin family protein  46.08 
 
 
104 aa  107  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000336383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4426  thioredoxin  46.08 
 
 
104 aa  107  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4444  thioredoxin  46.08 
 
 
104 aa  107  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201921  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4945  thioredoxin family protein  46.08 
 
 
104 aa  107  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4806  thioredoxin family protein  46.08 
 
 
104 aa  107  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.707229  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0430  thioredoxin family protein  46.08 
 
 
104 aa  107  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4811  thioredoxin family protein  46.08 
 
 
104 aa  107  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4827  thioredoxin family protein  45.1 
 
 
104 aa  106  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0619703  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4836  thioredoxin family protein  45.1 
 
 
104 aa  105  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1834  thioredoxin domain-containing protein  51.85 
 
 
103 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.339161  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1799  thioredoxin domain-containing protein  51.85 
 
 
103 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1304  thioredoxin, putative  43.21 
 
 
103 aa  82  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000360749  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0885  Thioredoxin domain protein  43.53 
 
 
106 aa  75.5  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2344  thioredoxin family protein  35.92 
 
 
104 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.397592  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2090  thioredoxin  35.92 
 
 
104 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2419  thioredoxin family protein  35.92 
 
 
104 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2128  thioredoxin domain-containing protein  35.92 
 
 
104 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.831253  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2293  thioredoxin  35.92 
 
 
104 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3031  thioredoxin  35.92 
 
 
104 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2336  thioredoxin family protein  35.92 
 
 
104 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2094  thioredoxin  35.92 
 
 
104 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000532276  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1701  thioredoxin domain-containing protein  35.92 
 
 
104 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0794  Thioredoxin domain protein  30.93 
 
 
106 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2156  thioredoxin family protein  34.95 
 
 
104 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2311  thioredoxin family protein  34.95 
 
 
104 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1660  Thioredoxin domain protein  28.87 
 
 
106 aa  63.9  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  32.22 
 
 
106 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1807  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  31.96 
 
 
108 aa  61.6  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.132216  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0483  thioredoxin, putative  31.91 
 
 
107 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0830  thioredoxin domain-containing protein  31.96 
 
 
106 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0432193  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0847  thioredoxin domain-containing protein  31.96 
 
 
106 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00144466  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5761  thioredoxin  31.03 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.626635  normal  0.389703 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  31.58 
 
 
146 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3003  hypothetical protein  29.67 
 
 
108 aa  57.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2864  hypothetical protein  29.67 
 
 
108 aa  57.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  31.58 
 
 
108 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  31.58 
 
 
108 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  31.58 
 
 
108 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  31.58 
 
 
108 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  31.58 
 
 
108 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  31.58 
 
 
108 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  31.58 
 
 
108 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  35.53 
 
 
110 aa  57.8  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1625  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  26.8 
 
 
110 aa  57.4  0.00000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000722607  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  35.9 
 
 
108 aa  57  0.00000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  30.53 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  30.53 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  30.53 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  30.53 
 
 
146 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  30.53 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  30 
 
 
127 aa  56.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  30.85 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  30.53 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  30.53 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26095  predicted protein  31.33 
 
 
105 aa  56.2  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00850949 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  29.79 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  29.79 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2296  thioredoxin  33.77 
 
 
103 aa  55.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  29.79 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  29.59 
 
 
108 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  29.47 
 
 
108 aa  55.1  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  29.9 
 
 
108 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4688  thioredoxin  30.85 
 
 
108 aa  55.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376387  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  32.05 
 
 
108 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  31.71 
 
 
112 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  28.42 
 
 
108 aa  54.7  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0205  thioredoxin, putative  33.33 
 
 
108 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.513083  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0261  thioredoxin, putative  33.33 
 
 
108 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689046 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0210  thioredoxin  32.5 
 
 
108 aa  54.3  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  28.57 
 
 
108 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  28.57 
 
 
108 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4281  thioredoxin  28.57 
 
 
104 aa  53.5  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2116  thioredoxin domain-containing protein  28.87 
 
 
102 aa  53.5  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  35.53 
 
 
108 aa  53.5  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  28.42 
 
 
111 aa  53.5  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3949  thioredoxin domain-containing protein  34.88 
 
 
178 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2158  thioredoxin  31.71 
 
 
105 aa  53.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  31.91 
 
 
113 aa  52.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  32.14 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0811  thioredoxin  28.42 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4106  hypothetical protein  30.49 
 
 
179 aa  52  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.475572  normal  0.0367818 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28263  thioredoxin  32.56 
 
 
338 aa  52.8  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.135642  normal  0.918036 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0739  thioredoxin  28.57 
 
 
104 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.186683  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  36.84 
 
 
122 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  28.57 
 
 
107 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1144  thioredoxin  29.21 
 
 
421 aa  51.2  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0517  hypothetical protein  30.86 
 
 
178 aa  51.6  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.13815 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  28.72 
 
 
165 aa  51.6  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  30.38 
 
 
107 aa  50.8  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  29.11 
 
 
108 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  32.22 
 
 
112 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  34.33 
 
 
130 aa  50.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>